seq1 = pF1KE9290.tfa, 957 bp
seq2 = pF1KE9290/gi568815586r_11033288.tfa (gi568815586r:11033288_11234244), 200957 bp

>pF1KE9290 957
>gi568815586r:11033288_11234244 (Chr12)

(complement)

1-957  (100001-100957)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATAACTTTTCTGCCCATCATTTTTTCCATTCTAATAGTGGTTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATAACTTTTCTGCCCATCATTTTTTCCATTCTAATAGTGGTTATATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCATTGGTAAATTCCATTG
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTATTGGAAATTTTGCTAATGGCTTCATAGCATTGGTAAATTCCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGTTGACCAAATTCTCACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTTTGTTGACCAAATTCTCACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTACTACATTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCGGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTGTTATTACTACATTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAACTCAGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAAGTAAGAATTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCAACTCAGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAAGTAAGAATTACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTATAATGTCTGGGCAGTAACCAACCATTTCAGCAGCTGGCTTGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTATAATGTCTGGGCAGTAACCAACCATTTCAGCAGCTGGCTTGCTACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCTCAGCATGTTTTATTTGCTCAGGATTGCCAATTTCTCCAACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCTCAGCATGTTTTATTTGCTCAGGATTGCCAATTTCTCCAACCTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTCTTCGCATAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTTGTTCTGGTGATACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTCTTCGCATAAAGAGGAGAGTTAAGAGTGTTGTTCTGGTGATACTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGGCCTTTGCTATTTTTGGTTTGTCATCTTTTTGTGATAAACATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGGCCTTTGCTATTTTTGGTTTGTCATCTTTTTGTGATAAACATGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGACTGTATGGACAAAAGAATATGAAGGAAACGTGACTTGGAAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGACTGTATGGACAAAAGAATATGAAGGAAACGTGACTTGGAAGATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTGAGGAGTGCAATGTACCATTCAAATATGACTCTAACCATGCTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTGAGGAGTGCAATGTACCATTCAAATATGACTCTAACCATGCTAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTTGTACCCCTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTTGTACCCCTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCCCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTGTGACCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCTTCTGTTATGTGCCATTTACTTTCTGTCCATGATCATATCAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCTTCTGTTATGTGCCATTTACTTTCTGTCCATGATCATATCAGTTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATTTGGGGAGGCTGGAAAAGCAACCTGTCTTCATGTTCTGCCAAGCTAT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATTTTGGGAGGCTGGAAAAGCAACCTGTCTTCATGTTCTGCCAAGCTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATATTCAGCTATCCTTCAACCCACCCATTCATCCTGATTTTGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATATTCAGCTATCCTTCAACCCACCCATTCATCCTGATTTTGGGAAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAAGCTAAAGCAGATTTTTCTTTCAGTTTTGCGGCATGTGAGGTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAAGCTAAAGCAGATTTTTCTTTCAGTTTTGCGGCATGTGAGGTACTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGAAAGACAGAAGCCTTCGTCTCCATAGATTCACAAGAGGGGCATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGAAAGACAGAAGCCTTCGTCTCCATAGATTCACAAGAGGGGCATTGTG

    950     .
    951 TGTCTTC
        |||||||
 100951 TGTCTTC