seq1 = pF1KE9285.tfa, 738 bp
seq2 = pF1KE9285/gi568815587r_66238242.tfa (gi568815587r:66238242_66442234), 203993 bp

>pF1KE9285 738
>gi568815587r:66238242_66442234 (Chr11)

(complement)

1-139  (100001-100139)   100% ->
140-230  (100612-100702)   100% ->
231-358  (100902-101029)   100% ->
359-438  (101189-101268)   100% ->
439-535  (101365-101461)   98% ->
536-628  (102022-102114)   98% ->
629-693  (103450-103514)   100% ->
694-738  (103953-103994)   93%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGTCCAGCCTCCAAGCAAAGACACAGAAGAGATGGAAGCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGTCCAGCCTCCAAGCAAAGACACAGAAGAGATGGAAGCAGAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATTCTGCTGCTGAGATGAATGGGGAGGAGGAAGAGAGTGAGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATTCTGCTGCTGAGATGAATGGGGAGGAGGAAGAGAGTGAGGAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGCGGCAGCCAGACAGAGTCAGAAGAGGAGAGCTCCG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100101 GGAGCGGCAGCCAGACAGAGTCAGAAGAGGAGAGCTCCGGTG...CAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGATGATGAGGACTATGAGCGACGCCGCAGCGAGTGTGTCAGTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100614 ATGGATGATGAGGACTATGAGCGACGCCGCAGCGAGTGTGTCAGTGAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGACCTAGAGAAGCAGTTCTCGGAGCTAAAGGAGAA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100664 GCTGGACCTAGAGAAGCAGTTCTCGGAGCTAAAGGAGAAGTG...CAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTTCAGGGAACGACTGAGTCAGCTGCGGTTGCGGCTGGAGGAAGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 TGTTCAGGGAACGACTGAGTCAGCTGCGGTTGCGGCTGGAGGAAGTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTGAGAGAGCCCCTGAATACACGGAGCCCCTTGGGGGGCTGCAGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100954 GCTGAGAGAGCCCCTGAATACACGGAGCCCCTTGGGGGGCTGCAGCGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCAAGATTCGCATTCAGGTGGCAG         GGATCTACAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101004 CCTCAAGATTCGCATTCAGGTGGCAGGTC...CAGGGATCTACAAGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGTCTGGATGTGATCAGGAATAAGTACGAATGTGAGCTGCAGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101204 TCTGTCTGGATGTGATCAGGAATAAGTACGAATGTGAGCTGCAGGGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAACAGCACCTGGAG         AGTGAGAAGCTGCTGCTCTATGACAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101254 AAACAGCACCTGGAGGTG...CAGAGTGAGAAGCTGCTGCTCTATGACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTGCAGGGGGAGCTGCAGGAGCGGATCCAGAGGCTGGAGGAGGACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101391 GCTGCAGGGGGAGCTGCAGGAGCGGATCCAGAGGCTGGAGGAGGACCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGAGCCTGGATCTCAGCTCTG         AATGGTGGGACGACAAACTG
        |||||||||| ||||||||||>>>...>>>|||||||||| |||||||||
 101441 AGAGCCTGGACCTCAGCTCTGGTA...CAGAATGGTGGGATGACAAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACGCCAGAGGCAGCTCCAGGTCTTGGGACTCCCTGCCGCCCAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102042 CACGCCAGAGGCAGCTCCAGGTCTTGGGACTCCCTGCCGCCCAGCAAGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAGAAGGCACCTCTGGTTTCTG         GCCCATACATCGTGTACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102092 GAAGAAGGCACCTCTGGTTTCTGGTA...CAGGCCCATACATCGTGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGCTTCAAGAGATCGACATCCTGGAGGACTGGACAGCCATCAAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103468 TGCTTCAAGAGATCGACATCCTGGAGGACTGGACAGCCATCAAAAAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       GCTAGGGCAGCTGTGTCCCCTCAGAAGAGAAAATCGGATGGACC
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---
 103518 ...CAGGCTAGGGCAGCTGTGTCCCCTCAGAAGAGAAAATCGGATGG   

    800 
    738 T
        |
 103994 T