seq1 = pF1KSDA0019.tfa, 2484 bp
seq2 = pF1KSDA0019/gi568815588r_11362444.tfa (gi568815588r:11362444_11627567), 265124 bp

>pF1KSDA0019 2484
>gi568815588r:11362444_11627567 (Chr10)

(complement)

1-72  (99999-100068)   97% ->
73-155  (102100-102182)   100% ->
156-195  (108994-109033)   100% ->
196-276  (117893-117973)   100% ->
277-384  (126360-126467)   100% ->
385-494  (134340-134449)   100% ->
495-543  (136688-136736)   100% ->
544-664  (138346-138466)   100% ->
665-759  (141657-141751)   100% ->
760-825  (142334-142399)   100% ->
826-925  (142498-142597)   100% ->
926-1078  (145646-145798)   100% ->
1079-2484  (163719-165124)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTCAGACCAGGATGTAGCACTCAAACTTGCCCAGGAGCGAGCTGA
        |-||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 A GA TTCAGACCAGGATGTAGCACTCAAACTTGCCCAGGAGCGAGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATAGTTGCTAAATATGACAGA         GGACGAGAAGGTGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100047 AATAGTTGCTAAATATGACAGAGTA...TAGGGACGAGAAGGTGCAGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGAACCTTGGGAAGATGCTGATTACCTTGTTTACAAAGTCACAGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102119 TTGAACCTTGGGAAGATGCTGATTACCTTGTTTACAAAGTCACAGATAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGGCTTTTTACA         TGAGGAGGAGCTCCCAGATCATAATGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102169 TTTGGCTTTTTACAGTA...CAGTGAGGAGGAGCTCCCAGATCATAATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCTGTGGAACGG         CAAAAGCACCTGGAAATTGAAAGAACTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109021 GGCTGTGGAACGGGTA...TAGCAAAAGCACCTGGAAATTGAAAGAACTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCAAATGGCTGAAAATGCTGAAAGGATGGGAAAAATACAAGAACACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117921 CCAAATGGCTGAAAATGCTGAAAGGATGGGAAAAATACAAGAACACTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAG         TTTCATAGGCGAATTTACAAAGGAATACCACTCCAGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117971 AAGGTA...AAGTTTCATAGGCGAATTTACAAAGGAATACCACTCCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAGAGGTGAAGTCTGGGCCCTCCTTCTTGAGATCCCTAAAATGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126398 CAGAGGTGAAGTCTGGGCCCTCCTTCTTGAGATCCCTAAAATGAAAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAACAAGGGACCTGTATAGT         AAATTAAAACACAGAGCACGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 126448 AAACAAGGGACCTGTATAGTGTG...CAGAAATTAAAACACAGAGCACGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GGCTGTTCACCTGACATCAGACAAATAGACCTGGATGTCAACCGCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134361 GGCTGTTCACCTGACATCAGACAAATAGACCTGGATGTCAACCGCACATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCGGGACCACATTATGTTTAGAGACAGATATGGTGTTAA         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 134411 TCGGGACCACATTATGTTTAGAGACAGATATGGTGTTAAGTG...TAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AACAATCCTTATTCCATGTGCTTGCTGCCTATTCTATTTATAACACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136690 AACAATCCTTATTCCATGTGCTTGCTGCCTATTCTATTTATAACACGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544       GAAGTCGGGTATTGTCAGGGGATGAGCCAGATCACAGCTTTACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136740 ...CAGGAAGTCGGGTATTGTCAGGGGATGAGCCAGATCACAGCTTTACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CCTCATGTATATGAACGAGGAAGATGCCTTCTGGGCCCTGGTCAAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138390 CCTCATGTATATGAACGAGGAAGATGCCTTCTGGGCCCTGGTCAAACTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCTCAGGCCCTAAACATGCCATGCATG         GCTTTTTTGTCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 138440 