seq1 = pF1KE9401.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KE9401/gi568815575r_136930151.tfa (gi568815575r:136930151_137131674), 201524 bp

>pF1KE9401 1524
>gi568815575r:136930151_137131674 (ChrX)

(complement)

1-1524  (100001-101524)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGTCCACCTGCACCAACAGCACGCGCGAGAGTAACAGCAGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGTCCACCTGCACCAACAGCACGCGCGAGAGTAACAGCAGCCACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCATGCCCCTCTCCAAAATGCCCATCAGCCTGGCCCACGGCATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCATGCCCCTCTCCAAAATGCCCATCAGCCTGGCCCACGGCATCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCAACCGTGCTGGTTATCTTCCTCGCCGCCTCTTTCGTCGGCAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCAACCGTGCTGGTTATCTTCCTCGCCGCCTCTTTCGTCGGCAACATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGGCGCTAGTGTTGCAGCGCAAGCCGCAGCTGCTGCAGGTGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGGCGCTAGTGTTGCAGCGCAAGCCGCAGCTGCTGCAGGTGACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGTTTTATCTTTAACCTCCTCGTCACCGACCTGCTGCAGATTTCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGTTTTATCTTTAACCTCCTCGTCACCGACCTGCTGCAGATTTCGCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCCCCTGGGTGGTGGCCACCTCTGTGCCTCTCTTCTGGCCCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCCCCTGGGTGGTGGCCACCTCTGTGCCTCTCTTCTGGCCCCTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCACTTCTGCACGGCCCTGGTTAGCCTCACCCACCTGTTCGCCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCACTTCTGCACGGCCCTGGTTAGCCTCACCCACCTGTTCGCCTTCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCGTCAACACCATTGTCGTGGTGTCAGTGGATCGCTACTTGTCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCGTCAACACCATTGTCGTGGTGTCAGTGGATCGCTACTTGTCCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCACCCTCTCTCCTACCCGTCCAAGATGACCCAGCGCCGCGGTTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCACCCTCTCTCCTACCCGTCCAAGATGACCCAGCGCCGCGGTTACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCCTCTATGGCACCTGGATTGTGGCCATCCTGCAGAGCACTCCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCCTCTATGGCACCTGGATTGTGGCCATCCTGCAGAGCACTCCTCCACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACGGCTGGGGCCAGGCTGCCTTTGATGAGCGCAATGCTCTCTGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACGGCTGGGGCCAGGCTGCCTTTGATGAGCGCAATGCTCTCTGCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATCTGGGGGGCCAGCCCCAGCTACACTATTCTCAGCGTGGTGTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATCTGGGGGGCCAGCCCCAGCTACACTATTCTCAGCGTGGTGTCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGTCATTCCACTGATTGTCATGATTGCCTGCTACTCCGTGGTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCGTCATTCCACTGATTGTCATGATTGCCTGCTACTCCGTGGTGTTCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCAGCCCGGAGGCAGCATGCTCTGCTGTACAATGTCAAGAGACACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCAGCCCGGAGGCAGCATGCTCTGCTGTACAATGTCAAGAGACACAGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGAAGTGCGAGTCAAGGACTGTGTGGAGAATGAGGATGAAGAGGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGAAGTGCGAGTCAAGGACTGTGTGGAGAATGAGGATGAAGAGGGAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGAAGAAGGAGGAGTTCCAGGATGAGAGTGAGTTTCGCCGCCAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGAAGAAGGAGGAGTTCCAGGATGAGAGTGAGTTTCGCCGCCAGCATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGGTGAGGTCAAGGCCAAGGAGGGCAGAATGGAAGCCAAGGACGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGGTGAGGTCAAGGCCAAGGAGGGCAGAATGGAAGCCAAGGACGGCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAAGGCCAAGGAAGGAAGCACGGGGACCAGTGAGAGTAGTGTAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAAGGCCAAGGAAGGAAGCACGGGGACCAGTGAGAGTAGTGTAGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGGGGCAGCGAGGAGGTCAGAGAGAGCAGCACGGTGGCCAGCGACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGGGGCAGCGAGGAGGTCAGAGAGAGCAGCACGGTGGCCAGCGACGGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATGGAGGGTAAGGAAGGCAGCACCAAAGTTGAGGAGAACAGCATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATGGAGGGTAAGGAAGGCAGCACCAAAGTTGAGGAGAACAGCATGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CAGACAAGGGTCGCACAGAGGTCAACCAGTGCAGCATTGACTTGGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAGACAAGGGTCGCACAGAGGTCAACCAGTGCAGCATTGACTTGGGTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GATGACATGGAGTTTGGTGAAGACGACATCAATTTCAGTGAGGATGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GATGACATGGAGTTTGGTGAAGACGACATCAATTTCAGTGAGGATGACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGAGGCAGTGAACATCCCGGAGAGCCTCCCACCCAGTCGTCGTAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGAGGCAGTGAACATCCCGGAGAGCCTCCCACCCAGTCGTCGTAACAGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACAGCAACCCTCCTCTGCCCAGGTGCTACCAGTGCAAAGCTGCTAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACAGCAACCCTCCTCTGCCCAGGTGCTACCAGTGCAAAGCTGCTAAAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCTTCATCATCATTTTCTCCTATGTGCTATCCCTGGGGCCCTACTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATCTTCATCATCATTTTCTCCTATGTGCTATCCCTGGGGCCCTACTGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTAGCAGTCCTGGCCGTGTGGGTGGATGTCGAAACCCAGGTACCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTAGCAGTCCTGGCCGTGTGGGTGGATGTCGAAACCCAGGTACCCCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GGGTGATCACCATAATCATCTGGCTTTTCTTCCTGCAGTGCTGCATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GGGTGATCACCATAATCATCTGGCTTTTCTTCCTGCAGTGCTGCATCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCTATGTCTATGGCTACATGCACAAGACCATTAAGAAGGAAATCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCTATGTCTATGGCTACATGCACAAGACCATTAAGAAGGAAATCCAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CATGCTGAAGAAGTTCTTCTGCAAGGAAAAGCCCCCGAAAGAAGATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CATGCTGAAGAAGTTCTTCTGCAAGGAAAAGCCCCCGAAAGAAGATAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACCCAGACCTGCCCGGAACAGAGGGTGGGACTGAAGGCAAGATTGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACCCAGACCTGCCCGGAACAGAGGGTGGGACTGAAGGCAAGATTGTCCCT

   1500     .    :    .    :
   1501 TCCTACGATTCTGCTACTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||
 101501 TCCTACGATTCTGCTACTTTTCCT