seq1 = pF1KE9410.tfa, 957 bp
seq2 = pF1KE9410/gi568815592r_167056875.tfa (gi568815592r:167056875_167257831), 200957 bp

>pF1KE9410 957
>gi568815592r:167056875_167257831 (Chr6)

(complement)

1-957  (100001-100957)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCATTCCCAAACTGCTCAGCCCCCAGCACTGTGGTGGCCACAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCATTCCCAAACTGCTCAGCCCCCAGCACTGTGGTGGCCACAGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTGTCTTGCTGGGGCTGGAGTGTGGGCTGGGTCTGCTGGGCAACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTGTCTTGCTGGGGCTGGAGTGTGGGCTGGGTCTGCTGGGCAACGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCGCTGTGGACCTTCCTGTTCCGGGTCAGGGTGTGGAAGCCGTACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCGCTGTGGACCTTCCTGTTCCGGGTCAGGGTGTGGAAGCCGTACGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTACCTGCTCAACCTGGCCCTGGCTGACCTGCTGTTGGCTGCGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTACCTGCTCAACCTGGCCCTGGCTGACCTGCTGTTGGCTGCGTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCTTTCCTGGCCGCCTTCTACCTGAGCCTCCAGGCTTGGCATCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCTTTCCTGGCCGCCTTCTACCTGAGCCTCCAGGCTTGGCATCTGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGTGGGCTGCTGGGCCCTGCGCTTCCTGCTGGACCTCAGCCGCAGCGTG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGTGGGCTGCTGGGCCCTGCACTTCCTGCTGGACCTCAGCCGCAGCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGATGGCCTTCCTGGCCGCCGTGGCTTTGGACCGGTACCTCCGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGATGGCCTTCCTGGCCGCCGTGGCTTTGGACCGGTACCTCCGTGTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCACCCTCGGCTTAAGGTCAACCTGCTGTCTCCTCAGGCGGCCCTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCACCCTCGGCTTAAGGTCAACCTGCTGTCTCCTCAGGCGGCCCTGGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTCGGGCCTCGTCTGGCTCCTGATGGTCGCCCTCACCTGCCCGGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTCGGGCCTCGTCTGGCTCCTGATGGTCGCCCTCACCTGCCCGGGCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCATCTCTGAGGCCGCCCAGAACTCCACCAGGTGCCACAGTTTCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCATCTCTGAGGCCGCCCAGAACTCCACCAGGTGCCACAGTTTCTACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGGGCAGACGGCTCCTTCAGCATCATCTGGCAGGAAGCACTCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGGGCAGACGGCTCCTTCAGCATCATCTGGCAGGAAGCACTCTCCTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCAGTTTGTCCTCCCCTTTGGCCTCATCGTGTTCTGCAATGCAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCAGTTTGTCCTCCCCTTTGGCCTCATCGTGTTCTGCAATGCAGGCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGGGCTCTCCAGAAAAGACTCCGGGAGCCTGAGAAACAGCCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGGGCTCTCCAGAAAAGACTCCGGGAGCCTGAGAAACAGCCCAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCAGCGGGCCCAGGCACTGGTCACCTTGGTGGTGGTGCTGTTTGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCAGCGGGCCCAGGCACTGGTCACCTTGGTGGTGGTGCTGTTTGCTCTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTTTCTGCCCTGCTTCCTGGCCAGAGTCCTGATGCACATCTTCCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTTTCTGCCCTGCTTCCTGGCCAGAGTCCTGATGCACATCTTCCAGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGGGGAGCTGCAGGGCCCTTTGTGCAGTGGCTCATACCTCGGATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGGGGAGCTGCAGGGCCCTTTGTGCAGTGGCTCATACCTCGGATGTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGGCAGCCTCACCTACCTGCACAGTGTGCTCAACCCCGTGGTATACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGGCAGCCTCACCTACCTGCACAGTGTGCTCAACCCCGTGGTATACTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTCCAGCCCCACCTTCAGGAGCTCCTATCGGAGGGTCTTCCACACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTCCAGCCCCACCTTCAGGAGCTCCTATCGGAGGGTCTTCCACACCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGAGGCAAAGGGCAGGCAGCAGAGCCCCCAGATTTCAACCCCAGAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGAGGCAAAGGGCAGGCAGCAGAGCCCCCAGATTTCAACCCCAGAGACTC

    950     .
    951 CTATTCC
        |||||||
 100951 CTATTCC