TCTCAGGCCCTAAACATGCCATGCATGGTA...TAGGCTTTTTTGTCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GGTTTTCCTAAACTCTTGAGGTTTCAAGAACATCATGAAAAAATACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141671 GGTTTTCCTAAACTCTTGAGGTTTCAAGAACATCATGAAAAAATACTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CAAATTTCTGTCCAAGCTTAAGCAACACTTG         GATTCTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141721 CAAATTTCTGTCCAAGCTTAAGCAACACTTGGTA...CAGGATTCTCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 AAATCTACACAAGTTTTTACACAATGAAATGGTTTTTTCAGTGTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142344 AAATCTACACAAGTTTTTACACAATGAAATGGTTTTTTCAGTGTTTCCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GATCGT         ACTCCCTTTACACTAAACCTCAGAATATGGGATAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142394 GATCGTGTA...TAGACTCCCTTTACACTAAACCTCAGAATATGGGATAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 CTACATCTTTGAAGGAGAACGAGTTCTTACTGCTATGTCTTACACCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142533 CTACATCTTTGAAGGAGAACGAGTTCTTACTGCTATGTCTTACACCATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TAAAATTACACAAAA         AACATCTAATGAAATTGTCCATGGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 142583 TAAAATTACACAAAAGTA...TAGAACATCTAATGAAATTGTCCATGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 GAACTTGTAGAATTTTTTCAGGAGACCCTGGCAAAGGATTTTTTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145672 GAACTTGTAGAATTTTTTCAGGAGACCCTGGCAAAGGATTTTTTCTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AGATGATTTTGTGATAGAGCAACTTCAGATTTCTATGACAGAACTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145722 AGATGATTTTGTGATAGAGCAACTTCAGATTTCTATGACAGAACTAAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 GGGCAAAGTTAGACCTTCCAGAACCTG         GTAAAGAGGATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 145772 GGGCAAAGTTAGACCTTCCAGAACCTGGTA...CAGGTAAAGAGGATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 TATCCAAAGAAGCCCTTGGGGCAGCTTCCACCTGAACTTCAGTCTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163733 TATCCAAAGAAGCCCTTGGGGCAGCTTCCACCTGAACTTCAGTCTTGGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CGTCCATCACTTGAGCAACGGACAGAGGAGCGTGGGCCGGCCGAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163783 CGTCCATCACTTGAGCAACGGACAGAGGAGCGTGGGCCGGCCGAGCCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TGGCCAGCGGCAGGAGGGAGAGCGGGGCGCCCCACAGGAGGCACGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163833 TGGCCAGCGGCAGGAGGGAGAGCGGGGCGCCCCACAGGAGGCACGAGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TCCCCGCACCCCCAGAGCAGGACCGGGACGCCCGAGAGAGCACAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163883 TCCCCGCACCCCCAGAGCAGGACCGGGACGCCCGAGAGAGCACAGCCGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AAGACGGAAATCGGTGGAGGAGGAGAGCAAAAAGCTTAAAGATGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163933 AAGACGGAAATCGGTGGAGGAGGAGAGCAAAAAGCTTAAAGATGAGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATTTTCAAAGAAAACTCCCATCGGGTCCACAGGACAGTTCCAGGCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163983 ATTTTCAAAGAAAACTCCCATCGGGTCCACAGGACAGTTCCAGGCAATAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AATCACGCAGCTGCCAACCAAAATAGCAACGCCACTTCAAATATCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164033 AATCACGCAGCTGCCAACCAAAATAGCAACGCCACTTCAAATATCAGGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGAGTTTGTGCCCAAATGGAATAAACCGTCAGACGTCTCAGCTACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164083 GGAGTTTGTGCCCAAATGGAATAAACCGTCAGACGTCTCAGCTACAGAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GAACTGCCAAATACACCATGGAAGGCAAAGGTCGAGCAGCGCACCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164133 GAACTGCCAAATACACCATGGAAGGCAAAGGTCGAGCAGCGCACCCCGCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTCGCAGTTACCGTCCCAGGTCCTGCCGAGGTGCGGGTGTCAAACGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164183 