Result of SIM4 for
pF1KE9555
seq1 = pF1KE9555.tfa, 3540 bp
seq2 = pF1KE9555/gi568815587r_88408595.tfa (gi568815587r:88408595_89147872), 739278 bp
>pF1KE9555 3540
>gi568815587r:88408595_89147872 (Chr11)
(complement)
1-661 (100001-100661) 100% ->
662-911 (297718-297967) 99% ->
912-1147 (494470-494705) 100% ->
1148-1394 (542909-543155) 99% ->
1395-1563 (550521-550689) 100% ->
1564-1690 (557146-557272) 100% ->
1691-2630 (579881-580820) 100% ->
2631-3540 (638369-639278) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGTCCTTCTGTTGATCCTGTCAGTCTTACTTTTGAAAGAAGATGTCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGTCCTTCTGTTGATCCTGTCAGTCTTACTTTTGAAAGAAGATGTCCG
50 . : . : . : . : . :
51 TGGGAGTGCACAGTCCAGTGAGAGGAGGGTGGTGGCTCACATGCCGGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGGGAGTGCACAGTCCAGTGAGAGGAGGGTGGTGGCTCACATGCCGGGTG
100 . : . : . : . : . :
101 ACATCATTATTGGAGCTCTCTTTTCTGTTCATCACCAGCCTACTGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACATCATTATTGGAGCTCTCTTTTCTGTTCATCACCAGCCTACTGTGGAC
150 . : . : . : . : . :
151 AAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCGGTCCGTGAACAGTATGGCATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 AAAGTTCATGAGAGGAAGTGTGGGGCGGTCCGTGAACAGTATGGCATTCA
200 . : . : . : . : . :
201 GAGAGTGGAGGCCATGCTGCATACCCTGGAAAGGATCAATTCAGACCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GAGAGTGGAGGCCATGCTGCATACCCTGGAAAGGATCAATTCAGACCCCA
250 . : . : . : . : . :
251 CACTCTTGCCCAACATCACACTGGGCTGTGAGATAAGGGACTCCTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CACTCTTGCCCAACATCACACTGGGCTGTGAGATAAGGGACTCCTGCTGG
300 . : . : . : . : . :
301 CATTCGGCTGTGGCCCTAGAGCAGAGCATTGAGTTCATAAGAGATTCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CATTCGGCTGTGGCCCTAGAGCAGAGCATTGAGTTCATAAGAGATTCCCT
350 . : . : . : . : . :
351 CATTTCTTCAGAAGAGGAAGAAGGCTTGGTACGCTGTGTGGATGGCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CATTTCTTCAGAAGAGGAAGAAGGCTTGGTACGCTGTGTGGATGGCTCCT
400 . : . : . : . : . :
401 CCTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAGCCCATAGTAGGGGTCATTGGGCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CCTCTTCCTTCCGCTCCAAGAAGCCCATAGTAGGGGTCATTGGGCCTGGC
450 . : . : . : . : . :
451 TCCAGTTCTGTAGCCATTCAGGTCCAGAATTTGCTCCAGCTTTTCAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TCCAGTTCTGTAGCCATTCAGGTCCAGAATTTGCTCCAGCTTTTCAACAT
500 . : . : . : . : . :
501 ACCTCAGATTGCTTACTCAGCAACCAGCATGGATCTGAGTGACAAGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 ACCTCAGATTGCTTACTCAGCAACCAGCATGGATCTGAGTGACAAGACTC
550 . : . : . : . : . :
551 TGTTCAAATATTTCATGAGGGTTGTGCCTTCAGATGCTCAGCAGGCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TGTTCAAATATTTCATGAGGGTTGTGCCTTCAGATGCTCAGCAGGCAAGG
600 . : . : . : . : . :
601 GCCATGGTGGACATAGTGAAGAGGTACAACTGGACCTATGTATCAGCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GCCATGGTGGACATAGTGAAGAGGTACAACTGGACCTATGTATCAGCCGT
650 . : . : . : . : . :
651 GCACACAGAAG GCAACTATGGAGAAAGTGGGATGGAAGCCT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
100651 GCACACAGAAGGTA...CAGGCAACTATGGAGAAAGTGGGATGGAAGCCT
700 . : . : . : . : . :
692 TCAAAGATATGTCGGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAAA
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
297748 TCAAAGATATGTCAGCGAAGGAAGGGATTTGCATCGCCCACTCTTACAAA
750 . : . : . : . : . :
742 ATCTACAGTAATGCAGGGGAGCAGAGCTTTGATAAGCTGCTGAAGAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
297798 ATCTACAGTAATGCAGGGGAGCAGAGCTTTGATAAGCTGCTGAAGAAGCT
800 . : . : . : . : . :
792 CACAAGTCACTTGCCCAAGGCCCGGGTGGTGGCCTGCTTCTGTGAGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
