seq1 = pF1KSDA0063.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KSDA0063/gi568815576r_38587905.tfa (gi568815576r:38587905_38799987), 212083 bp

>pF1KSDA0063 606
>gi568815576r:38587905_38799987 (Chr22)

(complement)

1-185  (100001-100185)   100% ->
186-314  (110564-110692)   100% ->
315-509  (110859-111053)   100% ->
510-606  (111987-112083)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTGTGTGCCATGGAAAGGAGACAAGGCCAAATCTGAATCATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTGTGTGCCATGGAAAGGAGACAAGGCCAAATCTGAATCATTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCCCCAGGCAGCACCCCCACAAATCTACCATGAGAAACAGCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCCCCAGGCAGCACCCCCACAAATCTACCATGAGAAACAGCGCAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTTTGTGCCCTCCACGCCCTCAATAACGTCTTCCAGGACAGCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTTTGTGCCCTCCACGCCCTCAATAACGTCTTCCAGGACAGCAATGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCACCCGGGATACGCTGCAAGAGATTTTCCAGAG         GTTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100151 TTCACCCGGGATACGCTGCAAGAGATTTTCCAGAGGTA...TAGGTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCAAACACCATGGTGACACCTCACAAGAAGAGCATGCTGGGAAATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110570 TCCAAACACCATGGTGACACCTCACAAGAAGAGCATGCTGGGAAATGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTACGATGTGAATGTCATTATGGCAGCACTTCAGACCAAAGGCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110620 ACTACGATGTGAATGTCATTATGGCAGCACTTCAGACCAAAGGCTATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGTTTGGTGGGACAAGCGCAG         GGATGTCGGTGTCATTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110670 GCTGTTTGGTGGGACAAGCGCAGGTA...CAGGGATGTCGGTGTCATTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCACTAACGTCATGGGCTTCATCATGAATCTGCCCTCCAGCCTATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110877 CCTCACTAACGTCATGGGCTTCATCATGAATCTGCCCTCCAGCCTATGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGGTCCACTGAAACTGCCCCTCAAAAGGCAGCACTGGATCTGTGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110927 GGGGTCCACTGAAACTGCCCCTCAAAAGGCAGCACTGGATCTGTGTTCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGTGGGAGGGGCCTACTACAACCTCGACTCCAAACTCAAGATGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110977 GAGGTGGGAGGGGCCTACTACAACCTCGACTCCAAACTCAAGATGCCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTGGATTGGAGGCGAGAGCGAGCTCAG         GAAGTTTCTAAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111027 GTGGATTGGAGGCGAGAGCGAGCTCAGGTA...TAGGAAGTTTCTAAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCATTTGCGAGGAAAGAACTGTGAACTCCTGCTGGTGGTACCAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112001 ATCATTTGCGAGGAAAGAACTGTGAACTCCTGCTGGTGGTACCAGAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :
    574 GTAGAGGCTCATCAGAGTTGGAGGACCGATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 112051 GTAGAGGCTCATCAGAGTTGGAGGACCGATGTG