seq1 = pF1KE9406.tfa, 1410 bp
seq2 = pF1KE9406/gi568815587r_67351315.tfa (gi568815587r:67351315_67552724), 201410 bp

>pF1KE9406 1410
>gi568815587r:67351315_67552724 (Chr11)

(complement)

1-1410  (100001-101410)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACTACCATGGAAGCTGACCTGGGTGCCACTGGCCACAGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACTACCATGGAAGCTGACCTGGGTGCCACTGGCCACAGGCCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGAGCTTGATGATGAGGACTCCTACCCCCAAGGTGGCTGGGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGAGCTTGATGATGAGGACTCCTACCCCCAAGGTGGCTGGGACACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCCTGGTGGCCCTGCTGCTCCTTGGGCTGCCAGCCAATGGGTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCCTGGTGGCCCTGCTGCTCCTTGGGCTGCCAGCCAATGGGTTGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGTGGCTGGCCGGCTCCCAGGCCCGGCATGGAGCTGGCACACGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100151 GCGTGGCTGGCCGGCTCCCAGGCCCGGCATGGAGCTGGCACGCGTCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCTCCTGCTCAGCCTGGCCCTCTCTGACTTCTTGTTCCTGGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCTCCTGCTCAGCCTGGCCCTCTCTGACTTCTTGTTCCTGGCAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCCTTCCAGATCCTAGAGATCCGGCATGGGGGACACTGGCCGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCCTTCCAGATCCTAGAGATCCGGCATGGGGGACACTGGCCGCTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACAGCTGCCTGCCGCTTCTACTACTTCCTATGGGGCGTGTCCTACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACAGCTGCCTGCCGCTTCTACTACTTCCTATGGGGCGTGTCCTACTCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCCTCTTCCTGCTGGCCGCCCTCAGCCTCGACCGCTGCCTGCTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGCCTCTTCCTGCTGGCCGCCCTCAGCCTCGACCGCTGCCTGCTGGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTGCCCACACTGGTACCCTGGGCACCGCCCAGTCCGCCTGCCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTGCCCACACTGGTACCCTGGGCACCGCCCAGTCCGCCTGCCCCTCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCTGCGCCGGTGTCTGGGTGCTGGCCACACTCTTCAGCGTGCCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCTGCGCCGGTGTCTGGGTGCTGGCCACACTCTTCAGCGTGCCCTGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCTTCCCCGAGGCTGCCGTCTGGTGGTACGACCTGGTCATCTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCTTCCCCGAGGCTGCCGTCTGGTGGTACGACCTGGTCATCTGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTCTGGGACAGCGAGGAGCTGTCGCTGAGGATGCTGGAGGTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTCTGGGACAGCGAGGAGCTGTCGCTGAGGATGCTGGAGGTCCTGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCTTCCTGCCTTTCCTCCTGCTGCTCGTCTGCCACGTGCTCACCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCTTCCTGCCTTTCCTCCTGCTGCTCGTCTGCCACGTGCTCACCCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACAGCCTGTCGCACCTGCCACCGCCAACAGCAGCCCGCAGCCTGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACAGCCTGTCGCACCTGCCACCGCCAACAGCAGCCCGCAGCCTGCCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTTCGCCCGTGTGGCCAGGACCATTCTGTCAGCCTATGTGGTCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTTCGCCCGTGTGGCCAGGACCATTCTGTCAGCCTATGTGGTCCTGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCCCTACCAGCTGGCCCAGCTGCTCTACCTGGCCTTCCTGTGGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCCCTACCAGCTGGCCCAGCTGCTCTACCTGGCCTTCCTGTGGGACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTACTCTGGCTACCTGCTCTGGGAGGCCCTGGTCTACTCCGACTACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACTCTGGCTACCTGCTCTGGGAGGCCCTGGTCTACTCCGACTACCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTACTCAACAGCTGCCTCAGCCCCTTCCTCTGCCTCATGGCCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTACTCAACAGCTGCCTCAGCCCCTTCCTCTGCCTCATGGCCAGTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GACCTCCGGACCCTGCTGCGCTCCGTGCTCTCGTCCTTCGCGGCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GACCTCCGGACCCTGCTGCGCTCCGTGCTCTCGTCCTTCGCGGCAGCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTGCGAGGAGCGGCCGGGCAGCTTCACGCCCACTGAGCCACAGACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTGCGAGGAGCGGCCGGGCAGCTTCACGCCCACTGAGCCACAGACCCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAGATTCTGAGGGTCCAACTCTGCCAGAGCCGATGGCAGAGGCCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAGATTCTGAGGGTCCAACTCTGCCAGAGCCGATGGCAGAGGCCCAGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGATGGATCCTGTGGCCCAGCCTCAGGTGAACCCCACACTCCAGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGATGGATCCTGTGGCCCAGCCTCAGGTGAACCCCACACTCCAGCCACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATCGGATCCCACAGCTCAGCCACAGCTGAACCCTACGGCCCAGCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ATCGGATCCCACAGCTCAGCCACAGCTGAACCCTACGGCCCAGCCACAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CGGATCCCACAGCCCAGCCACAGCTGAACCTCATGGCCCAGCCACAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CGGATCCCACAGCCCAGCCACAGCTGAACCTCATGGCCCAGCCACAGTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATTCTGTGGCCCAGCCACAGGCAGACACTAACGTCCAGACCCCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATTCTGTGGCCCAGCCACAGGCAGACACTAACGTCCAGACCCCTGCACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGCTGCCAGTTCTGTGCCCAGTCCCTGTGATGAAGCTTCCCCAACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGCTGCCAGTTCTGTGCCCAGTCCCTGTGATGAAGCTTCCCCAACCCCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCTCGCATCCTACCCCAGGGGCCCTTGAGGACCCAGCCACACCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCTCGCATCCTACCCCAGGGGCCCTTGAGGACCCAGCCACACCTCCTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCTGAAGGAGAAAGCCCCAGCAGCACCCCGCCAGAGGCGGCCCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCTGAAGGAGAAAGCCCCAGCAGCACCCCGCCAGAGGCGGCCCCGGGCGC

   1400     .    :
   1401 AGGCCCCACG
        ||||||||||
 101401 AGGCCCCACG