Result of SIM4 for
pF1KE9674
seq1 = pF1KE9674.tfa, 2862 bp
seq2 = pF1KE9674/gi568815596f_216314705.tfa (gi568815596f:216314705_216582974), 268270 bp
>pF1KE9674 2862
>gi568815596f:216314705_216582974 (Chr2)
1-811 (100001-100811) 99% ->
812-862 (101553-101603) 100% ->
863-1096 (105595-105828) 100% ->
1097-1147 (108929-108979) 98% ->
1148-1334 (113892-114078) 100% ->
1335-1485 (118014-118164) 100% ->
1486-1644 (120634-120792) 100% ->
1645-1710 (123716-123781) 100% ->
1711-1851 (132314-132454) 100% ->
1852-2070 (136142-136360) 100% ->
2071-2141 (149893-149963) 100% ->
2142-2244 (153240-153342) 100% ->
2245-2427 (160565-160747) 100% ->
2428-2528 (162405-162505) 100% ->
2529-2625 (163499-163595) 100% ->
2626-2862 (168034-168270) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCCTTGCCTCTTACAGAGGAGCAGAGGAAAAAGATTGAAGAGAATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCCTTGCCTCTTACAGAGGAGCAGAGGAAAAAGATTGAAGAGAATCG
50 . : . : . : . : . :
51 ACAAAAGGCTCTGGGCCGCAGAGCTGAGAAGTTATTGGCAGAACAGCATC
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ACAAAAGGCTCTGGCCCGCAGAGCTGAGAAGTTATTGGCAGAACAGCATC
100 . : . : . : . : . :
101 AGAGGACTAGCTCGGGCACCTCCATTGCTGGCAACCCATTCCAGGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGAGGACTAGCTCGGGCACCTCCATTGCTGGCAACCCATTCCAGGCCAAG
150 . : . : . : . : . :
151 CAAGGCCCATCCCAAAATTTCCCAAGGGAGTCTTGTAAGCCAGTGAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CAAGGCCCATCCCAAAATTTCCCAAGGGAGTCTTGTAAGCCAGTGAGCCA
200 . : . : . : . : . :
201 TGGTGTCATTTTCAAGCAACAGAATCTCAGTAGCTCATCTAATGCTGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TGGTGTCATTTTCAAGCAACAGAATCTCAGTAGCTCATCTAATGCTGACC
250 . : . : . : . : . :
251 AAAGACCTCATGATTCCCACAGTTTTCAGGCAAAGGGAATATGGAAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AAAGACCTCATGATTCCCACAGTTTTCAGGCAAAGGGAATATGGAAAAAG
300 . : . : . : . : . :
301 CCAGAAGAAATGCCCACAGCCTGCCCAGGCCACAGTCCACGTAGTCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CCAGAAGAAATGCCCACAGCCTGCCCAGGCCACAGTCCACGTAGTCAAAT
350 . : . : . : . : . :
351 GGCTCTCACTGGAATCTCTCCTCCCTTGGCACAAAGTCCTCCAGAGGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GGCTCTCACTGGAATCTCTCCTCCCTTGGCACAAAGTCCTCCAGAGGTCC
400 . : . : . : . : . :
401 CTAAACAACAGCTCTTGAGTTATGAGTTAGGTCAAGGTCATGCTCAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CTAAACAACAGCTCTTGAGTTATGAGTTAGGTCAAGGTCATGCTCAGGCT
450 . : . : . : . : . :
451 TCACCTGAGATCAGGTTCACACCCTTTGCTAACCCAACTCATAAGCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TCACCTGAGATCAGGTTCACACCCTTTGCTAACCCAACTCATAAGCCTCT
500 . : . : . : . : . :
501 GGCCAAACCAAAGAGTTCCCAAGAGACACCAGCTCATTCCTCTGGACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 GGCCAAACCAAAGAGTTCCCAAGAGACACCAGCTCATTCCTCTGGACAGC
550 . : . : . : . : . :
551 CTCCCAGGGATGCTAAGTTAGAGGCCAAGACAGCAAAAGCCTCCCCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 CTCCCAGGGATGCTAAGTTAGAGGCCAAGACAGCAAAAGCCTCCCCTTCG
600 . : . : . : . : . :
601 GGGCAGAACATTTCTTACATCCATTCTAGCTCAGAGAGTGTAACGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GGGCAGAACATTTCTTACATCCATTCTAGCTCAGAGAGTGTAACGCCCAG
650 . : . : . : . : . :
651 GACAGAAGGAAGACTCCAGCAGAAGTCAGGGTCCTCAGTCCAAAAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 GACAGAAGGAAGACTCCAGCAGAAGTCAGGGTCCTCAGTCCAAAAAGGAG
700 . : . : . : . : . :
701 TGAACTCTCAGAAGGGAAAGTGCGTAAGGAACGGCGATCGTTTCCAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TGAACTCTCAGAAGGGAAAGTGCGTAAGGAACGGCGATCGTTTCCAGGTG
750 . : . : . : . : . :
751 TTGATTGGGTACAATGCGGAACTCATTGCAGTGTTTAAGACCCTGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 TTGATTGGGTACAATGCGGAACTCATTGCAGTGTTTAAGACCCTGCCCAG
800 . : . : . : . : . :
801 CAAGAATTATG ATCCTGACACCAAGACGTGGAACTTCAGCA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CAAGAATTATGGTA...CAGATCCTGACACCAAGACGTGGAACTTCAGCA
850 . : . : . : . : . :
842 TGAATGACTATAGTGCCCTGA TGAAAGCAGCCCAGAGCCTC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
101583 TGAATGACTATAGTGCCCTGAGTA...CAGTGAAAGCAGCCCAGAGCCTC
900 . : . : . : . : . :
883 CCCACGGTCAACCTGCAGCCTCTGGAATGGGCCTATGGCAGCAGCGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105615 CCCACGGTCAACCTGCAGCCTCTGGAATGGGCCTATGGCAGCAGCGAGTC
950 . : . : . : . : . :
933 ACCCTCCACCAGCAGTGAGGGACAGGCCGGCCTTCCATCAGCTCCATCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105665 ACCCTCCACCAGCAGTGAGGGACAGGCCGGCCTTCCATCAGCTCCATCCC
1000 . : . : . : . : . :
983 TTTCATTTGTCAAAGGGCGATGCATGCTCATCTCCAGGGCCTACTTCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105715 TTTCATTTGTCAAAGGGCGATGCATGCTCATCTCCAGGGCCTACTTCGAG
1050 . : . : . : . : . :
1033 GCAGACATCAGTTATTCACAGGACCTTATTGCGCTTTTTAAACAGATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105765 GCAGACATCAGTTATTCACAGGACCTTATTGCGCTTTTTAAACAGATGGA
1100 . : . : . : . : . :
1083 TTCCAGAAGATATG ATGTCAAGACCAGGAAGTGGAGCTTTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
105815 TTCCAGAAGATATGGCA...CAGATGTCAAGACCAGGAAGTGGAGCTTTC
1150 . : . : . : . : . :
1124 TCTTGCAAGAGCACAGTAAACTAA TTGCAAAGGTGCGCTGC
||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
108956 TCTTGGAAGAGCACAGTAAACTAAGTG...CAGTTGCAAAGGTGCGCTGC
1200 . : . : . : . : . :
1165 CTCCCACAAGTTCAGCTGGACCCTCTGCCCACGACTCTCACCCTGGCGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113909 CTCCCACAAGTTCAGCTGGACCCTCTGCCCACGACTCTCACCCTGGCGTT
1250 . : . : . : . : . :
1215 TGCTTCTCAGCTCAAGAAGACATCTCTCAGTCTCACGCCAGATGTCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113959 TGCTTCTCAGCTCAAGAAGACATCTCTCAGTCTCACGCCAGATGTCCCAG
1300 . : . : . : . : . :
1265 AGGCAGACCTTTCTGAAGTGGACCCCAAGCTCGTGTCTAATCTGATGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114009 AGGCAGACCTTTCTGAAGTGGACCCCAAGCTCGTGTCTAATCTGATGCCC
1350 . : . : . : . : . :
1315 TTTCAGAGAGCTGGAGTCAA TTTTGCCATAGCCAAAGGAGG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
114059 TTTCAGAGAGCTGGAGTCAAGTA...CAGTTTTGCCATAGCCAAAGGAGG
1400 . : . : . : . : . :
