seq1 = pF1KE9259.tfa, 3630 bp
seq2 = pF1KE9259/gi568815592r_31780087.tfa (gi568815592r:31780087_31996991), 216905 bp

>pF1KE9259 3630
>gi568815592r:31780087_31996991 (Chr6)

(complement)

1-42  (99315-99356)   100% ->
43-109  (100003-100069)   100% ->
110-328  (100168-100386)   100% ->
329-582  (100476-100729)   100% ->
583-667  (104082-104166)   100% ->
668-708  (104258-104298)   100% ->
709-864  (104430-104585)   99% ->
865-999  (107390-107524)   100% ->
1000-1114  (107650-107764)   100% ->
1115-1216  (107922-108023)   100% ->
1217-1365  (108245-108393)   100% ->
1366-1509  (108486-108629)   100% ->
1510-1745  (108716-108951)   100% ->
1746-1928  (109031-109213)   100% ->
1929-2011  (109333-109415)   100% ->
2012-2118  (109891-109997)   100% ->
2119-2241  (110095-110217)   100% ->
2242-2343  (110310-110411)   100% ->
2344-2448  (111976-112080)   100% ->
2449-2603  (112193-112347)   100% ->
2604-2771  (112433-112600)   100% ->
2772-2916  (113042-113186)   100% ->
2917-2994  (113553-113630)   100% ->
2995-3110  (113983-114098)   100% ->
3111-3197  (114207-114293)   100% ->
3198-3276  (115900-115978)   100% ->
3277-3452  (116144-116319)   99% ->
3453-3630  (116728-116905)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCGGCGGGAGCTGCAGCGGCGGCGGCCGCCGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  99315 ATGGCGGCGGCGGCGGGAGCTGCAGCGGCGGCGGCCGCCGAGGTG...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GGGGAGGCCCCCGCTGAGATGGGGGCGCTGCTGCTGGAGAAGGAAACCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100002 GGGGGAGGCCCCCGCTGAGATGGGGGCGCTGCTGCTGGAGAAGGAAACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGGAGCCACCGAGAGAG         TTCATGGCTCTTTGGGGGACACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100052 GAGGAGCCACCGAGAGAGGTG...CAGTTCATGGCTCTTTGGGGGACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCTCGTAGTGAAGAAACCCTGCCCAAGGCCACCCCCGACTCCCTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100191 CCTCGTAGTGAAGAAACCCTGCCCAAGGCCACCCCCGACTCCCTGGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTGGCCCCTCATCTCCAGCCTCTGTCACTGTCACTGTTGGTGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100241 TGCTGGCCCCTCATCTCCAGCCTCTGTCACTGTCACTGTTGGTGATGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGCTGACACCCCTGTAGGGGCTACACCACTCATTGGGGATGAATCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100291 GGGCTGACACCCCTGTAGGGGCTACACCACTCATTGGGGATGAATCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATCTTGAGGGAGATGGGGACCTCCGTGGGGGCCGGATCCTGCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100341 AATCTTGAGGGAGATGGGGACCTCCGTGGGGGCCGGATCCTGCTGGGTG.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329      GCCATGCCACAAAGTCATTCCCCTCTTCCCCCAGCAAGGGGGGTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100391 ..TAGGCCATGCCACAAAGTCATTCCCCTCTTCCCCCAGCAAGGGGGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTGTCCTAGCCGGGCCAAGATGTCAATGACAGGGGCGGGAAAATCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100521 CCTGTCCTAGCCGGGCCAAGATGTCAATGACAGGGGCGGGAAAATCACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCATCTGTCCAGAGTTTGGCTATGAGGCTACTGAGTATGCCAGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100571 CCATCTGTCCAGAGTTTGGCTATGAGGCTACTGAGTATGCCAGGAGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGAGCTGCAGCAGCAGGGTCTGAACCCCCTCCAGCCACCACGAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100621 GGGAGCTGCAGCAGCAGGGTCTGAACCCCCTCCAGCCACCACGAGCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGGACAGCCCAAGGTCCACCGAGCCCGCAAAACCATGTCCAAACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100671 