297848 CACAAGTCACTTGCCCAAGGCCCGGGTGGTGGCCTGCTTCTGTGAGGGCA
850 . : . : . : . : . :
842 TGACGGTGAGAGGTCTGCTGATGGCCATGAGGCGCCTGGGTCTAGCGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
297898 TGACGGTGAGAGGTCTGCTGATGGCCATGAGGCGCCTGGGTCTAGCGGGA
900 . : . : . : . : . :
892 GAATTTCTGCTTCTGGGCAG TGATGGCTGGGCTGACAGGTA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
297948 GAATTTCTGCTTCTGGGCAGGTG...CAGTGATGGCTGGGCTGACAGGTA
950 . : . : . : . : . :
933 TGATGTGACAGATGGATATCAGCGAGAAGCTGTTGGTGGCATCACAATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
494491 TGATGTGACAGATGGATATCAGCGAGAAGCTGTTGGTGGCATCACAATCA
1000 . : . : . : . : . :
983 AGCTCCAATCTCCCGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
494541 AGCTCCAATCTCCCGATGTCAAGTGGTTTGATGATTATTATCTGAAGCTC
1050 . : . : . : . : . :
1033 CGGCCAGAAACAAACCACCGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
494591 CGGCCAGAAACAAACCACCGAAACCCTTGGTTTCAAGAATTTTGGCAGCA
1100 . : . : . : . : . :
1083 TCGTTTTCAGTGCCGACTGGAAGGGTTTCCACAGGAGAACAGCAAATACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
494641 TCGTTTTCAGTGCCGACTGGAAGGGTTTCCACAGGAGAACAGCAAATACA
1150 . : . : . : . : . :
1133 ACAAGACTTGCAATA GTTCTCTGACTCTGAAAACACATCAT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
494691 ACAAGACTTGCAATAGTA...CAGGTTCTCTGACTCTGAAAACACATCAT
1200 . : . : . : . : . :
1174 GTTCAGGATTCCAAAATGGGATTTGTGATCAACGCCATCTATTCGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
542935 GTTCAGGATTCCAAAATGGGATTTGTGATCAACGCCATCTATTCGATGGC
1250 . : . : . : . : . :
1224 CTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTCTGCCCAGGCTATGCAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
542985 CTATGGGCTCCACAACATGCAGATGTCCCTCTGCCCAGGCTATGCAGGAC
1300 . : . : . : . : . :
1274 TCTGTGATGCCATGAAGCCAATTGATGGACGGAAACTTTTGGAGTCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
543035 TCTGTGATGCCATGAAGCCAATTGATGGACGGAAACTTTTGGAGTCCCTG
1350 . : . : . : . : . :
1324 ATGAAAACCAATTTTACTGGGGTTTCTGGAGATACGATCCTATTCGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
543085 ATGAAAACCAATTTTACTGGGGTTTCTGGAGATACGATCCTATTCGATGA
1400 . : . : . : . : . :
1374 GAATGGAGACTCCCCAGGAAG GTATGAAATAATGAATTTCA
|||||||||||| ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
543135 GAATGGAGACTCTCCAGGAAGGTA...AAGGTATGAAATAATGAATTTCA
1450 . : . : . : . : . :
1415 AGGAAATGGGAAAAGATTACTTTGATTATATCAACGTTGGAAGTTGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
550541 AGGAAATGGGAAAAGATTACTTTGATTATATCAACGTTGGAAGTTGGGAC
1500 . : . : . : . : . :
1465 AATGGAGAATTAAAAATGGATGATGATGAAGTATGGTCCAAGAAAAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
550591 AATGGAGAATTAAAAATGGATGATGATGAAGTATGGTCCAAGAAAAGCAA
1550 . : . : . : . : . :
1515 CATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCATGTGAGAAAGGCCAGATCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
550641 CATCATCAGATCTGTGTGCAGTGAACCATGTGAGAAAGGCCAGATCAAGG
1600 . : . : . : . : . :
1564 GTGATCCGAAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGTACA
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
550691 TA...TAGGTGATCCGAAAGGGAGAAGTCAGCTGTTGTTGGACCTGTACA
1650 . : . : . : . : . :
1606 CCTTGTAAGGAGAATGAGTATGTCTTTGATGAGTACACATGCAAGGCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
557188 CCTTGTAAGGAGAATGAGTATGTCTTTGATGAGTACACATGCAAGGCATG
1700 . : . : . : . : . :
1656 CCAACTGGGGTCTTGGCCCACTGATGATCTCACAG GTTGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
557238 CCAACTGGGGTCTTGGCCCACTGATGATCTCACAGGTA...CAGGTTGTG
1750 . : . : . : . : . :
1697 ACTTGATCCCAGTACAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAACCCATTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
579887 ACTTGATCCCAGTACAGTATCTTCGATGGGGTGACCCTGAACCCATTGCA
1800 . : . : . : . : . :
1747 GCTGTGGTGTTTGCCTGCCTTGGCCTCCTGGCCACCCTGTTTGTTACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
579937 GCTGTGGTGTTTGCCTGCCTTGGCCTCCTGGCCACCCTGTTTGTTACTGT
1850 . : . : . : . : . :
1797 AGTCTTCATCATTTACCGTGATACACCAGTAGTCAAGTCCTCAAGCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
579987 AGTCTTCATCATTTACCGTGATACACCAGTAGTCAAGTCCTCAAGCAGGG
1900 . : . : . : . : . :
1847 AACTCTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGCTACTTATGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580037 AACTCTGCTACATTATCCTTGCTGGCATCTGCCTGGGCTACTTATGTACC
1950 . : . : . : . : . :
1897 TTCTGCCTCATTGCGAAGCCCAAACAGATTTACTGCTACCTTCAGAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580087 TTCTGCCTCATTGCGAAGCCCAAACAGATTTACTGCTACCTTCAGAGAAT
2000 . : . : . : . : . :
1947 TGGCATTGGTCTCTCCCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580137 TGGCATTGGTCTCTCCCCAGCCATGAGCTACTCAGCCCTTGTAACAAAGA
2050 . : . : . : . : . :
1997 CCAACCGTATTGCAAGGATCCTGGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580187 CCAACCGTATTGCAAGGATCCTGGCTGGCAGCAAGAAGAAGATCTGTACC
2100 . : . : . : . : . :
2047 AAAAAGCCCAGATTCATGAGTGCCTGTGCCCAGCTAGTGATTGCTTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580237 AAAAAGCCCAGATTCATGAGTGCCTGTGCCCAGCTAGTGATTGCTTTCAT
2150 . : . : . : . : . :
2097 TCTCATATGCATCCAGTTGGGCATCATCGTTGCCCTCTTTATAATGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580287 TCTCATATGCATCCAGTTGGGCATCATCGTTGCCCTCTTTATAATGGAGC
2200 . : . : . : . : . :
2147 CTCCTGACATAATGCATGACTACCCAAGCATTCGAGAAGTCTACCTGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580337 CTCCTGACATAATGCATGACTACCCAAGCATTCGAGAAGTCTACCTGATC
2250 . : . : . : . : . :
2197 TGTAACACCACCAACCTAGGAGTTGTCACTCCACTTGGATACAATGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580387 TGTAACACCACCAACCTAGGAGTTGTCACTCCACTTGGATACAATGGATT
2300 . : . : . : . : . :
2247 GTTGATTTTGAGCTGCACCTTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580437 GTTGATTTTGAGCTGCACCTTCTATGCGTTCAAGACCAGAAATGTTCCAG
2350 . : . : . : . : . :
2297 CTAACTTCAACGAGGCCAAGTATATCGCCTTCACAATGTACACGACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580487 CTAACTTCAACGAGGCCAAGTATATCGCCTTCACAATGTACACGACCTGC
2400 . : . : . : . : . :
2347 ATTATATGGCTAGCTTTTGTGCCAATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580537 ATTATATGGCTAGCTTTTGTGCCAATCTACTTTGGCAGCAACTACAAAAT
2450 . : . : . : . : . :
2397 CATCACCATGTGTTTCTCGGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTAGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580587 CATCACCATGTGTTTCTCGGTCAGCCTCAGTGCCACAGTGGCCCTAGGCT
2500 . : . : . : . : . :
2447 GCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTGGCCAAACCAGAGAGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580637 GCATGTTTGTGCCGAAGGTGTACATCATCCTGGCCAAACCAGAGAGAAAC
2550 . : . : . : . : . :
2497 GTGCGCAGCGCCTTCACCACATCTACCGTGGTGCGCATGCATGTAGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580687 GTGCGCAGCGCCTTCACCACATCTACCGTGGTGCGCATGCATGTAGGGGA
2600 . : . : . : . : . :
2547 TGGCAAGTCATCCTCCGCAGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCAACCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
580737 TGGCAAGTCATCCTCCGCAGCCAGCAGATCCAGCAGCCTAGTCAACCTGT
2650 . : . : . : . : . :
2597 GGAAGAGAAGGGGCTCCTCTGGGGAAACCTTAAG TTCCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
