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seq2 = pF1KE9542/gi568815594f_158421977.tfa (gi568815594f:158421977_158752052), 330076 bp

>pF1KE9542 2271
>gi568815594f:158421977_158752052 (Chr4)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-187  (150722-150859)   100% ->
188-286  (171425-171523)   100% ->
287-392  (177350-177455)   100% ->
393-464  (183092-183163)   100% ->
465-536  (185996-186067)   100% ->
537-608  (190154-190225)   100% ->
609-680  (190315-190386)   100% ->
681-755  (195155-195229)   100% ->
756-827  (204844-204915)   100% ->
828-899  (206662-206733)   98% ->
900-971  (211429-211500)   100% ->
972-1043  (216032-216103)   100% ->
1044-1115  (217284-217355)   100% ->
1116-1345  (222933-223162)   100% ->
1346-1756  (224815-225225)   100% ->
1757-1975  (226523-226741)   100% ->
1976-2271  (229781-230076)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         TTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGTCAAGTGCTCCCTTGGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGTCAAGTGCTCCCTTGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150764 ATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACGGTGTGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 150814 AACGGTGTGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGTG.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      GAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAATATTTTGCCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150864 ..TAGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAATATTTTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171470 GTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTT         TGGTCGGTTCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171520 TGTTGTA...CAGTGGTCGGTTCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATCGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177387 TCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATCGGTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTCAAATGTGACTGCAAT         GTCACTTCAGTGGAACTTAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 177437 CTTCAAATGTGACTGCAATGTA...CAGGTCACTTCAGTGGAACTTAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAATTATCATGATCTTCAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183114 AGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAATTATCATGATCTTCAGAAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465          GTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183164 GTA...CAGGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTTTCAGAGGACTGAATAGCCTTACTAAACT         GTATCTCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 186037 CTTTCAGAGGACTGAATAGCCTTACTAAACTGTA...CAGGTATCTCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190164 CATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTCACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACTAGAATGGCT         GATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 190214 ACTAGAATGGCTGTA...CAGGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAATTCTCTTATTCTCTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 190344 TTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAATTCTCTTATTCTCTTGTA...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    681   AGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195153 AGAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCAACACATGCCAAGACTACATTGGCT         GGACCTTGAAGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 195203 TCAACACATGCCAAGACTACATTGGCTGTA...CAGGGACCTTGAAGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCAGTAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204858 ACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCAGTAATTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ACTGTTTT         AGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACCTAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| ||||
 204908 ACTGTTTTGTA...CAGAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAACTGGATGAATT         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 206695 TGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAACTGGATGAATTGTA...CAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 ATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211431 ATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 CTGAAGGAGCTGTCACAATT         GAATCTTTCCTATAATCCAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 211481 CTGAAGGAGCTGTCACAATTGTA...CAGGAATCTTTCCTATAATCCAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 CCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCAAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216053 CCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCAAGTCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 T         CAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216103 TGTA...TAGCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084 ATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCTCACAT         ATATTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 217324 ATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCTCACATGTA...CAGATATTTTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125 GAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222942 GAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1175 ACACTGATGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222992 ACACTGATGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225 AGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCTGCTTTGGAAACATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223042 AGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCTGCTTTGGAAACATTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 TGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223092 TGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TGTCAATCATTTCTCTCTGCT         GTGCCGACTGCTTAATGGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 223142 TGTCAATCATTTCTCTCTGCTGTG...TAGGTGCCGACTGCTTAATGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 ATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCGTGGAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224835 ATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCGTGGAGAATA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224885 CAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 GATCTTTGGCCATTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224935 GATCTTTGGCCATTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTTAGATGTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224985 CTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTTAGATGTGTGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 ACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225035 ACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GTTTTATAGTGGCTTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225085 GTTTTATAGTGGCTTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATTCAGAAGATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225135 TACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATTCAGAAGATACAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 225185 AAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTA...TAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 GTATTAATTTGGCCGCATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226523 GTATTAATTTGGCCGCATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 TTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226573 TTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACGGAATCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 AGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226623 AGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CTGATGCATTATGCTGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226673 CTGATGCATTATGCTGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CTTCAGGTAGAAATACCAG         GTACCATAACCTCTTGGGTAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 226723 CTTCAGGTAGAAATACCAGGTA...TAGGTACCATAACCTCTTGGGTAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229803 GATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TGACCACAAGACCATTTAAAGAAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229853 TGACCACAAGACCATTTAAAGAAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 AGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229903 AGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCATC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 ATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229953 ATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TGAAGCCGGACCTTTTCACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230003 TGAAGCCGGACCTTTTCACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAA

   2400     .    :    .    :
   2248 TCAACGAGACTCAATTCCTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||
 230053 TCAACGAGACTCAATTCCTATTCA