seq1 = pF1KF0229.tfa, 1824 bp
seq2 = pF1KF0229/gi568815595r_57528217.tfa (gi568815595r:57528217_57793018), 264802 bp

>pF1KF0229 1824
>gi568815595r:57528217_57793018 (Chr3)

(complement)

1-237  (100001-100237)   100% ->
238-276  (120581-120619)   100% ->
277-319  (120721-120763)   100% ->
320-432  (126784-126896)   100% ->
433-513  (129303-129383)   100% ->
514-619  (131468-131573)   100% ->
620-699  (132180-132259)   98% ->
700-762  (133839-133901)   100% ->
763-818  (135284-135339)   100% ->
819-941  (146581-146703)   100% ->
942-1037  (147263-147358)   100% ->
1038-1132  (151272-151366)   100% ->
1133-1198  (158250-158315)   100% ->
1199-1263  (158397-158461)   100% ->
1264-1353  (159665-159754)   100% ->
1354-1407  (162041-162094)   100% ->
1408-1517  (162195-162304)   100% ->
1518-1620  (162496-162598)   100% ->
1621-1695  (164134-164208)   100% ->
1696-1824  (164674-164802)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTTGAGGGGCCCTGCGGGCTTGGGGCCCGGCTCTCGAAGGCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTTGAGGGGCCCTGCGGGCTTGGGGCCCGGCTCTCGAAGGCCGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACGAAGCGGTGGCAGGGGCCGAGGGCCGCGAGGCGCCGGCCCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACGAAGCGGTGGCAGGGGCCGAGGGCCGCGAGGCGCCGGCCCTTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCGGGAGGCGCGCCAGAGGACGATGAAGAGGACGATGGCCGTGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCGGGAGGCGCGCCAGAGGACGATGAAGAGGACGATGGCCGTGGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCTGCTGCGCTGGGACAGCTTCTCCGCCTGGCTGCACTGCGTGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCTGCTGCGCTGGGACAGCTTCTCCGCCTGGCTGCACTGCGTGTGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGGGCTTCGACCTGGAGCTGGGCCAGGCCGTGGAG         GTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100201 GGTGGGCTTCGACCTGGAGCTGGGCCAGGCCGTGGAGGTG...CAGGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTATCCTCAGCATTCCAAACTTACTGACAGAGAA         AAAACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 120585 TTTATCCTCAGCATTCCAAACTTACTGACAGAGAAGTA...CAGAAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATATTTGCTATTTGTCTTTTCCAGATTCAAATTCAG         GTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 120727 AATATTTGCTATTTGTCTTTTCCAGATTCAAATTCAGGTA...TAGGTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTTGGAGATACCCAGTTTTGTTTTAGATTTCGACAGTCTTCTGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126788 TCTTGGAGATACCCAGTTTTGTTTTAGATTTCGACAGTCTTCTGGGAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGTGTCGCTGCATTGTCTCCTGGATCAATTTGACAAAGATTTACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126838 GGGTGTCGCTGCATTGTCTCCTGGATCAATTTGACAAAGATTTACCAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACTTAAAG         AAGGATCCTGCTTATTTTTATGGATATGTGTA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 126888 TACTTAAAGGTT...TAGAAGGATCCTGCTTATTTTTATGGATATGTGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTCCGACAAGTTCGAGATAAAACTCTAAAAAGAGGCTACTTTCAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 129335 TTTCCGACAAGTTCGAGATAAAACTCTAAAAAGAGGCTACTTTCAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514         TCCTTGGTTTTGATCAGCAAACTACCTTATATTCATTTTTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129385 TA...CAGTCCTTGGTTTTGATCAGCAAACTACCTTATATTCATTTTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACACTGTGCTCAAACAGATAGCACCAGAGTATTTTGAAAAGAATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131510 CACACTGTGCTCAAACAGATAGCACCAGAGTATTTTGAAAAGAATGAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTATTTGGAAGCAG         CTTGTAATGATGTTGATCGATGGCCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 131560 TTATTTGGAAGCAGGTA...CAGCTTGTAATGATGTTGATCGATGGCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCCCAGTGCCAGGGAAAACATTACACCTGCCAATCATGGCGGTGGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 132207 CCCCAGTGCCAGGGAAAACATTACACCTGCCAATCATGGGGGTGGTAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAG         GTACGGATTCCCACATGTCATGACAAGCCTGGGACAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132257 AAGGTA...TAGGTACGGATTCCCACATGTCATGACAAGCCTGGGACAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCAAATAGTGCAGTTAACTCAGCAG         GTGGACACAAATATAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 133877 TCAAATAGTGCAGTTAACTCAGCAGGTA...CAGGTGGACACAAATATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTGTTATTTTACCTACTGTTCATGAGGTGGATATTTTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 135300 