seq1 = pF1KE9416.tfa, 1620 bp
seq2 = pF1KE9416/gi568815596r_53753137.tfa (gi568815596r:53753137_53954756), 201620 bp

>pF1KE9416 1620
>gi568815596r:53753137_53954756 (Chr2)

(complement)

1-1620  (100001-101620)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCAACAGGCCACCTTCAGGATGCCCCCAATGCCACCTCGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTCAACAGGCCACCTTCAGGATGCCCCCAATGCCACCTCGCTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGCCTCACTCACAGGAAGGAAACAGCACCTCTCTCCAGGAGGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGCCTCACTCACAGGAAGGAAACAGCACCTCTCTCCAGGAGGGTCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATCTCATCCACACAGCCACCTTGGTGACCTGTACTTTTCTACTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATCTCATCCACACAGCCACCTTGGTGACCTGTACTTTTCTACTGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCATCTTCTGCCTGGGTTCCTATGGCAACTTCATTGTCTTCTTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCATCTTCTGCCTGGGTTCCTATGGCAACTTCATTGTCTTCTTGTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCGATCCAGCCTTCAGGAAATTCAGAACCAACTTTGATTTCATGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCGATCCAGCCTTCAGGAAATTCAGAACCAACTTTGATTTCATGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAACCTGTCCTTCTGTGACCTCTTCATTTGTGGAGTGACAGCCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAACCTGTCCTTCTGTGACCTCTTCATTTGTGGAGTGACAGCCCCCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCACCTTTGTGTTATTCTTCAGCTCAGCCAGTAGTATCCCGGATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCACCTTTGTGTTATTCTTCAGCTCAGCCAGTAGTATCCCGGATGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCTTCACTTTCCATCTCACCAGTTCAGGCTTCATCATCATGTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCTTCACTTTCCATCTCACCAGTTCAGGCTTCATCATCATGTCTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGACAGTGGCAGTGATCGCCCTGCACCGGCTCCGGATGGTGTTGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGACAGTGGCAGTGATCGCCCTGCACCGGCTCCGGATGGTGTTGGGGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCCTAATCGCACGGCCTCCTTTCCCTGCACCGTACTCCTCACCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCCTAATCGCACGGCCTCCTTTCCCTGCACCGTACTCCTCACCCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTCTGGGCCACCAGTTTCACCCTTGCCACCTTGGCTACCTTGAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTCTGGGCCACCAGTTTCACCCTTGCCACCTTGGCTACCTTGAAAACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGTCCCACCTCTGTCTTCCCATGTCCAGTCTGATTGCTGGAAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGTCCCACCTCTGTCTTCCCATGTCCAGTCTGATTGCTGGAAAAGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAGCCATTTTGTCTCTCTATGTGGTCGACTTCACCTTCTGTGTTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAGCCATTTTGTCTCTCTATGTGGTCGACTTCACCTTCTGTGTTGCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTCTCTGTCTCTTACATCATGATTGCTCAGACCCTGCGGAAGAACGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTCTCTGTCTCTTACATCATGATTGCTCAGACCCTGCGGAAGAACGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGTCAGAAAGTGCCCCCCTGTAATCACAGTCGATGCTTCCAGACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGTCAGAAAGTGCCCCCCTGTAATCACAGTCGATGCTTCCAGACCACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTTTCATGGGGGTCCCTGTGCAGGGAGGTGGAGATCCCATCCAGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTTTCATGGGGGTCCCTGTGCAGGGAGGTGGAGATCCCATCCAGTGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGCCGGCTCTGTATAGGAACCAGAATTACAACAAACTGCAGCACGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGCCGGCTCTGTATAGGAACCAGAATTACAACAAACTGCAGCACGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGACCCGTGGATATACCAAGAGTCCCAACCAACTGGTCACCCCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGACCCGTGGATATACCAAGAGTCCCAACCAACTGGTCACCCCTGCAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCCGACTCCAGCTCGTATCAGCCATCAACCTCTCCACTGCCAAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCCGACTCCAGCTCGTATCAGCCATCAACCTCTCCACTGCCAAGGATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAGCCGTGGTCACCTGTGTGATCATTGTGCTGTCAGTCCTGGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAGCCGTGGTCACCTGTGTGATCATTGTGCTGTCAGTCCTGGTGTGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GTCTTCCACTGGGGATTTCCTTGGTACAGGTGGTTCTCTCCAGCAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTCTTCCACTGGGGATTTCCTTGGTACAGGTGGTTCTCTCCAGCAATGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGCTTCATTCTTTACCAGTTTGAATTGTTTGGATTTACTCTTATATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGCTTCATTCTTTACCAGTTTGAATTGTTTGGATTTACTCTTATATTTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAAGTCAGGATTAAACCCTTTTATATATTCTCGGAACAGTGCAGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAGTCAGGATTAAACCCTTTTATATATTCTCGGAACAGTGCAGGGCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GAAGGAAAGTGCTCTGGTGCCTCCAATACATAGGCCTGGGTTTTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GAAGGAAAGTGCTCTGGTGCCTCCAATACATAGGCCTGGGTTTTTTCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TGCAAACAAAAGACTCGACTTCGAGCCATGGGAAAAGGGAACCTCGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TGCAAACAAAAGACTCGACTTCGAGCCATGGGAAAAGGGAACCTCGAAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAACAGAAACAAATCCTCCCATCATGAAACAAACTCTGCCTACATGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAACAGAAACAAATCCTCCCATCATGAAACAAACTCTGCCTACATGTTAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTCCAAAGCCACAGAAGAAATTTGTGGACCAGGCTTGTGGCCCAAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTCCAAAGCCACAGAAGAAATTTGTGGACCAGGCTTGTGGCCCAAGTCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCAAAAGAAAGTATGGTGAGTCCCAAGATCTCTGCTGGACATCAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCAAAAGAAAGTATGGTGAGTCCCAAGATCTCTGCTGGACATCAACACTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGTCAGAGCAGCTCGACCCCCATCAACACTCGGATTGAACCTTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGGTCAGAGCAGCTCGACCCCCATCAACACTCGGATTGAACCTTACTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCATCTATAACAGCAGCCCTTCCCAGGAGGAGAGCAGCCCATGTAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GCATCTATAACAGCAGCCCTTCCCAGGAGGAGAGCAGCCCATGTAACTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGCCAGTAAACTCTTTTGGATTTGCCAATTCATATATTGCCATGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGCCAGTAAACTCTTTTGGATTTGCCAATTCATATATTGCCATGCATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCACACCACTAATGACTTAGTGCAGGAATATGACAGCACTTCAGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCACACCACTAATGACTTAGTGCAGGAATATGACAGCACTTCAGCCAAGC

   1600     .    :    .    :
   1601 AGATTCCAGTCCCCTCCGTT
        ||||||||||||||||||||
 101601 AGATTCCAGTCCCCTCCGTT