seq1 = pF1KE9602.tfa, 591 bp
seq2 = pF1KE9602/gi568815579r_11047186.tfa (gi568815579r:11047186_11255776), 208591 bp

>pF1KE9602 591
>gi568815579r:11047186_11255776 (Chr19)

(complement)

1-160  (100001-100160)   100% ->
161-309  (106539-106685)   97% ->
310-410  (107664-107764)   100% ->
411-487  (107883-107959)   100% ->
488-591  (108488-108591)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCTTCCGCGACATAGAGGAGGTGAGCCAGGGGCTGCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCCTTCCGCGACATAGAGGAGGTGAGCCAGGGGCTGCTCAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGCGCCAACCGCGCGGAGGCGCAGCAGCGACGGCTGCTGGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGGCGCCAACCGCGCGGAGGCGCAGCAGCGACGGCTGCTGGGGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGCAGGTGGTGGAGCGGCTGCTGGAAACGCAAGACGGTGCCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGCAGGTGGTGGAGCGGCTGCTGGAAACGCAAGACGGTGCCGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTGCGAG         AGATCCTCACCATGGAGAAGGAAGTGGCCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTGCGAGGTG...CAGAGATCCTCACCATGGAGAAGGAAGTGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCCTTCTCAATGCGAAGGAGCAGGTGCACCAGGGAGGCGTGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106570 GAGCCTTCTCAATGCGAAGGAGCAGGTGCACCAGGGAGGCGTGGAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCAGCTGGAAGCTGGGCTTCAGGAGGCTGGGGAGGAGGACACCCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106620 AGCAGCTGGAAGCTGGGCTTCAGGAGGCTGGGGAGGAGGACACCCGTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGGCCAGCCTCCTTCAG         CTCACCAGAGAGCTGGAAGAGCT
        ||||||||||||||--| >>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106670 AAGGCCAGCCTCCT  ATATC...CAGCTCACCAGAGAGCTGGAAGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGGAGATTGAGGCGGATCTGGAGCGACAGGAGAAGGAGGTCGACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107687 CAAGGAGATTGAGGCGGATCTGGAGCGACAGGAGAAGGAGGTCGACGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACGACAGTCACAATCCCCTCGGCCGT         GTACGTGGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 107737 ACACGACAGTCACAATCCCCTCGGCCGTGTA...CAGGTACGTGGCTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTTACCACCAAGTTAGTAAAATTGAGTGGGATTATGAGTGTGAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107896 CTTTACCACCAAGTTAGTAAAATTGAGTGGGATTATGAGTGTGAGCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGGTCAAAGGCA         TCCATCATGGCCCCAGTGTGGCCCAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107946 GATGGTCAAAGGCAGTA...CAGTCCATCATGGCCCCAGTGTGGCCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCATCCACCTGGACAGCACCCAGCTCTCCAGGAAATTCATCAGCGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108515 CCATCCACCTGGACAGCACCCAGCTCTCCAGGAAATTCATCAGCGACTAC

    600     .    :    .    :    .
    565 CTCTGGAGTCTGGTGGACACCGAGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||
 108565 CTCTGGAGTCTGGTGGACACCGAGTGG