seq1 = pF1KSDA0277.tfa, 1740 bp
seq2 = pF1KSDA0277/gi568815591r_22022409.tfa (gi568815591r:22022409_22293661), 271253 bp

>pF1KSDA0277 1740
>gi568815591r:22022409_22293661 (Chr7)

(complement)

1-295  (100001-100295)   99% ->
296-374  (126514-126592)   100% ->
375-519  (131121-131265)   99% ->
520-617  (133047-133144)   100% ->
618-648  (135777-135807)   100% ->
649-727  (136774-136852)   100% ->
728-877  (139058-139207)   100% ->
878-975  (143158-143255)   100% ->
976-1098  (146643-146765)   100% ->
1099-1277  (148440-148618)   100% ->
1278-1368  (153547-153637)   100% ->
1369-1419  (156679-156729)   100% ->
1420-1507  (157537-157624)   100% ->
1508-1572  (162561-162625)   100% ->
1573-1627  (168004-168058)   100% ->
1628-1740  (171141-171253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCTCCCGGCTGAGGGTCTTTGACCCTCATTTGGAGAGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCTCCCGGCTGAGGGTCTTTGACCCTCATTTGGAGAGGAAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCCGCCGCGGCGCTCTCAGACCGAGAGCTGCCCTTGCCTACCTTCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCCGCCGCGGCGCTCTCAGACCGAGAGCTGCCCTTGCCTACCTTCGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCTTATTTCAAATACATCGACGAGGAGGATGAGGACGATGAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCTTATTTCAAATACATCGACGAGGAGGATGAGGACGATGAATGGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCGTTCGCAGTCTTCCACCGAGGATGACTCAGTGGACTCTCTGCTCTC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCGCTCGCAGTCTTCCACCGAGGATGACTCAGTGGACTCTCTGCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACAGATATGTGGTGGTGTCCGGGACCCCGGAGAAGATTTTGGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGACAGATATGTGGTGGTGTCCGGGACCCCGGAGAAGATTTTGGAGCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTGAATGACTTGCACCTGGAAGAAGTCCAGGACAAAGAAACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100251 TTTTGAATGACTTGCACCTGGAAGAAGTCCAGGACAAAGAAACAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296     AGACCCTCCTGGATGACTTCCTTCTCACGTACACTGTCTTCATGAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 .CAGAGACCCTCCTGGATGACTTCCTTCTCACGTACACTGTCTTCATGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AACTGATGACTTGTGCCAGGCTCTGTTAAGGCA         CTATTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126560 AACTGATGACTTGTGCCAGGCTCTGTTAAGGCAATA...CACCTATTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTAAGAAGTATCAAGGCAAAGAGGAAAACTCAGATGTTCCGCGTAGGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 131129 CTAAGAAGTATCAAGGCAAAGAGGAAAACTCAGACGTTCCGCGTAGGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGTAAAGTCTTGCATCTTGTTTCCCAGTGGATTGCTCTGTACAAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131179 CGTAAAGTCTTGCATCTTGTTTCCCAGTGGATTGCTCTGTACAAAGACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTACCTGAAGATGAACATTCAAAAATGTTTTTAAAG         ACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 131229 GTTACCTGAAGATGAACATTCAAAAATGTTTTTAAAGGTA...CAGACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TATATAGGAATGTACTGGATGATGTTTATGAATATCCAATACTTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133051 TATATAGGAATGTACTGGATGATGTTTATGAATATCCAATACTTGAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAATTGAAAGAATTTCAAAAGATACTTGGAATGCACCGTCGTCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 133101 GAATTGAAAGAATTTCAAAAGATACTTGGAATGCACCGTCGTCAGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    618    CACTGTAGATGAATATTCACCACAAAAAAAG         AATAAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 135774 CAGCACTGTAGATGAATATTCACCACAAAAAAAGGTA...CAGAATAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCTTTTCCACCAATTCAGTCTTAAGGAGAACTGGCTCCAGCATAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136781 CCCTTTTCCACCAATTCAGTCTTAAGGAGAACTGGCTCCAGCATAGAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACTGTGACTGAAACGGAGGAAA         TTTTCTGCCACGTGTATAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136831 ACTGTGACTGAAACGGAGGAAAGTG...CAGTTTTCTGCCACGTGTATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AACAGAGCACTCCTATGTCAGTGTGAAGGCAAAAGTTTCCAGTATAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139077 