seq1 = pF1KE9564.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KE9564/gi568815579r_14372563.tfa (gi568815579r:14372563_14574320), 201758 bp

>pF1KE9564 1206
>gi568815579r:14372563_14574320 (Chr19)

(complement)

1-942  (100001-100942)   100% ->
943-1206  (101495-101758)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCTTGCGGGCCCCTCAACCTGAGCCTGGCGGGCGAGGCGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCTTGCGGGCCCCTCAACCTGAGCCTGGCGGGCGAGGCGACCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCGCGGCGCCCTGGGTCCCCAACACGTCGGCCGTGCCGCCGTCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCGCGGCGCCCTGGGTCCCCAACACGTCGGCCGTGCCGCCGTCGGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCGCCCGCGCTGCCCATCTTCTCCATGACGCTGGGCGCCGTGTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCGCCCGCGCTGCCCATCTTCTCCATGACGCTGGGCGCCGTGTCCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGGCGCTGGCGCTGCTGGCGCAGGCCGCGGGCCGCCTGCGACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGGCGCTGGCGCTGCTGGCGCAGGCCGCGGGCCGCCTGCGACGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCTCGGCCGCCACCTTCCTGCTGTTCGTGGCCAGCCTGCTGGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCTCGGCCGCCACCTTCCTGCTGTTCGTGGCCAGCCTGCTGGCCACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGGCGGGCCACGTGATCCCGGGCGCGCTGGTGCTGCGTCTGTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGGCGGGCCACGTGATCCCGGGCGCGCTGGTGCTGCGTCTGTACACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGGGCGCGCTCCGGCCGGCGGGGCCTGCCACTTCCTGGGCGGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGGGCGCGCTCCGGCCGGCGGGGCCTGCCACTTCCTGGGCGGCTGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCTTCTTCGGCCTGTGCCCGCTGCTGCTGGGCTGTGGCATGGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCTTCTTCGGCCTGTGCCCGCTGCTGCTGGGCTGTGGCATGGCCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCGCTGCGTGGGCGTCACGCGGCCGCTGCTCCACGCCGCGCGGGTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCGCTGCGTGGGCGTCACGCGGCCGCTGCTCCACGCCGCGCGGGTCTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCGCCCGCGCGCGCCTGGCGCTGGCCGCGGTGGCCGCGGTGGCCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCGCCCGCGCGCGCCTGGCGCTGGCCGCGGTGGCCGCGGTGGCCTTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTGGCGCTGCTGCCGCTGGCGCGCGTGGGCCGCTATGAGCTGCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTGGCGCTGCTGCCGCTGGCGCGCGTGGGCCGCTATGAGCTGCAGTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGGCACGTGGTGCTTCATCGGCCTGGGTCCCCCGGGCGGCTGGCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGGCACGTGGTGCTTCATCGGCCTGGGTCCCCCGGGCGGCTGGCGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCACTGCTTGCTGGCCTCTTCGCCAGCCTCGGCCTGGTCGCGCTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCACTGCTTGCTGGCCTCTTCGCCAGCCTCGGCCTGGTCGCGCTCCTCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGCGCTGGTGTGCAACACGCTCAGCGGCCTGGCCCTGCTACGCGCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGCGCTGGTGTGCAACACGCTCAGCGGCCTGGCCCTGCTACGCGCCCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCGACGCCGCTCCCGACGGCCTCCCCCGGCCTCAGGCCCCGACAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCGACGCCGCTCCCGACGGCCTCCCCCGGCCTCAGGCCCCGACAGCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGTCGCTGGGGGGCGCACGGACCCCGCTCGGCCTCCGCCTCGTCCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGTCGCTGGGGGGCGCACGGACCCCGCTCGGCCTCCGCCTCGTCCGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCCATCGCTTCGGCCTCCACCTTCTTTGGCGGCTCTCGGAGCAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCCATCGCTTCGGCCTCCACCTTCTTTGGCGGCTCTCGGAGCAGCGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGCACGCAGAGCTCGCGCCCACGACGTGGAGATGGTGGGCCAGCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGGCACGCAGAGCTCGCGCCCACGACGTGGAGATGGTGGGCCAGCTTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGTATCATGGTGGTGTCGTGCATCTGCTGGAGCCCAATGCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100901 GGTATCATGGTGGTGTCGTGCATCTGCTGGAGCCCAATGCTGGTG...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    943  GTGTTGGTGGCGCTGGCCGTCGGCGGCTGGAGCTCTACCTCCCTGCAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101494 GGTGTTGGTGGCGCTGGCCGTCGGCGGCTGGAGCTCTACCTCCCTGCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGCCACTGTTCCTGGCCGTGCGCCTTGCCTCCTGGAACCAGATCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101544 GGCCACTGTTCCTGGCCGTGCGCCTTGCCTCCTGGAACCAGATCCTGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCTTGGGTGTACATCCTACTGCGCCAGGCCGTGCTGCGCCAACTGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101594 CCTTGGGTGTACATCCTACTGCGCCAGGCCGTGCTGCGCCAACTGCTTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CCTCTTGCCCCCGAGGGCCGGAGCCAAGGGCGGCCCCGCGGGGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101644 CCTCTTGCCCCCGAGGGCCGGAGCCAAGGGCGGCCCCGCGGGGCTGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TAACACCGAGCGCCTGGGAGGCCAGCTCGCTGCGCAGCTCCCGGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101694 TAACACCGAGCGCCTGGGAGGCCAGCTCGCTGCGCAGCTCCCGGCACAGC

   1200     .    :    .
   1192 GGCCTCAGCCACTTC
        |||||||||||||||
 101744 GGCCTCAGCCACTTC