seq1 = pF1KSDA0069.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KSDA0069/gi568815582r_18693275.tfa (gi568815582r:18693275_18898835), 205561 bp

>pF1KSDA0069 609
>gi568815582r:18693275_18898835 (Chr16)

(complement)

1-36  (97370-97405)   100% ->
37-170  (100002-100135)   100% ->
171-290  (100792-100911)   100% ->
291-408  (103255-103372)   100% ->
409-493  (104153-104237)   100% ->
494-609  (105466-105581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGGAGATAATCGCAGCACCAACCTGCTG         GCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  97370 ATGGCGGAGGGAGATAATCGCAGCACCAACCTGCTGGTG...TAGGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGAGACTGCAAGTCTGGAAGAACAGCTGCAAGGATGGGGAGAAGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 AGAGACTGCAAGTCTGGAAGAACAGCTGCAAGGATGGGGAGAAGTGATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGATGGCTGATAAAGTCCTCCGATGGGAAAGAGCCTGGTTTCCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 TGATGGCTGATAAAGTCCTCCGATGGGAAAGAGCCTGGTTTCCACCTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCATGGGTGTGGTTTCTTTGGTGTTTCT         GATTATCTACTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100107 ATCATGGGTGTGGTTTCTTTGGTGTTTCTGTA...CAGGATTATCTACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCTAGATCCATCTGTTCTGTCCGGCGTTTCCTGTTTTGTTATGTTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100804 TCTAGATCCATCTGTTCTGTCCGGCGTTTCCTGTTTTGTTATGTTTTTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTTGGCTGACTACCTTGTTCCCATTCTAGCGCCTAGAATTTTTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 GCTTGGCTGACTACCTTGTTCCCATTCTAGCGCCTAGAATTTTTGGCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATAAATG         GACCACTGAACAACAGCAAAGATTCCATGAAAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 AATAAATGGTA...TAGGACCACTGAACAACAGCAAAGATTCCATGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTGCAGCAATCTAGTAAAAACTCGACGCAGAGCTGTGGGTTGGTGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103288 TTGCAGCAATCTAGTAAAAACTCGACGCAGAGCTGTGGGTTGGTGGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTCTTCACACTAAAGGAAGAAAAACCTAAGATG         TACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103338 GCCTCTTCACACTAAAGGAAGAAAAACCTAAGATGGTA...TAGTACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGACCATGATCGTTTCCCTTGCTGCGGTTGCTTGGGTGGGACAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104159 ATGACCATGATCGTTTCCCTTGCTGCGGTTGCTTGGGTGGGACAACAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCACAACCTGCTTCTCACCTACCTGATAG         TGACTTCCTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104209 CCACAACCTGCTTCTCACCTACCTGATAGGTA...AAGTGACTTCCTTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TATTGCTTCCTGGACTAAACCAACATGGAATCATTTTGAAGTACATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105478 TATTGCTTCCTGGACTAAACCAACATGGAATCATTTTGAAGTACATTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGGCCAAGAGGGAGATAAACAAACTTCTCAAACAAAAAGAAAAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105528 ATGGCCAAGAGGGAGATAAACAAACTTCTCAAACAAAAAGAAAAGAAAAA

    650 
    606 CGAA
        ||||
 105578 CGAA