CTGTTATTTTACCTACTGTTCATGAGGTGGATATTTTCAGGTA...CAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TGTTTCTGCCCAGTTTTCCTTCATAGTCAGATGCTCTGGGAGCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146582 TGTTTCTGCCCAGTTTTCCTTCATAGTCAGATGCTCTGGGAGCTGGTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GTTGGGGGAGCCCCTTGTGGTTATGGCGCCATCACCATCGGAATCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146632 GTTGGGGGAGCCCCTTGTGGTTATGGCGCCATCACCATCGGAATCATCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGACTGTATTGGCACTTGTTAA         CTGTATTTCTCCATTAAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 146682 AGACTGTATTGGCACTTGTTAAGTG...CAGCTGTATTTCTCCATTAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TACTTCAGTGATTTCCGACCTTATTTCACTATTCATGATAGTGAATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147282 TACTTCAGTGATTTCCGACCTTATTTCACTATTCATGATAGTGAATTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGAATATACTACCCGTACCCAAGCTCC         GCCCTCAGTTATAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 147332 AGAATATACTACCCGTACCCAAGCTCCGTA...TAGGCCCTCAGTTATAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TAGGAGTAACCAACCCTTTTTTTGCTAAGACACTCCAGCACTGGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151286 TAGGAGTAACCAACCCTTTTTTTGCTAAGACACTCCAGCACTGGCCACAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ATTATTCGAATAGGAGACCTTAAACCTACAG         GTGAAATTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 151336 ATTATTCGAATAGGAGACCTTAAACCTACAGGTA...CAGGTGAAATTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TAAGCAGGTTAAAGTGAAAAAACTGAAGAATCTAAAGACTCTGGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158260 TAAGCAGGTTAAAGTGAAAAAACTGAAGAATCTAAAGACTCTGGATTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AACCTG         GAGTTTATACTTCATATAAGCCATATTTAAATAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158310 AACCTGGTA...TAGGAGTTTATACTTCATATAAGCCATATTTAAATAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GATGAAGAGATCATAAAACAATTACAGAAG         GGTGTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 158432 GATGAAGAGATCATAAAACAATTACAGAAGGTA...AAGGGTGTACAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 GAAACGTCCTTCTGAGGCTCAAAGTGTTATTCTTCGACGCTATTTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159676 GAAACGTCCTTCTGAGGCTCAAAGTGTTATTCTTCGACGCTATTTTTTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 AACTGACACAAAGTTTCATCATTCCATTA         GAAAGATATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 159726 AACTGACACAAAGTTTCATCATTCCATTAGTA...TAGGAAAGATATGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 GCAAGCTTGATGCCTTTGCAGAAAAGTATTTCCCCATGGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 162053 GCAAGCTTGATGCCTTTGCAGAAAAGTATTTCCCCATGGAAGGTA...TA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1408  AGTCCACCTCAATTAAGACAGTTTCTTCCAGAAGAATTTATGAAAACAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162194 GAGTCCACCTCAATTAAGACAGTTTCTTCCAGAAGAATTTATGAAAACAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 TTGAGAAAACAGGACCTCAGCTAACCTCTAGAATAAAAGGCGATTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162244 TTGAGAAAACAGGACCTCAGCTAACCTCTAGAATAAAAGGCGATTGGATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GGACTTTACCG         GCATTTCCTAAAGTCTCCAAATTTTGATGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 162294 GGACTTTACCGGTT...TAGGCATTTCCTAAAGTCTCCAAATTTTGATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 CTGGTTTAAGACCCGGAGGAAGGAAATGACCCAAAAATTGGAGGCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162526 CTGGTTTAAGACCCGGAGGAAGGAAATGACCCAAAAATTGGAGGCACTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 ATCTAGAAGCTCTTTGTGAAGAG         GACTTACTTCTCTGGATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 162576 ATCTAGAAGCTCTTTGTGAAGAGGTT...TAGGACTTACTTCTCTGGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 CAGAAACACACAGAAGTAGAAACAGTAGACCTTGTCTTGAAGCTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164152 CAGAAACACACAGAAGTAGAAACAGTAGACCTTGTCTTGAAGCTGAAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 TAAGCTG         TTGCAGGCTGATCGAGAGCACTTACCTGTGAAAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164202 TAAGCTGGTA...TAGTTGCAGGCTGATCGAGAGCACTTACCTGTGAAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1730 CTGACACTATGGAAAAGTTACGGACACACATAGATGCCATTATCTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164708 CTGACACTATGGAAAAGTTACGGACACACATAGATGCCATTATCTTAGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1780 TTGCCAGAGGACTTGCAAGGCATACTGCTCAAAACGGGCATGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164758 TTGCCAGAGGACTTGCAAGGCATACTGCTCAAAACGGGCATGACA