seq1 = pF1KE9572.tfa, 1122 bp
seq2 = pF1KE9572/gi568815579f_10013632.tfa (gi568815579f:10013632_10214735), 201104 bp

>pF1KE9572 1122
>gi568815579f:10013632_10214735 (Chr19)

1-19  (98091-98109)   100% ->
20-1122  (100002-101104)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCAACGTCTCGG         GTGCCAAGTCCTGCCCTGCCAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  98091 ATGGCAGCCAACGTCTCGGGTA...CAGGTGCCAAGTCCTGCCCTGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTCTTGGCAGCTGCCGACGACAAACTCAGTGGGTTCCAGGGGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 CTTCTTGGCAGCTGCCGACGACAAACTCAGTGGGTTCCAGGGGGACTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTGGCCCATACTGGTGGTTGAGTTCCTGGTGGCCGTGGCCAGCAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100074 TGTGGCCCATACTGGTGGTTGAGTTCCTGGTGGCCGTGGCCAGCAATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGCCCTGTACCGCTTCAGCATCCGGAAGCAGCGCCCATGGCACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100124 CTGGCCCTGTACCGCTTCAGCATCCGGAAGCAGCGCCCATGGCACCCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGGTCTTCTCTGTCCAGCTGGCAGTCAGCGACCTGCTCTGCGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100174 CGTGGTCTTCTCTGTCCAGCTGGCAGTCAGCGACCTGCTCTGCGCCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCTGCCCCCGCTGGCCGCCTACCTCTATCCCCCCAAGCACTGGCGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100224 CGCTGCCCCCGCTGGCCGCCTACCTCTATCCCCCCAAGCACTGGCGCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGGAGGCCGCGTGCCGCCTGGAGCGCTTCCTCTTCACCTGCAACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100274 GGGGAGGCCGCGTGCCGCCTGGAGCGCTTCCTCTTCACCTGCAACCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGCAGCGTCATCTTCATCACCTGCATCAGCCTCAACCGCTACCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100324 GGGCAGCGTCATCTTCATCACCTGCATCAGCCTCAACCGCTACCTGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCGTGCACCCCTTCTTCGCCCGAAGCCACCTGCGACCCAAGCACGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100374 TCGTGCACCCCTTCTTCGCCCGAAGCCACCTGCGACCCAAGCACGCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCGTGAGCGCTGCCGGCTGGGTCCTGGCCGCCCTGCTGGCCATGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100424 GCCGTGAGCGCTGCCGGCTGGGTCCTGGCCGCCCTGCTGGCCATGCCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTCAGCTTCTCCCACCTGAAGAGGCCGCAGCAGGGGGCGGGCAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100474 ACTCAGCTTCTCCCACCTGAAGAGGCCGCAGCAGGGGGCGGGCAACTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCGTGGCCAGGCCCGAGGCCTGCATCAAGTGTCTGGGGACAGCGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100524 GCGTGGCCAGGCCCGAGGCCTGCATCAAGTGTCTGGGGACAGCAGACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGGCTGGCGGCCTACAGAGCGTATAGCCTGGTGCTGGCGGGGTTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100574 GGGCTGGCGGCCTACAGAGCGTATAGCCTGGTGCTGGCGGGGTTGGGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CGGCCTGCCGCTGCTGCTCACGCTGGCAGCCTACGGCGCCCTCGGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100624 CGGCCTGCCGCTGCTGCTCACGCTGGCAGCCTACGGCGCCCTCGGGCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCGTGCTACGCAGCCCAGGCATGACTGTGGCCGAGAAGCTGCGTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100674 CCGTGCTACGCAGCCCAGGCATGACTGTGGCCGAGAAGCTGCGTGTGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCGTTGGTGGCCAGTGGTGTGGCCCTCTACGCCAGCTCCTATGTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100724 GCGTTGGTGGCCAGTGGTGTGGCCCTCTACGCCAGCTCCTATGTGCCCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCACATCATGCGGGTGCTCAACGTGGATGCTCGGCGGCGCTGGAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100774 CCACATCATGCGGGTGCTCAACGTGGATGCTCGGCGGCGCTGGAGCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCTGCCCGAGCTTTGCAGACATAGCCCAGGCCACAGCAGCCCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100824 GCTGCCCGAGCTTTGCAGACATAGCCCAGGCCACAGCAGCCCTGGAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGGCCCTACGTGGGCTACCAGGTGATGCGGGGCCTCATGCCCCTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100874 GGGCCCTACGTGGGCTACCAGGTGATGCGGGGCCTCATGCCCCTGGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTGTGTCCACCCTCTACTCTACATGGCCGCAGTGCCCAGCCTGGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100924 CTGTGTCCACCCTCTACTCTACATGGCCGCAGTGCCCAGCCTGGGCTGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCTGCCGACACTGCCCCGGCTACAGGGACAGCTGGAACCCAGAGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100974 GCTGCCGACACTGCCCCGGCTACAGGGACAGCTGGAACCCAGAGGACGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AAGAGCACTGGCCAAGCCCTGCCCCTCAATGCCACAGCCGCCCCTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101024 AAGAGCACTGGCCAAGCCCTGCCCCTCAATGCCACAGCCGCCCCTAAACC

   1100     .    :    .    :    .    :
   1092 GTCAGAGCCCCAGTCCCGTGAGCTGAGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101074 GTCAGAGCCCCAGTCCCGTGAGCTGAGCCAA