seq1 = pF1KSDA0282.tfa, 1992 bp
seq2 = pF1KSDA0282/gi568815584r_50879480.tfa (gi568815584r:50879480_51194939), 315460 bp

>pF1KSDA0282 1992
>gi568815584r:50879480_51194939 (Chr14)

(complement)

1-822  (100001-100822)   100% ->
823-918  (169580-169675)   100% ->
919-1041  (171983-172105)   100% ->
1042-1152  (184446-184556)   100% ->
1153-1306  (185707-185860)   100% ->
1307-1464  (194100-194257)   100% ->
1465-1603  (196752-196890)   100% ->
1604-1907  (212837-213140)   100% ->
1908-1992  (215391-215474)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGATGGAAGAGGAGTTGAAATGCCCCGTGTGCGGCTCCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGATGGAAGAGGAGTTGAAATGCCCCGTGTGCGGCTCCTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGGGAGCCCATCATCCTGCCCTGCTCTCACAATTTGTGTCAGGCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGGAGCCCATCATCCTGCCCTGCTCTCACAATTTGTGTCAGGCGTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGCAACATCCTGGTGCAGACCCCAGAGTCTGAATCCCCCCAGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGCAACATCCTGGTGCAGACCCCAGAGTCTGAATCCCCCCAGAGCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGCCGCGGGCTCCGGGGTCTCCGACTATGACTATCTGGACCTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGGCCGCGGGCTCCGGGGTCTCCGACTATGACTATCTGGACCTGGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGAGCCTATACAGCGAGGCGGACAGCGGCTATGGCTCCTACGGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATGAGCCTATACAGCGAGGCGGACAGCGGCTATGGCTCCTACGGGGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCCAGCGCCCCCACTACCCCGTGCCAGAAGTCCCCCAACGGCGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCCAGCGCCCCCACTACCCCGTGCCAGAAGTCCCCCAACGGCGTCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTTTCCCCCGGCTATGCCGCCACCGGCCACCCACTTGTCACCGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGTTTCCCCCGGCTATGCCGCCACCGGCCACCCACTTGTCACCGGCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCCGGTGCCCCGCAACTCCTGTATCACCTGCCCCCAGTGTCACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCCGGTGCCCCGCAACTCCTGTATCACCTGCCCCCAGTGTCACCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCTCATCCTGGATGACCGGGGGCTCCGCGGCTTCCCCAAGAATCGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCTCATCCTGGATGACCGGGGGCTCCGCGGCTTCCCCAAGAATCGCGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGAAGGGGTAATTGACCGCTACCAGCAGAGCAAAGCCGCGGCCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGAAGGGGTAATTGACCGCTACCAGCAGAGCAAAGCCGCGGCCCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGCCAGCTCTGCGAGAAGGCGCCCAAGGAAGCCACCGTCATGTGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGCCAGCTCTGCGAGAAGGCGCCCAAGGAAGCCACCGTCATGTGCGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTGCGATGTCTTCTACTGCGATCCGTGCCGCCTGCGCTGCCACCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTGCGATGTCTTCTACTGCGATCCGTGCCGCCTGCGCTGCCACCCGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGGGGCCCCTAGCCAAGCACCGCCTGGTGCCCCCGGCCCAGGGTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGGGGCCCCTAGCCAAGCACCGCCTGGTGCCCCCGGCCCAGGGTCGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGCCGGAGGCTGAGCCCACGCAAGGTCTCCACCTGCACAGACCACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGCCGGAGGCTGAGCCCACGCAAGGTCTCCACCTGCACAGACCACGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGAGAACCACAGCATGTACTGCGTGCAATGCAAGATGCCCGTGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGAGAACCACAGCATGTACTGCGTGCAATGCAAGATGCCCGTGTGCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGTGCTTGGAGGAGGGCAAACACTCCAGCCACGAAGTCAAGGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGTGCTTGGAGGAGGGCAAACACTCCAGCCACGAAGTCAAGGCTCTGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCATGTGGAAACTACATAAG         AGCCAGCTCTCCCAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100801 GGCCATGTGGAAACTACATAAGGTG...CAGAGCCAGCTCTCCCAGGCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGAACGGACTGTCAGACAGGGCCAAAGAAGCCAAGGAGTTTCTGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169599 TGAACGGACTGTCAGACAGGGCCAAAGAAGCCAAGGAGTTTCTGGTACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGCGCAACATGGTCCAGCAGATCCAG         GAGAACAGTGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 169649 CTGCGCAACATGGTCCAGCAGATCCAGGTA...CAGGAGAACAGTGTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTTTGAAGCCTGTCTGGTGGCCCAATGTGATGCCCTCATCGATGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171997 