1356 CCGCCTGCTGCTCGCTGACGACATGGGCCTGGGGAAGACCATCCAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118035 CCGCCTGCTGCTCGCTGACGACATGGGCCTGGGGAAGACCATCCAAGCCA
1450 . : . : . : . : . :
1406 TCTGCATCGCAGCCTTTTACCGGAAGGAGTGGCCGCTCCTGGTGGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118085 TCTGCATCGCAGCCTTTTACCGGAAGGAGTGGCCGCTCCTGGTGGTGGTG
1500 . : . : . : . : . :
1456 CCATCCTCCGTGCGCTTCACCTGGGAGCAG GCCTTCCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
118135 CCATCCTCCGTGCGCTTCACCTGGGAGCAGGTT...CAGGCCTTCCTTCG
1550 . : . : . : . : . :
1497 GTGGCTGCCATCTCTGAGCCCAGATTGCATCAACGTCGTGGTGACTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120645 GTGGCTGCCATCTCTGAGCCCAGATTGCATCAACGTCGTGGTGACTGGGA
1600 . : . : . : . : . :
1547 AGGACCGCCTGACAGCTGGCCTGATCAACATTGTCAGCTTTGACCTTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120695 AGGACCGCCTGACAGCTGGCCTGATCAACATTGTCAGCTTTGACCTTCTT
1650 . : . : . : . : . :
1597 AGCAAGTTGGAAAAACAGCTAAAAACCCCTTTTAAAGTTGTCATCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
120745 AGCAAGTTGGAAAAACAGCTAAAAACCCCTTTTAAAGTTGTCATCATTGT
1700 . : . : . : . : . :
1645 GATGAATCTCACTTCCTCAAAAACAGTAGGACTGCCCGCTGTC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120795 A...CAGGATGAATCTCACTTCCTCAAAAACAGTAGGACTGCCCGCTGTC
1750 . : . : . : . : . :
1688 GAGCAGCTATGCCGGTCCTAAAG GTTGCCAAGAGGGTGATC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
123759 GAGCAGCTATGCCGGTCCTAAAGGTG...TAGGTTGCCAAGAGGGTGATC
1800 . : . : . : . : . :
1729 CTGTTGTCGGGCACACCAGCCATGTCCCGGCCCGCAGAGCTCTACACGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132332 CTGTTGTCGGGCACACCAGCCATGTCCCGGCCCGCAGAGCTCTACACGCA
1850 . : . : . : . : . :
1779 GATCATCGCAGTCAAGCCAACTTTCTTCCCCCAGTTTCATGCCTTTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132382 GATCATCGCAGTCAAGCCAACTTTCTTCCCCCAGTTTCATGCCTTTGGAC
1900 . : . : . : . : . :
1829 TTCGCTACTGTGATGCCAAACGG ATGCCTTGGGGGTGGGAC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
132432 TTCGCTACTGTGATGCCAAACGGGTA...CAGATGCCTTGGGGGTGGGAC
1950 . : . : . : . : . :
1870 TACTCAGGTTCCTCCAACCTGGGAGAGCTGAAGCTCCTGCTGGAGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136160 TACTCAGGTTCCTCCAACCTGGGAGAGCTGAAGCTCCTGCTGGAGGAAGC
2000 . : . : . : . : . :
1920 AGTCATGCTGCGGCGCCTCAAGTCCGACGTCCTTTCCCAGCTGCCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136210 AGTCATGCTGCGGCGCCTCAAGTCCGACGTCCTTTCCCAGCTGCCTGCCA
2050 . : . : . : . : . :
1970 AGCAGCGCAAGATAGTGGTGATTGCCCCAGGACGGATCAATGCCAGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136260 AGCAGCGCAAGATAGTGGTGATTGCCCCAGGACGGATCAATGCCAGGACC
2100 . : . : . : . : . :
2020 AGAGCTGCCCTGGATGCTGCAGCCAAGGAAATGACCACCAAGGACAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136310 AGAGCTGCCCTGGATGCTGCAGCCAAGGAAATGACCACCAAGGACAAAAC
2150 . : . : . : . : . :
2070 T AAACAGCAGCAGAAAGATGCCCTCATTCTCTTCTTCAACA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136360 TGTG...CAGAAACAGCAGCAGAAAGATGCCCTCATTCTCTTCTTCAACA
2200 . : . : . : . : . :
2111 GAACAGCTGAAGCTAAAATCCCATCTGTCAT TGAATATATC