CTCGCAGTTACCGTCCCAGGTCCTGCCGAGGTGCGGGTGTCAAACGTGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCCAAAGATGAAGGCCCTGGATGCTGAGGACGGGAAGCGGGGCTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164233 GCCAAAGATGAAGGCCCTGGATGCTGAGGACGGGAAGCGGGGCTCCACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CATCGCAGTACGACAACGTGCCAGGCCCGGAGCTGGACAGCGGCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164283 CATCGCAGTACGACAACGTGCCAGGCCCGGAGCTGGACAGCGGCGCTTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GTGGAGGAGGCGCTGGAAAGGGCTTACTCCCAGAGCCCCCGGCATGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164333 GTGGAGGAGGCGCTGGAAAGGGCTTACTCCCAGAGCCCCCGGCATGCCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TTACCCTCCCAGCCCGAGAAAGCACGCTGAGCCAAGTTCTAGTCCATCAA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164383 TTACCCTCCTAGCCCGAGAAAGCACGCTGAGCCAAGTTCTAGTCCATCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAGTATCCAACAAGTTTACTTTTAAAGTACAGCCTCCAAGTCATGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164433 AAGTATCCAACAAGTTTACTTTTAAAGTACAGCCTCCAAGTCATGCACGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TATCCGTCCCAGCTAGATGGGGAAGCCCGAGGGCTAGCTCATCCCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164483 TATCCGTCCCAGCTAGATGGGGAAGCCCGAGGGCTAGCTCATCCCCCCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CTACAGCAATCCCCCCGTTTACCACGGAAACTCTCCCAAACACTTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164533 CTACAGCAATCCCCCCGTTTACCACGGAAACTCTCCCAAACACTTCCCTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGCCAACAGCAGCTTTGCTTCTCCACAGTTTAGCCCTGGGACTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164583 CTGCCAACAGCAGCTTTGCTTCTCCACAGTTTAGCCCTGGGACTCAACTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AATCCTTCCAGGAGACCTCATGGTTCTACTCTTTCCGTCAGTGCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164633 AATCCTTCCAGGAGACCTCATGGTTCTACTCTTTCCGTCAGTGCTTCTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GGAGAAATCTTACAGCCGCCCAAGCCCCCTTGTACTGCCGTCTAGTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164683 GGAGAAATCTTACAGCCGCCCAAGCCCCCTTGTACTGCCGTCTAGTCGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TAGAAGTCCTCCCTGTTGACACTGGTGCTGGGGGATATTCGGGCAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164733 TAGAAGTCCTCCCTGTTGACACTGGTGCTGGGGGATATTCGGGCAATTCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GGGTCACCAAAGAATGGAAAATTGATCATTCCACCAGTGGATTACTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164783 GGGTCACCAAAGAATGGAAAATTGATCATTCCACCAGTGGATTACTTGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 AGATAACAGAACATGGTCAGAAGTTAGTTATACATACAGACCTGAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164833 AGATAACAGAACATGGTCAGAAGTTAGTTATACATACAGACCTGAGACGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 AGGGACAATCATGGACCCGAGATGCTAGCCGTGGCAATTTACCAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164883 AGGGACAATCATGGACCCGAGATGCTAGCCGTGGCAATTTACCAAAATAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 TCAGCCTTTCAACTCGCACCCTTTCAGGACCATGGCCTCCCTGCAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164933 TCAGCCTTTCAACTCGCACCCTTTCAGGACCATGGCCTCCCTGCAGTTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 TGTAGATAGTCCCGTGAGATATAAAGCTTCACCGGCCGCAGAAGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164983 TGTAGATAGTCCCGTGAGATATAAAGCTTCACCGGCCGCAGAAGATGCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 GTCCATCTGGATATCCATATTCAGGGCCCCCGCCTCCAGCCTACCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165033 GTCCATCTGGATATCCATATTCAGGGCCCCCGCCTCCAGCCTACCACTAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 AGGAATCGGGACGGGCTTTCCATCCAAGAGTCAGTGTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165083 AGGAATCGGGACGGGCTTTCCATCCAAGAGTCAGTGTTGCTG