seq1 = pF1KSDA0153.tfa, 1932 bp
seq2 = pF1KSDA0153/gi568815576r_43068011.tfa (gi568815576r:43068011_43287069), 219059 bp

>pF1KSDA0153 1932
>gi568815576r:43068011_43287069 (Chr22)

(complement)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-347  (103921-104090)   100% ->
348-546  (106130-106328)   100% ->
547-706  (107070-107229)   100% ->
707-840  (107318-107451)   100% ->
841-917  (110674-110750)   100% ->
918-1034  (112455-112571)   100% ->
1035-1229  (112667-112861)   100% ->
1230-1341  (113244-113355)   100% ->
1342-1493  (114516-114667)   100% ->
1494-1575  (115170-115251)   100% ->
1576-1644  (117502-117570)   100% ->
1645-1783  (118158-118296)   100% ->
1784-1932  (118911-119059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCGAGCGGGGTCCCGAGCGCCGGCCTGCGGAGCGTAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCGAGCGGGGTCCCGAGCGCCGGCCTGCGGAGCGTAGCAGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCAGACGCCGGAGGAGGGCGCGCAGGCCTTGGCCGAGTTCGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCAGACGCCGGAGGAGGGCGCGCAGGCCTTGGCCGAGTTCGCGGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCACGGCCCGGCGCTGCGCGCTTCGGGGGTCCCCGAACGTTACTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCACGGCCCGGCGCTGCGCGCTTCGGGGGTCCCCGAACGTTACTGGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCTCCTGCACAAGCTGGAGCACGAG         GTTTTCGACGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 CGCCTCCTGCACAAGCTGGAGCACGAGGTG...CAGGTTTTCGACGCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAGTGTTTGGGATCATGCAAGTGGAGGAGGTAGAAGAGGAGGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103935 GGAAGTGTTTGGGATCATGCAAGTGGAGGAGGTAGAAGAGGAGGAGGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGCAGCCCGGGAGGTGCGGAAGCAGCAGCCCAACCCGGGGAACGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103985 AGGCAGCCCGGGAGGTGCGGAAGCAGCAGCCCAACCCGGGGAACGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCTACAAGGTCATCGTGACCAGGGAGAGCGGGCTCCAGGCAGCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104035 TGCTACAAGGTCATCGTGACCAGGGAGAGCGGGCTCCAGGCAGCCCACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAACAG         CATCTTCCTCATCGACCACGCCTGGACGTGCCGTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104085 CAACAGGTA...CAGCATCTTCCTCATCGACCACGCCTGGACGTGCCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGAGCACGCGCGCCAGCAGCTGCAGCAGGTGCCCGGGCTGCTGCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106165 TGGAGCACGCGCGCCAGCAGCTGCAGCAGGTGCCCGGGCTGCTGCACCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGGCCAACCTGATGGGCATTGAGTTCCACGGTGAGCTGCCCAGTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106215 ATGGCCAACCTGATGGGCATTGAGTTCCACGGTGAGCTGCCCAGTACAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCTGTGGCCCTGGTGCTGGAGGAGATGTGGAAGTTCAACCAGACCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106265 GGCTGTGGCCCTGGTGCTGGAGGAGATGTGGAAGTTCAACCAGACCTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCTGGCCCATGGG         ACAGCTGAGGAGAAGATGCCGGTGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106315 AGCTGGCCCATGGGGTG...CAGACAGCTGAGGAGAAGATGCCGGTGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TATATCATGGACGAGTTCGGTTCGCGGATCCAGCACGCGGACGTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107097 TATATCATGGACGAGTTCGGTTCGCGGATCCAGCACGCGGACGTGCCCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTCGCCACGGCACCCTTCTTCTACATGCCGCAGCAGGTGGCCTACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107147 CTTCGCCACGGCACCCTTCTTCTACATGCCGCAGCAGGTGGCCTACACGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCTGTGGCCCCTGAGGGACCTGGACACTGGCG         AGGAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107197 TGCTGTGGCCCCTGAGGGACCTGGACACTGGCGGTA...CAGAGGAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACCCGAGACTTTGCCTACGGAGAGACGGACCCCCTGATCCGGAAGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107326 ACCCGAGACTTTGCCTACGGAGAGACGGACCCCCTGATCCGGAAGTGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCTGCTGCCCTGGGCCCCCACCGACATGCTGGACCTCAGCTCTTGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107376 GCTGCTGCCCTGGGCCCCCACCGACATGCTGGACCTCAGCTCTTGCACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCGAGCCGCCCGCCGAGCACTACCAG         GCCATTCTGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107426 CCGAGCCGCCCGCCGAGCACTACCAGGTG...TAGGCCATTCTGGAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACAAGGAGAAGCTGCCACTTGACATCAACCCCGTGGTGCACCCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110689 AACAAGGAGAAGCTGCCACTTGACATCAACCCCGTGGTGCACCCCCACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCACATCTTCAA         GGTCTACACGGACGTGCAGCAGGTGGCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 110739 CCACATCTTCAAGTG...CAGGGTCTACACGGACGTGCAGCAGGTGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCAGCCTCACCCACCCGCGCTTCACCCTCACCCAGAGTGAGGCGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112484 GCAGCCTCACCCACCCGCGCTTCACCCTCACCCAGAGTGAGGCGGACGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACATCCTCTTCAACTTCTCACACTTCAAGGACTACAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112534 GACATCCTCTTCAACTTCTCACACTTCAAGGACTACAGGTG...CAGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACTCAGCCAGGAGAGGCCAGGCGTGCTGCTGAACCAGTTCCCCTGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112670 ACTCAGCCAGGAGAGGCCAGGCGTGCTGCTGAACCAGTTCCCCTGCGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACCTGCTGACTGTCAAGGACTGCCTGGCCTCCATCGCGCGCCGGGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112720 ACCTGCTGACTGTCAAGGACTGCCTGGCCTCCATCGCGCGCCGGGCAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGCCCCGAGGGCCCACCCTGGCTGCCCCGAACCTTCAACCTGCGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112770 GGCCCCGAGGGCCCACCCTGGCTGCCCCGAACCTTCAACCTGCGCACTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCTGCCCCAGTTTGTCAGCTACTTCCAGCAGCGGGAAAGGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 112820 GCTGCCCCAGTTTGTCAGCTACTTCCAGCAGCGGGAAAGGTGGTA...CA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1230  GGGCGAGGACAACCACTGGATCTGCAAGCCCTGGAACCTGGCGCGCAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113243 GGGGCGAGGACAACCACTGGATCTGCAAGCCCTGGAACCTGGCGCGCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGGACACCCACGTCACCAAGAGCCTGCACAGCATCATCCGGCACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113293 CTGGACACCCACGTCACCAAGAGCCTGCACAGCATCATCCGGCACCGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAGCACCCCCAAG         GTTGTGTCCAAGTACATCGAAAGTCCCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113343 GAGCACCCCCAAGGTG...CAGGTTGTGTCCAAGTACATCGAAAGTCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGTTGTTCCTTCGAGAAGACGTGGGAAAGGTCAAGTTCGACATCCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114544 TGTTGTTCCTTCGAGAAGACGTGGGAAAGGTCAAGTTCGACATCCGCTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCGTGCTGCTGCGGTCAGTGAGGCCCCTACGGTTGTTCGTGTATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114594 ATCGTGCTGCTGCGGTCAGTGAGGCCCCTACGGTTGTTCGTGTATGATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GTTCTGGCTGCGGTTCTCCAACCG         GGCCTTTGCACTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 114644 GTTCTGGCTGCGGTTCTCCAACCGGTA...CAGGGCCTTTGCACTCAACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACCTGGATGACTACGAGAAGCACTTCACGGTCATGAACTATGACCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115187 ACCTGGATGACTACGAGAAGCACTTCACGGTCATGAACTATGACCCGGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GTGGTGCTGAAGCAG         GTGCACTGTGAAGAGTTCATCCCCGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115237 GTGGTGCTGAAGCAGGTA...CAGGTGCACTGTGAAGAGTTCATCCCCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTTTGAGAAGCAATACCCAGAATTTCCCTGGACGGACGTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 117528 GTTTGAGAAGCAATACCCAGAATTTCCCTGGACGGACGTCCAGGTA...C

