seq1 = pF1KE9408.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KE9408/gi568815590r_141256850.tfa (gi568815590r:141256850_141457923), 201074 bp

>pF1KE9408 1074
>gi568815590r:141256850_141457923 (Chr8)

(complement)

1-1074  (100001-101074)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTCTGTGTCTCCAGCGGGGCCCTCGGCCGGGGCAGTCCCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTCTGTGTCTCCAGCGGGGCCCTCGGCCGGGGCAGTCCCCAATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGCAGTGACAACAGTGCGGACCAATGCCAGCGGGCTGGAGGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGCAGTGACAACAGTGCGGACCAATGCCAGCGGGCTGGAGGTGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTCCACCTGTTTGCCCGGCTGGACGAGGAGCTGCATGGCACCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTCCACCTGTTTGCCCGGCTGGACGAGGAGCTGCATGGCACCTTCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCTGTGGCTGGCGCTGATGGCGGTGCACGGAGCCATCTTCCTGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCTGTGGCTGGCGCTGATGGCGGTGCACGGAGCCATCTTCCTGGCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGTGCTCAACGGGCTGGCGCTGTACGTCTTCTGCTGCCGCACCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGTGCTCAACGGGCTGGCGCTGTACGTCTTCTGCTGCCGCACCCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAAGACACCCTCAGTCATCTACACCATCAACCTGGTGGTGACCGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAAGACACCCTCAGTCATCTACACCATCAACCTGGTGGTGACCGATCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTAGGGCTGTCCCTGCCCACGCGCTTCGCTGTGTACTACGGCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTAGGGCTGTCCCTGCCCACGCGCTTCGCTGTGTACTACGGCGCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCTGCCTGCGCTGTGCCTTCCCGCACGTCCTCGGTTACTTCCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCTGCCTGCGCTGTGCCTTCCCGCACGTCCTCGGTTACTTCCTCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCACTGCTCCATCCTCTTCCTCACCTGCATCTGCGTGGACCGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCACTGCTCCATCCTCTTCCTCACCTGCATCTGCGTGGACCGCTACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCATCGTGCGGCCTGAAGGCTCCCGCCGCTGCCGCCAGCCTGCCTGTGC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCATCGTGCGGCCCGAAGGCTCCCGCCGCTGCCGCCAGCCTGCCTGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGGGCCGTGTGCGCCTTCGTGTGGCTGGCCGCCGGTGCCGTCACCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGGGCCGTGTGCGCCTTCGTGTGGCTGGCCGCCGGTGCCGTCACCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGTGCTGGGCGTGACAGGCAGCCGGCCCTGCTGCCGTGTCTTTGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGTGCTGGGCGTGACAGGCAGCCGGCCCTGCTGCCGTGTCTTTGCGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGTCCTGGAGTTCCTGCTGCCTCTGCTGGTCATCAGCGTGTTTACCGG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGTCCTGGAGTTCCTGCTGCCCCTGCTGGTCATCAGCGTGTTTACCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGCATCATGTGTGCACTGTCGCGGCCGGGTCTGCTCCGCCAGGGTCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100651 CCGCATCATGTGTGCACTGTCGCGGCCGGGTCTGCTCCACCAGGGTCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCGCCGCGTGCGGGCCATGCAGCTCCTGCTCACGGTGCTCATCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCGCCGCGTGCGGGCCATGCAGCTCCTGCTCACGGTGCTCATCATCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCGTCTGCTTCACGCCCTTCCACGCCCGCCAAGTGGCCGTGGCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCGTCTGCTTCACGCCCTTCCACGCCCGCCAAGTGGCCGTGGCGCTGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCCGACATGCCACACCACACGAGCCTCGTGGTCTACCACGTGGCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCCGACATGCCACACCACACGAGCCTCGTGGTCTACCACGTGGCCGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTCAGCAGCCTCAACAGCTGCATGGACCCCATCGTCTACTGCTTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTCAGCAGCCTCAACAGCTGCATGGACCCCATCGTCTACTGCTTCGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAGTGGCTTCCAGGCCACCGTCCGAGGCCTCTTCGGCCAGCACGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCAGTGGCTTCCAGGCCACCGTCCGAGGCCTCTTCGGCCAGCACGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCGTGAGCCCAGCAGCGGTGACGTGGTCAGCATGCACAGGAGCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCGTGAGCCCAGCAGCGGTGACGTGGTCAGCATGCACAGGAGCTCCAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCTCAGGCCGTCATCACATCCTCAGTGCCGGCCCTCACGCCCTCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCTCAGGCCGTCATCACATCCTCAGTGCCGGCCCTCACGCCCTCACCCAG

   1050     .    :    .    :
   1051 GCCCTGGCTAATGGGCCCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCCTGGCTAATGGGCCCGAGGCT