seq1 = pF1KE9662.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KE9662/gi568815597r_51932700.tfa (gi568815597r:51932700_52133761), 201062 bp

>pF1KE9662 1062
>gi568815597r:51932700_52133761 (Chr1)

(complement)

1-1062  (100001-101062)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTCGTGGTGTTTTGCGGGCTGCCGTACAGCGGCAAGAGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCTCGTGGTGTTTTGCGGGCTGCCGTACAGCGGCAAGAGCCGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGAAGAGTTGCGCGTGGCGCTGGCTGCCGAGGGCCGCGCGGTGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGAAGAGTTGCGCGTGGCGCTGGCTGCCGAGGGCCGCGCGGTGTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGACGACGCAGCTGTCCTGGGCGCAGAGGACCCAGCGGTGTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGACGACGCAGCTGTCCTGGGCGCAGAGGACCCAGCGGTGTACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATTCTGCCCGTGAGAAGGCATTGCGTGGAGCTCTGCGAGCCTCCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATTCTGCCCGTGAGAAGGCATTGCGTGGAGCTCTGCGAGCCTCCGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGGCGCCTGAGTCGCCACGACGTGGTCATCCTGGACTCGCTTAACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGGCGCCTGAGTCGCCACGACGTGGTCATCCTGGACTCGCTTAACTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAAGGTTTCCGTTACGAGCTCTACTGCCTGGCACGGGCGGCGCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAAGGTTTCCGTTACGAGCTCTACTGCCTGGCACGGGCGGCGCGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCTCTGCCTGGTCTACTGCGTACGGCCCGGCGGCCCGATCGCGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCTCTGCCTGGTCTACTGCGTACGGCCCGGCGGCCCGATCGCGGGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGGTGGCGGGCGCGAACGAGAACCCTGGCCGGAACGTCAGTGTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCAGGTGGCGGGCGCGAACGAGAACCCTGGCCGGAACGTCAGTGTGAGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCGGCCACGCGCTGAGGAGGACGGGAGAGCCCAGGCGGCGGGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCGGCCACGCGCTGAGGAGGACGGGAGAGCCCAGGCGGCGGGCAGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCCTCAGGGAACTGCATACTGCGGACTCTGTAGTAAATGGAAGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCCTCAGGGAACTGCATACTGCGGACTCTGTAGTAAATGGAAGTGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCGACGTACCCAAGGAACTGGAGCGAGAAGAATCCGGGGCTGCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCGACGTACCCAAGGAACTGGAGCGAGAAGAATCCGGGGCTGCGGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCCAGCTCTTGTGACTCCGGATTCAGAGAAATCTGCAAAGCATGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCCAGCTCTTGTGACTCCGGATTCAGAGAAATCTGCAAAGCATGGGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTGCCTTTTACTCTCCCGAACTCCTGGAGGCCCTAACGCTGCGCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTGCCTTTTACTCTCCCGAACTCCTGGAGGCCCTAACGCTGCGCTTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCTCCCGATTCTCGGAATCGCTGGGACCGGCCTTTATTCACTTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCTCCCGATTCTCGGAATCGCTGGGACCGGCCTTTATTCACTTTGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCCTAGAGGAGCCGTTGCCCCTGGCGGGGATCCGCTCTGCCCTGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCCTAGAGGAGCCGTTGCCCCTGGCGGGGATCCGCTCTGCCCTGTTTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AACCGGGCCCCACCACCCCATCAGTCTACGCAGTCCCAGCCCCTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AACCGGGCCCCACCACCCCATCAGTCTACGCAGTCCCAGCCCCTCGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGCAGCTTTCTGCACCAGTTGGACCAGGTCACGAGTCAAGTACTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGGCAGCTTTCTGCACCAGTTGGACCAGGTCACGAGTCAAGTACTGGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GATTGATGGAAGCGCAGAAGAGCGCTGTCCCCGGGGACTTGCTCACGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GATTGATGGAAGCGCAGAAGAGCGCTGTCCCCGGGGACTTGCTCACGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCTGGTACCACAGAGCACTTGCGGTTTACCCGGCCCTTGACCATGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCTGGTACCACAGAGCACTTGCGGTTTACCCGGCCCTTGACCATGGCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACTGAGTCGCCTTCGTCGCCAGTTTATTTCGTACACTAAAATGCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACTGAGTCGCCTTCGTCGCCAGTTTATTTCGTACACTAAAATGCATCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACAATGAGAACTTGCCGCAACTGGCCAACATGTTTCTTCAGTATTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACAATGAGAACTTGCCGCAACTGGCCAACATGTTTCTTCAGTATTTGAGC

   1050     .    :
   1051 CAGAGCCTGCAC
        ||||||||||||
 101051 CAGAGCCTGCAC