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1645   GCTGAGATCTTCCGGGCCTTCACGGAGCTGTTCCAGGTGGCCTGTGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118156 AGGCTGAGATCTTCCGGGCCTTCACGGAGCTGTTCCAGGTGGCCTGTGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGCCACCACCCCTGGGCCTCTGCGACTACCCCTCATCCCGGGCCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118206 AAGCCACCACCCCTGGGCCTCTGCGACTACCCCTCATCCCGGGCCATGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGCCGTCGACCTCATGCTGAAGTGGGACAACGGCCCAGATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118256 TGCCGTCGACCTCATGCTGAAGTGGGACAACGGCCCAGATGGTA...CAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GAAGGCGGGTGATGCAGCCGCAGATCCTGGAGGTGAACTTCAACCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118911 GAAGGCGGGTGATGCAGCCGCAGATCCTGGAGGTGAACTTCAACCCCGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TGTGAGCGAGCCTGCAGGTACCACCCCACCTTCTTCAACGACGTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118961 TGTGAGCGAGCCTGCAGGTACCACCCCACCTTCTTCAACGACGTCTTCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1884 CACCTTGTTTCTGGACCAGCCCGGTGGCTGCCACGTTACCTGCCTTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119011 CACCTTGTTTCTGGACCAGCCCGGTGGCTGCCACGTTACCTGCCTTGTC