seq1 = pF1KSDA0174.tfa, 1092 bp
seq2 = pF1KSDA0174/gi568815579f_37691772.tfa (gi568815579f:37691772_37892866), 201095 bp

>pF1KSDA0174 1092
>gi568815579f:37691772_37892866 (Chr19)

1-1092  (100001-101097)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCTCTGGATTTAAAGCTGAGCGCTTAAGAGTGAATTTGAGATT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCTCTGGATTTAAAGCTGAGCACTTAAGAGTGAATTTGAGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCATAAATCGCCTTAAACTATTGGAG AAAAA    GAAAACGGAACT
        |||||||||||||||| |||||||||||-|||||---- ||||| |||||
 100051 AGTCATAAATCGCCTTGAACTATTGGAGGAAAAAAAAAAAAAACAGAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     96 GGCCCAGAAAGCAAGGAAGGAGATTGCTGACTATCTGGCTGCTGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCAGAAAGCAAGGAAGGAGATTGCTGACTATCTGGCTGCTGGGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146 ATGAACGAGCTCGGATCCGTGTGGAGCACATTATCCGGGAAGACTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 ATGAACGAGCTCGGATCCGTGTGGAGCACATTATCCGGGAAGACTACTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196 GTGGAGGCCATGGAGATCCTGGAGCTGTACTGTGACCTGCTGCTGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100201 GTGGAGGCCATGGAGATCCTGGAGCTGTACTGTGATCTGCTGCTGGCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246 GTTTGGCCTTATCCAGTCTATGAAGGAACTAGATTCTGGTCTGGCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTGGCCTTATCCAGTCTATGAAGGAACTAGATTCTGGTCTGGCTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296 CTGTGTCTACATTGATCTGGGCTGCTCCTCGACTCCAGTCAGAAGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTGTCTACATTGATCTGGGCTGCTCCTCGACTCCAGTCAGAAGTGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    346 GAGTTGAAAATAGTTGCTGATCAGCTCTGTGCCAAGTATAGCAAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100351 GAGTTGAAAATAGTTGCTGATCAGCTCTGTGCCAAGTATAGCAAGTAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    396 TGGCAAGCTATGTAGGACCAACCAGATTGGAACTGTGAATGACAGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCAAGCTATGTAGGACCAACCAGATTGGAACTGTGAATGACAGGCTAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446 TGCACAAGCTGAGTGTGGAAGCCCCACCCAAAATCCTGGTGGAGAGATAC
        ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100451 TGCACAATCTGAGTGTGGAAGCCCCATCCAAAATCCTGGTGGAGAGATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 CTGATTGAAATTGCAAAGAATTACAACGTACCCTATGAACCTGACTCTGT
        |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100501 CTGATTGAAATTGCGAAGAATTACAATGTACCCTATGAACCTGACTCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546 GGTCATGGCAGAAGCTCCTCCTGGGGTAGAGACAGATCTTATTGATGTTG
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGTCATGGCAGAAGCTCCTTCTGGGGTAGAGACAGATCTTATTGATGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    596 GATTCACAGATGATGTGAAGAAAGGAGGCCCTGGAAGAGGAGGGAGTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100601 GATTCACAGATGATGTGAAGAAAGGAGGCCCTGGAAGAGGAGGGGGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    646 GGCTTCACAGCACCAGTTGGTGGACCTGATGGAACGGTGCCAATGCCCAT
        || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100651 GGGTTCACAGCACCAGTTGGTGGACCTGATGGAATGGTGCCAATGCCCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    696 GCCCATGCCCATGCCATCTGCAAATACGCCTTTCTCATATCCACTGCCAA
        ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100701 GCCTATGCCCATGCTATCTGCAAATACTCCTTTCTCATATCCACTGCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    746 AGGGACCATCAGATTTCAATGGACTGCCAATGGGGACTTATCAGGCCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100751 AGGGACCATCAGATTTCAATGGACTGCCAATGGGGACTTACCAGGCCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796 CCCAATATTCATCCACCTCAGATACCAGCAACTCCCCCATCGTATGAATC
        ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100801 CCCAATATTTATCCATCTCAGATACCAGCAACTCCCCCATCATATGAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    846 TGTAGATGACATTAATGCTGATAAGAATATCTCTTCTGCACAGATTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTAGATGACATTAATGCTGATAAGAATATCTCTTCTGCACAGATTGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    896 GTCCTGGACCCAAGCCAGAAGCCTCTGCAAAGCTTCCTTCCAGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 
 100901 GTCCTGGACCCAAGCCAGAAGCCTCTGCAAAGCTTCCTTCCTGACCTGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    946 GATAACTATGACAACTTTGTCCTACCAGAGTTGCCATCTGTGCCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATAACTATGACAACTTTGTCCTACCAGAGTTGCCATCTGTGCCAGACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    996 ACTACCAACTGCATCTGCTGGTGCCAGCACCTCAGCATCTGAAGACATTG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACTACCAACTGCATTTGCTGGTGCCAGCACCTCAGCATCTGAAGACATTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1046 ACTTTGATGATCTTTCCCGGAGGTTTGAAGAGCTGAAAAAGAAAACA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
 101051 ACTTTGATGATCTTTCCCAGAGGTTTGAAGAGCTGAAAAAGAAAATA