seq1 = pF1KSDA0070.tfa, 1791 bp
seq2 = pF1KSDA0070/gi568815582r_75527898.tfa (gi568815582r:75527898_75747639), 219742 bp

>pF1KSDA0070 1791
>gi568815582r:75527898_75747639 (Chr16)

(complement)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-222  (105917-106076)   100% ->
223-388  (107291-107456)   100% ->
389-482  (111093-111186)   100% ->
483-669  (111542-111728)   100% ->
670-795  (111835-111960)   100% ->
796-915  (113348-113467)   100% ->
916-1078  (115785-115947)   100% ->
1079-1252  (116051-116224)   100% ->
1253-1338  (116387-116472)   100% ->
1339-1424  (117132-117217)   100% ->
1425-1551  (118099-118225)   100% ->
1552-1695  (118928-119071)   100% ->
1696-1791  (119647-119742)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCGTGCAGGCGGCCGAGGTGAAAGTGGATGGCAGCGAGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCGTGCAGGCGGCCGAGGTGAAAGTGGATGGCAGCGAGCCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGAGCAAGAA         TGAGCTGAAGAGACGCCTGAAAGCTGAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGAGCAAGAAGTG...CAGTGAGCTGAAGAGACGCCTGAAAGCTGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAAGTAGCAGAGAAGGAGGCCAAACAGAAAGAGCTCAGTGAGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105946 AGAAAGTAGCAGAGAAGGAGGCCAAACAGAAAGAGCTCAGTGAGAAACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAAGCCAAGCCACTGCTGCTGCCACCAACCACACCACTGATAATGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105996 CTAAGCCAAGCCACTGCTGCTGCCACCAACCACACCACTGATAATGGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGTCCTGAGGAAGAGAGCGTGGACCCAAAT         CAATACTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106046 GGGTCCTGAGGAAGAGAGCGTGGACCCAAATGTG...CAGCAATACTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAATCCGCAGTCAAGCAATTCATCAGCTGAAGGTCAATGGGGAAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107301 AAATCCGCAGTCAAGCAATTCATCAGCTGAAGGTCAATGGGGAAGACCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACCCACACAAGTTCCATGTAGACATCTCACTCACTGACTTCATCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107351 TACCCACACAAGTTCCATGTAGACATCTCACTCACTGACTTCATCCAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATATAGTCACCTGCAGCCTGGGGATCACCTGACTGACATCACCTTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107401 ATATAGTCACCTGCAGCCTGGGGATCACCTGACTGACATCACCTTAAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGCAG         GTAGGATCCATGCCAAAAGAGCTTCTGGGGGAAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107451 TGGCAGGTA...TAGGTAGGATCCATGCCAAAAGAGCTTCTGGGGGAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCATCTTCTATGATCTTCGAGGAGAGGGGGTGAAGTTGCAAGTCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111128 CTCATCTTCTATGATCTTCGAGGAGAGGGGGTGAAGTTGCAAGTCATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAATTCCAG         AAATTATAAATCAGAAGAAGAATTTATTCATA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111178 CAATTCCAGGTA...CAGAAATTATAAATCAGAAGAAGAATTTATTCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTAATAACAAACTGCGTCGGGGAGACATAATTGGAGTTCAGGGGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111574 TTAATAACAAACTGCGTCGGGGAGACATAATTGGAGTTCAGGGGAATCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGTAAAACCAAGAAGGGTGAGCTGAGCATCATTCCGTATGAGATCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111624 GGTAAAACCAAGAAGGGTGAGCTGAGCATCATTCCGTATGAGATCACACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGTCTCCCTGTTTGCATATGTTACCTCATCTTCACTTTGGCCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111674 GCTGTCTCCCTGTTTGCATATGTTACCTCATCTTCACTTTGGCCTCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAAG         GAAACAAGGTATCGCCAGAGATACTTGGACTTGATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111724 ACAAGGTA...TAGGAAACAAGGTATCGCCAGAGATACTTGGACTTGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGAATGACTTTGTGAGGCAGAAATTTATCATCCGCTCTAAGATCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111871 CTGAATGACTTTGTGAGGCAGAAATTTATCATCCGCTCTAAGATCATCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATATATAAGAAGTTTCTTAGATGAGCTGGGATTCCTAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111921 ATATATAAGAAGTTTCTTAGATGAGCTGGGATTCCTAGAGGTA...TAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGAAACTCCCATGATGAACATCATCCCAGGGGGAGCCGTGGCCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113349 