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
149933 GAACAGCTGAAGCTAAAATCCCATCTGTCATGTA...CAGTGAATATATC
2250 . : . : . : . : . :
2152 TTGGACCTACTGGAAAGTGGAAGAGAGAAGTTTTTAGTATTTGCACACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153250 TTGGACCTACTGGAAAGTGGAAGAGAGAAGTTTTTAGTATTTGCACACCA
2300 . : . : . : . : . :
2202 TAAGGTGGTCCTGGACGCAATTACGCAAGAGCTTGAGAGAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
153300 TAAGGTGGTCCTGGACGCAATTACGCAAGAGCTTGAGAGAAAGGTG...C
2350 . : . : . : . : . :
2245 CACGTGCAGCACATCCGCATCGATGGCTCCACCTCATCAGCTGAGCGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160563 AGCACGTGCAGCACATCCGCATCGATGGCTCCACCTCATCAGCTGAGCGG
2400 . : . : . : . : . :
2293 GAGGACCTGTGCCAGCAGTTCCAACTGTCGGAGAGGCATGCTGTGGCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160613 GAGGACCTGTGCCAGCAGTTCCAACTGTCGGAGAGGCATGCTGTGGCCGT
2450 . : . : . : . : . :
2343 GCTGTCCATCACCGCTGCCAATATGGGCCTCACCTTCTCCTCGGCTGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160663 GCTGTCCATCACCGCTGCCAATATGGGCCTCACCTTCTCCTCGGCTGACC
2500 . : . : . : . : . :
2393 TGGTGGTGTTTGCTGAGCTGTTTTGGAACCCAGGG GTGCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
160713 TGGTGGTGTTTGCTGAGCTGTTTTGGAACCCAGGGGTA...CAGGTGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2434 ATCCAGGCTGAGGACCGCGTGCACCGCATTGGACAGACCAGCTCCGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162411 ATCCAGGCTGAGGACCGCGTGCACCGCATTGGACAGACCAGCTCCGTGGG
2600 . : . : . : . : . :
2484 CATTCACTACCTCGTGGCAAAGGGCACAGCTGATGACTACCTTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
162461 CATTCACTACCTCGTGGCAAAGGGCACAGCTGATGACTACCTTTGGTA..
2650 . : . : . : . : . :
2529 GCCCCTGATTCAAGAGAAGATTAAAGTTCTGGCAGAAGCCGGGCTT
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162511 .CAGGCCCCTGATTCAAGAGAAGATTAAAGTTCTGGCAGAAGCCGGGCTT
2700 . : . : . : . : . :
2575 TCTGAGACCAATTTTTCAGAAATGACAGAATCCACTGATTACCTCTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163545 TCTGAGACCAATTTTTCAGAAATGACAGAATCCACTGATTACCTCTACAA
2750 . : . : . : . : . :
2625 G GACCCAAAGCAGCAGAAGATCTACGACCTATTCCAGAAGT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163595 GGTA...AAGGACCCAAAGCAGCAGAAGATCTACGACCTATTCCAGAAGT
2800 . : . : . : . : . :
2666 CCTTTGAGAAAGAAGGAAGTGATATGGAGCTCCTGGAAGCAGCAGAGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168074 CCTTTGAGAAAGAAGGAAGTGATATGGAGCTCCTGGAAGCAGCAGAGTCC
2850 . : . : . : . : . :
2716 TTTGACCCAGGAAGTGCTTCAGGAACATCTGGAAGTAGTTCCCAGAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168124 TTTGACCCAGGAAGTGCTTCAGGAACATCTGGAAGTAGTTCCCAGAACAT
2900 . : . : . : . : . :
2766 GGGAGACACCCTGGATGAAAGCTCATTGACAGCCAGTCCACAGAAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168174 GGGAGACACCCTGGATGAAAGCTCATTGACAGCCAGTCCACAGAAGAAAA
2950 . : . : . : . : .
2816 GGAGATTTGAATTTTTTGATAACTGGGACAGCTTTACGTCTCCCCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
168224 GGAGATTTGAATTTTTTGATAACTGGGACAGCTTTACGTCTCCCCTG