AACAGAGCACTCCTATGTCAGTGTGAAGGCAAAAGTTTCCAGTATAGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGAGATCCTAAAAGTCGTGGCAGAAAAGATCCAGTATGCAGAAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139127 AAGAGATCCTAAAAGTCGTGGCAGAAAAGATCCAGTATGCAGAAGAGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGGCTCTGGTGGCCATCACATTCTCTGGGG         AAAAGCATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 139177 CTGGCTCTGGTGGCCATCACATTCTCTGGGGGTA...AAGAAAAGCATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACTTCAGCCAAATGACTTAGTCATCTCCAAATCCCTCGAGGCATCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143168 ACTTCAGCCAAATGACTTAGTCATCTCCAAATCCCTCGAGGCATCTGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAATATATGTCTACCGGAAAGACCTGGCGGACACTTTG         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 143218 GAATATATGTCTACCGGAAAGACCTGGCGGACACTTTGGTA...TAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CCATTTGCAGAAAATGAGGAATCACAGCAAAGGTCGATGAGGATTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146646 CCATTTGCAGAAAATGAGGAATCACAGCAAAGGTCGATGAGGATTTTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AATGAACACTTGGGATCTTGCTCTGGAATTAATGAATTTTGATTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146696 AATGAACACTTGGGATCTTGCTCTGGAATTAATGAATTTTGATTGGAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TATTCAATTCAATTCACGAG         CAAGAGCTGATCTACTTCACG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 146746 TATTCAATTCAATTCACGAGGTA...CAGCAAGAGCTGATCTACTTCACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTCAGCAGACAGGGAAGTGGGGAACACACTGCAAATCTCAGCCTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148461 TTCAGCAGACAGGGAAGTGGGGAACACACTGCAAATCTCAGCCTTCTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCAGAGATGCAATGAGGTCCAGCTTTGGGTGGCCACGGAGATTCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148511 CCAGAGATGCAATGAGGTCCAGCTTTGGGTGGCCACGGAGATTCTGCTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCAGCCAGCTGGGCAAGCGAGTGCAGCTGGTGAAAAAATTCATCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148561 GCAGCCAGCTGGGCAAGCGAGTGCAGCTGGTGAAAAAATTCATCAAAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCGGCTCA         CTGCAAAGCCCAGAGAAACCTGAATTCTTTCTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 148611 GCGGCTCAGTA...TAGCTGCAAAGCCCAGAGAAACCTGAATTCTTTCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGCCATTGTGATGGGTCTCAACACTGCTTCTGTCAGTCGACTGTCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153580 TGCCATTGTGATGGGTCTCAACACTGCTTCTGTCAGTCGACTGTCGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCTGGGAG         AAAATCCCTGGGAAGTTTAAGAAACTTTTCTCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 153630 CCTGGGAGGTG...TAGAAAATCCCTGGGAAGTTTAAGAAACTTTTCTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAACTTGAAAGTTTAACA         GATCCTTCCCTAAATCACAAAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 156712 GAACTTGAAAGTTTAACAGTA...CAGGATCCTTCCCTAAATCACAAAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CTACAGAGATGCATTCAAAAAGATGAAGCCACCAAAAATCCCTTTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157560 CTACAGAGATGCATTCAAAAAGATGAAGCCACCAAAAATCCCTTTCATGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCTTATTGCTTAAAG         ATGTAACATTTATTCATGAAGGAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 157610 CCTTATTGCTTAAAGGTA...CAGATGTAACATTTATTCATGAAGGAAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAAACTTTTTTGGATAATCTTGTCAATTTTGAAAAGCTG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 162587 AAAACTTTTTTGGATAATCTTGTCAATTTTGAAAAGCTGGTA...CAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TATGATCGCAGACACTGTCCGAACCCTGAGACACTGCAGGACTAACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168006 TATGATCGCAGACACTGTCCGAACCCTGAGACACTGCAGGACTAACCAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TTG         GTGACCTGTCTCCAAAAGAGCATCAAGAGTTAAAGTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168056 TTGGTG...CAGGTGACCTGTCTCCAAAAGAGCATCAAGAGTTAAAGTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TATGTTAATCACCTGTATGTCATTGACAGCCAGCAGGCTCTGTTTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171179 TATGTTAATCACCTGTATGTCATTGACAGCCAGCAGGCTCTGTTTGAGCT

   1850     .    :    .    :    .
   1716 CTCACACAGGATCGAGCCTCGGGTG
        |||||||||||||||||||||||||
 171229 CTCACACAGGATCGAGCCTCGGGTG