TTGAAACTCCCATGATGAACATCATCCCAGGGGGAGCCGTGGCCAAGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCATCACTTATCACAACGAGCTGGACATGAACTTATATATGAGAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113399 TTCATCACTTATCACAACGAGCTGGACATGAACTTATATATGAGAATTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCCAGAACTCTATCATAAG         ATGCTTGTGGTTGGTGGCATCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113449 TCCAGAACTCTATCATAAGGTA...TAGATGCTTGTGGTTGGTGGCATCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACCGGGTTTATGAAATTGGACGCCAGTTCCGGAATGAGGGGATTGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115807 ACCGGGTTTATGAAATTGGACGCCAGTTCCGGAATGAGGGGATTGATTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACGCACAATCCTGAGTTCACCACCTGTGAGTTCTACATGGCCTATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115857 ACGCACAATCCTGAGTTCACCACCTGTGAGTTCTACATGGCCTATGCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTATCACGATCTCATGGAAATCACGGAGAAGATGGTTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115907 CTATCACGATCTCATGGAAATCACGGAGAAGATGGTTTCAGGTG...CAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGATGGTGAAGCATATTACAGGCAGTTACAAGGTCACCTACCACCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116051 GGATGGTGAAGCATATTACAGGCAGTTACAAGGTCACCTACCACCCAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGCCCAGAGGGCCAAGCCTACGATGTTGACTTCACCCCACCCTTCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116101 GGCCCAGAGGGCCAAGCCTACGATGTTGACTTCACCCCACCCTTCCGGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AATCAACATGGTAGAAGAGCTTGAGAAAGCCCTGGGGATGAAGCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116151 AATCAACATGGTAGAAGAGCTTGAGAAAGCCCTGGGGATGAAGCTGCCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAACGAACCTCTTTGAAACTGAAG         AAACTCGCAAAATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 116201 AAACGAACCTCTTTGAAACTGAAGGTA...CAGAAACTCGCAAAATTCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GATGATATCTGTGTGGCAAAAGCTGTTGAATGCCCTCCACCTCGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116404 GATGATATCTGTGTGGCAAAAGCTGTTGAATGCCCTCCACCTCGGACCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGCCAGGCTCCTTGACAAG         CTTGTTGGGGAGTTCCTGGAAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 116454 AGCCAGGCTCCTTGACAAGGTG...AAGCTTGTTGGGGAGTTCCTGGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGACTTGCATCAATCCTACATTCATCTGTGATCACCCACAGATAATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117154 TGACTTGCATCAATCCTACATTCATCTGTGATCACCCACAGATAATGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CCTTTGGCTAAATG         GCACCGCTCTAAAGAGGGTCTGACTGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 117204 CCTTTGGCTAAATGGTA...TAGGCACCGCTCTAAAGAGGGTCTGACTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCGCTTTGAGCTGTTTGTCATGAAGAAAGAGATATGCAATGCGTATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118126 GCGCTTTGAGCTGTTTGTCATGAAGAAAGAGATATGCAATGCGTATACTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGCTGAATGATCCCATGCGGCAGCGGCAGCTTTTTGAAGAACAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118176 AGCTGAATGATCCCATGCGGCAGCGGCAGCTTTTTGAAGAACAGGCCAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552          GCCAAGGCTGCAGGTGATGATGAGGCCATGTTCATAGATGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118226 GTG...TAGGCCAAGGCTGCAGGTGATGATGAGGCCATGTTCATAGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AAACTTCTGTACTGCCCTGGAATATGGGCTGCCCCCCACAGCTGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118969 AAACTTCTGTACTGCCCTGGAATATGGGCTGCCCCCCACAGCTGGCTGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GCATGGGCATTGATCGAGTCGCCATGTTTCTCACGGACTCCAACAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119019 GCATGGGCATTGATCGAGTCGCCATGTTTCTCACGGACTCCAACAACATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAG         GAAGTACTTCTGTTTCCTGCCATGAAACCCGAAGACAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119069 AAGGTA...CAGGAAGTACTTCTGTTTCCTGCCATGAAACCCGAAGACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GAAGGAGAATGTAGCAACCACTGATACACTGGAAAGCACAACAGTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119685 GAAGGAGAATGTAGCAACCACTGATACACTGGAAAGCACAACAGTTGGCA

   1900     .
   1784 GTTCTGTC
         |||||||
 119735 CTTCTGTC