seq1 = pF1KE9559.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KE9559/gi568815579r_19524259.tfa (gi568815579r:19524259_19727284), 203026 bp

>pF1KE9559 1053
>gi568815579r:19524259_19727284 (Chr19)

(complement)

1-742  (100001-100742)   100% ->
743-1053  (102716-103026)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCATCATGGGCCAGTGCTACTACAACGAGACCATCGGCTTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCATCATGGGCCAGTGCTACTACAACGAGACCATCGGCTTCTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAACAACAGTGGCAAAGAGCTCAGCTCCCACTGGCGGCCCAAGGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAACAACAGTGGCAAAGAGCTCAGCTCCCACTGGCGGCCCAAGGATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGGTGGCACTGGGGCTGACCGTCAGCGTGCTGGTGCTGCTGACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGTGGTGGCACTGGGGCTGACCGTCAGCGTGCTGGTGCTGCTGACCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGGTCATAGCAGCCATCGCCTCCAACCGCCGCTTCCACCAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGGTCATAGCAGCCATCGCCTCCAACCGCCGCTTCCACCAGCCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTACCTGCTCGGCAATCTGGCCGCGGCTGACCTCTTCGCGGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTACCTGCTCGGCAATCTGGCCGCGGCTGACCTCTTCGCGGGCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTACCTCTTCCTCATGTTCCACACTGGTCCCCGCACAGCCCGACTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTACCTCTTCCTCATGTTCCACACTGGTCCCCGCACAGCCCGACTTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTGAGGGCTGGTTCCTGCGGCAGGGCTTGCTGGACACAAGCCTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTGAGGGCTGGTTCCTGCGGCAGGGCTTGCTGGACACAAGCCTCACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCGGTGGCCACACTGCTGGCCATCGCCGTGGAGCGGCACCGCAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCGGTGGCCACACTGCTGGCCATCGCCGTGGAGCGGCACCGCAGTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCGTGCAGCTGCACAGCCGCCTGCCCCGTGGCCGCGTGGTCATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCGTGCAGCTGCACAGCCGCCTGCCCCGTGGCCGCGTGGTCATGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGTGGGCGTGTGGGTGGCTGCCCTGGGCCTGGGGCTGCTGCCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGTGGGCGTGTGGGTGGCTGCCCTGGGCCTGGGGCTGCTGCCTGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCTGGCACTGCCTCTGTGCCCTGGACCGCTGCTCACGCATGGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCTGGCACTGCCTCTGTGCCCTGGACCGCTGCTCACGCATGGCACCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAGCCGCTCCTATTTGGCCGTCTGGGCTCTGTCGAGCCTGCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCAGCCGCTCCTATTTGGCCGTCTGGGCTCTGTCGAGCCTGCTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCTGCTCATGGTGGCTGTGTACACCCGCATTTTCTTCTACGTGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCTGCTCATGGTGGCTGTGTACACCCGCATTTTCTTCTACGTGCGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGAGTGCAGCGCATGGCAGAGCATGTCAGCTGCCACCCCCGCTACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGAGTGCAGCGCATGGCAGAGCATGTCAGCTGCCACCCCCGCTACCGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGACCACGCTCAGCCTGGTCAAGACTGTTGTCATCATCCTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100701 AGACCACGCTCAGCCTGGTCAAGACTGTTGTCATCATCCTGGGTA...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    743  GGGCGTTCGTGGTCTGCTGGACACCAGGCCAGGTGGTACTGCTCCTGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102715 GGGGCGTTCGTGGTCTGCTGGACACCAGGCCAGGTGGTACTGCTCCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGGTTTAGGCTGTGAGTCCTGCAATGTCCTGGCTGTAGAAAAGTACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102765 TGGTTTAGGCTGTGAGTCCTGCAATGTCCTGGCTGTAGAAAAGTACTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TACTGTTGGCCGAGGCCAACTCACTGGTCAATGCTGCTGTGTACTCTTGC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 102815 TACTGTTGGCCGAGGCCAACTCCCTGGTCAATGCTGCTGTGTACTCTTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGAGATGCTGAGATGCGCCGCACCTTCCGCCGCCTTCTCTGCTGCGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102865 CGAGATGCTGAGATGCGCCGCACCTTCCGCCGCCTTCTCTGCTGCGCGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCTCCGCCAGTCCACCCGCGAGTCTGTCCACTATACATCCTCTGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102915 CCTCCGCCAGTCCACCCGCGAGTCTGTCCACTATACATCCTCTGCCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GAGGTGCCAGCACTCGCATCATGCTTCCCGAGAACGGCCACCCACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102965 GAGGTGCCAGCACTCGCATCATGCTTCCCGAGAACGGCCACCCACTGATG

   1050     .    :
   1042 GACTCCACCCTT
        ||||||||||||
 103015 GACTCCACCCTT