GTTTGAAGCCTGTCTGGTGGCCCAATGTGATGCCCTCATCGATGCCCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACAGAAGAAAAGCCCAGCTGCTGGCCCGCGTCAACAAGGAGCATGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172047 ACAGAAGAAAAGCCCAGCTGCTGGCCCGCGTCAACAAGGAGCATGAGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGCTGAAG         GTGGTTCGAGATCAGATCTCTCACTGCACAGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 172097 AAGCTGAAGGTG...TAGGTGGTTCGAGATCAGATCTCTCACTGCACAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GAAATTGCGCCAGACCACAGGTCTCATGGAGTACTGCTTGGAGGTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184478 GAAATTGCGCCAGACCACAGGTCTCATGGAGTACTGCTTGGAGGTGATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGGAAAATGATCCTAGTGGTTTTTTGCAG         ATTTCTGACGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 184528 AGGAAAATGATCCTAGTGGTTTTTTGCAGGTA...TAGATTTCTGACGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTCATAAGAAGAGTGCACCTGACTGAGGATCAGTGGGGTAAAGGCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185719 CTCATAAGAAGAGTGCACCTGACTGAGGATCAGTGGGGTAAAGGCACACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CACTCCAAGGATGACCACGGACTTTGACTTGAGTCTGGACAACAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185769 CACTCCAAGGATGACCACGGACTTTGACTTGAGTCTGGACAACAGCCCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TGCTGCAATCCATCCACCAGCTGGATTTCGTGCAAGTGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 185819 TGCTGCAATCCATCCACCAGCTGGATTTCGTGCAAGTGAAAGGTA...TA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307  CTTCCTCTCCAGTCCCAGCAACCCCTATCCTACAGCTGGAGGAATGTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194099 GCTTCCTCTCCAGTCCCAGCAACCCCTATCCTACAGCTGGAGGAATGTTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TACCCACAACAACAGCGCTACGTTGTCCTGGAAACAGCCACCTCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194149 TACCCACAACAACAGCGCTACGTTGTCCTGGAAACAGCCACCTCTGTCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CGGTGCCCGCCGATGGATACATTCTGGAGCTGGATGATGGCAACGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194199 CGGTGCCCGCCGATGGATACATTCTGGAGCTGGATGATGGCAACGGTGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CAATTCCGG         GAGGTGTATGTGGGGAAGGAGACAATGTGCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 194249 CAATTCCGGGTC...CAGGAGGTGTATGTGGGGAAGGAGACAATGTGCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TGTGGATGGTCTTCACTTCAACAGCACATACAACGCTCGGGTCAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196784 TGTGGATGGTCTTCACTTCAACAGCACATACAACGCTCGGGTCAAGGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TCAACAAAACAGGAGTCAGCCCGTACAGCAAGACCCTGGTCCTCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196834 TCAACAAAACAGGAGTCAGCCCGTACAGCAAGACCCTGGTCCTCCAAACG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 TCTGAGG         TGGCCTGGTTTGCTTTCGACCCTGGCTCGGCGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196884 TCTGAGGGTA...CAGTGGCCTGGTTTGCTTTCGACCCTGGCTCGGCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CTCGGACATCATCCTCTCCAATGACAACCTGACAGTGACCTGTAGTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212871 CTCGGACATCATCCTCTCCAATGACAACCTGACAGTGACCTGTAGTAGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ATGATGACCGGGTGGTGCTAGGGAAGACTGGCTTCTCCAAGGGCATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212921 ATGATGACCGGGTGGTGCTAGGGAAGACTGGCTTCTCCAAGGGCATCCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TACTGGGAGCTCACGGTAGATCGCTATGACAACCACCCTGATCCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212971 TACTGGGAGCTCACGGTAGATCGCTATGACAACCACCCTGATCCTGCCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGGTGTGGCTCGCATGGACGTGATGAAGGATGTGATGTTAGGAAAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213021 TGGTGTGGCTCGCATGGACGTGATGAAGGATGTGATGTTAGGAAAAGACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 ACAAAGCTTGGGCAATGTATGTGGACAATAACCGGAGCTGGTTCATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213071 ACAAAGCTTGGGCAATGTATGTGGACAATAACCGGAGCTGGTTCATGCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AACAACTCGCACACCAACAG         AACTGAGGGAGGGATCACAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 213121 AACAACTCGCACACCAACAGGTA...CAGAACTGAGGGAGGGATCACAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AGGGGCCACAATTGGGGTCCTCCTCGACTTCAATAGAAAAAACTTGACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 215412 AGGGGCCACAATTGGGGTCCTCCTCGACTTAAATAGAAAAAACTTGACAT

   2050     .    :
   1979 TTTTTTATCAACGA
        |||||-||||||||
 215462 TTTTT ATCAACGA