seq1 = pF1KF0190.tfa, 1560 bp
seq2 = pF1KF0190/gi568815597r_24057133.tfa (gi568815597r:24057133_24287248), 230116 bp

>pF1KF0190 1560
>gi568815597r:24057133_24287248 (Chr1)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-182  (106395-106518)   100% ->
183-367  (117648-117832)   100% ->
368-510  (125565-125707)   100% ->
511-670  (127616-127775)   100% ->
671-801  (128067-128197)   100% ->
802-1560  (129358-130116)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCCAG         GGAGGCCCCGTCTGGCCCCTCCCCAGAATGTGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCCAGGTA...CAGGGAGGCCCCGTCTGGCCCCTCCCCAGAATGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106428 CGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAACCCCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106478 GGCAACCCCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGGTA...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGTGCGGGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117648 CTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGTGCGGGAACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117698 AGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGTTCAAGGGACGCGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117748 AAGTTCAAGGGACGCGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAG         TGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117798 GGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGGTA...CAGTGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125571 CGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGCCACGTACCAGCTGCCCCCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125621 AATGCCACGTACCAGCTGCCCCCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAG         ACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 125671 TGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGGTG...CAGACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TATTTCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127620 TATTTCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTGCCAGAACCATCTACACGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127670 GCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTGCCAGAACCATCTACACGTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127720 TGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCCAG         AAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127770 TCCCAGGTG...TAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGTGATCTGGAAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128102 CTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGTGATCTGGAAGACCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 128152 CATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802      GACTTTTCTGGACACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128202 ..CAGGACTTTTCTGGACACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAGGAACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129403 AGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAGGAACTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129453 CAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAAGATGGAAGAAGGACCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129503 CAAGATGGAAGAAGGACCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAACCACCTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129553 GACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAACCACCTTCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129603 CCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACTCAGGGAGGCCCAGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129653 ACTCAGGGAGGCCCAGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGACTCCTCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129703 TGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGACTCCTCCTGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129753 CAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CGGGTGGGGATGGGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129803 CGGGTGGGGATGGGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAACCTCTCCTCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129853 GACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAACCTCTCCTCCTGGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129903 CACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CAGTTTCTCTTCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129953 CAGTTTCTCTTCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACAGCGATGCGGGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130003 GAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACAGCGATGCGGGCAGCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130053 GGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGC

   1600     .    :
   1547 ATTACATGGCCAGG
        ||||||||||||||
 130103 ATTACATGGCCAGG