580787 GGAAGAGAAGGGGCTCCTCTGGGGAAACCTTAAGGTA...CAGTTCCAAT
2700 . : . : . : . : . :
2638 GGAAAATCCGTCACGTGGGCCCAGAATGAGAAGAGCAGCCGGGGGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638376 GGAAAATCCGTCACGTGGGCCCAGAATGAGAAGAGCAGCCGGGGGCAGCA
2750 . : . : . : . : . :
2688 CCTGTGGCAGCGCCTGTCCATCCACATCAACAAGAAAGAAAACCCCAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638426 CCTGTGGCAGCGCCTGTCCATCCACATCAACAAGAAAGAAAACCCCAACC
2800 . : . : . : . : . :
2738 AAACGGCCGTCATCAAGCCCTTCCCCAAGAGCACGGAGAGCCGTGGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638476 AAACGGCCGTCATCAAGCCCTTCCCCAAGAGCACGGAGAGCCGTGGCCTG
2850 . : . : . : . : . :
2788 GGCGCTGGCGCTGGCGCAGGCGGGAGCGCTGGGGGCGTGGGGGCCACGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638526 GGCGCTGGCGCTGGCGCAGGCGGGAGCGCTGGGGGCGTGGGGGCCACGGG
2900 . : . : . : . : . :
2838 CGGTGCGGGCTGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCGGGCCCGAGTCCCCAGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638576 CGGTGCGGGCTGCGCAGGCGCCGGCCCAGGCGGGCCCGAGTCCCCAGACG
2950 . : . : . : . : . :
2888 CCGGCCCCAAGGCGCTGTATGATGTGGCCGAGGCTGAGGAGCACTTCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638626 CCGGCCCCAAGGCGCTGTATGATGTGGCCGAGGCTGAGGAGCACTTCCCG
3000 . : . : . : . : . :
2938 GCGCCCGCGCGGCCGCGCTCACCGTCGCCCATCAGCACGCTGAGCCACCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638676 GCGCCCGCGCGGCCGCGCTCACCGTCGCCCATCAGCACGCTGAGCCACCG
3050 . : . : . : . : . :
2988 CGCGGGCTCGGCCAGCCGCACGGACGACGATGTGCCGTCGCTGCACTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638726 CGCGGGCTCGGCCAGCCGCACGGACGACGATGTGCCGTCGCTGCACTCGG
3100 . : . : . : . : . :
3038 AGCCTGTGGCGCGCAGCAGCTCCTCGCAGGGCTCCCTCATGGAGCAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638776 AGCCTGTGGCGCGCAGCAGCTCCTCGCAGGGCTCCCTCATGGAGCAGATC
3150 . : . : . : . : . :
3088 AGCAGTGTGGTCACCCGCTTCACGGCCAACATCAGCGAGCTCAACTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638826 AGCAGTGTGGTCACCCGCTTCACGGCCAACATCAGCGAGCTCAACTCCAT
3200 . : . : . : . : . :
3138 GATGCTGTCCACCGCGGCCCCCAGCCCCGGCGTCGGCGCCCCGCTCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638876 GATGCTGTCCACCGCGGCCCCCAGCCCCGGCGTCGGCGCCCCGCTCTGCT
3250 . : . : . : . : . :
3188 CGTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGTTGCCCACGACCATGACGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638926 CGTCCTACCTGATCCCCAAAGAGATCCAGTTGCCCACGACCATGACGACC
3300 . : . : . : . : . :
3238 TTTGCCGAAATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAAGTCACGGGCGGCGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
638976 TTTGCCGAAATCCAGCCTCTGCCGGCCATCGAAGTCACGGGAGGCGCGCA
3350 . : . : . : . : . :
3288 GCCCGCGGCAGGGGCGCAGGCGGCTGGGGACGCGGCCCGGGAGAGCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
639026 GCCCGCGGCAGGGGCGCAGGCGGCTGGGGACGCGGCCCGGGAGAGCCCCG
3400 . : . : . : . : . :
3338 CGGCCGGTCCCGAGGCTGCGGCCGCCAAGCCAGACCTGGAGGAGCTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
639076 CGGCCGGTCCCGAGGCTGCGGCCGCCAAGCCAGACCTGGAGGAGCTGGTG
3450 . : . : . : . : . :
3388 GCTCTCACCCCGCCGTCCCCCTTCAGAGACTCGGTGGACTCGGGGAGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
639126 GCTCTCACCCCGCCGTCCCCCTTCAGAGACTCGGTGGACTCGGGGAGCAC
3500 . : . : . : . : . :
3438 AACCCCCAACTCGCCAGTGTCCGAGTCGGCCCTCTGTATCCCGTCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
639176 AACCCCCAACTCGCCAGTGTCCGAGTCGGCCCTCTGTATCCCGTCGTCTC
3550 . : . : . : . : . :
3488 CCAAATATGACACTCTTATCATAAGAGATTACACTCAGAGCTCCTCGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
639226 CCAAATATGACACTCTTATCATAAGAGATTACACTCAGAGCTCCTCGTCG
3600
3538 TTG
|||
639276 TTG