AGGGACAGCCCAAGGTCCACCGAGCCCGCAAAACCATGTCCAAACCAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATGGACAG         CCCCCGGTCCCTGAGAAGCGGCCCCCTGAAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100721 AATGGACAGGTG...CAGCCCCCGGTCCCTGAGAAGCGGCCCCCTGAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACAGCATTTCCGCATGAGTGATGATGTCCACTCACTGGGAAAGGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104114 ACAGCATTTCCGCATGAGTGATGATGTCCACTCACTGGGAAAGGTGACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAG         ATCTGGCCAAAAGGAGGAAGCTGAACTCAGGAGGTGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104164 CAGGTC...CAGATCTGGCCAAAAGGAGGAAGCTGAACTCAGGAGGTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTG         TCGGAGGAGTTAGGTTCTGCCCGGCGTTCAGGAGAAGT
        |||>>>...>>>|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104296 CTGGTA...TAGTCAGAGGAGTTAGGTTCTGCCCGGCGTTCAGGAGAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GACCCTGACGAAAGGGGACCCCGGGTCCCTGGAGGAGTGGGAGACGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104468 GACCCTGACGAAAGGGGACCCCGGGTCCCTGGAGGAGTGGGAGACGGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGGTGATGACTTCAGTCTCTACTATGATTCCTACTCTGTGGATGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104518 TGGGTGATGACTTCAGTCTCTACTATGATTCCTACTCTGTGGATGAGCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGGACTCCGACAGCAAG         TCTGAAGTTGAAGCTCTAACTGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104568 GTGGACTCCGACAGCAAGGTG...CAGTCTGAAGTTGAAGCTCTAACTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACAACTAAGTGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 ACAACTAAGTGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGATGAGGAGTCAGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107463 AAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGAAGATGAGGAGTCAGGGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGTCAGATAGG         AGTGGTTCCAGTGGCCGGCGCAAGGCCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107513 CAGTCAGATAGGGTA...CAGAGTGGTTCCAGTGGCCGGCGCAAGGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAAGAAATGGCGAAAAGACAGCCCATGGGTGAAGCCGTCTCGGAAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107679 GAAGAAATGGCGAAAAGACAGCCCATGGGTGAAGCCGTCTCGGAAACGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCAAGCGGGAGCCTCCGCGGGCCAAGGAGCCACGAG         GAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107729 GCAAGCGGGAGCCTCCGCGGGCCAAGGAGCCACGAGGTG...CAGGAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AATGGTGTGGGCTCCTCAGGCCCCAGTGAGTACATGGAGGTCCCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107927 AATGGTGTGGGCTCCTCAGGCCCCAGTGAGTACATGGAGGTCCCTCTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTCCCTGGAGCTGCCCAGCGAGGGGACCCTCTCCCCCAACCACGCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107977 GTCCCTGGAGCTGCCCAGCGAGGGGACCCTCTCCCCCAACCACGCTGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1217       GGGTGTCCAATGACACATCTTCGCTGGAGACAGAGCGAGGGTTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108027 ...AAGGGGTGTCCAATGACACATCTTCGCTGGAGACAGAGCGAGGGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAGGAGTTGCCCCTGTGCAGCTGCCGCATGGAGGCACCCAAGATTGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108289 GAGGAGTTGCCCCTGTGCAGCTGCCGCATGGAGGCACCCAAGATTGACCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATCAGCGAGAGGGCGGGGCACAAGTGCATGGCCACTGAGAGTGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108339 CATCAGCGAGAGGGCGGGGCACAAGTGCATGGCCACTGAGAGTGTGGACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAGAG         CTGTCAGGCTGCAATGCCGCCATCCTCAAGCGGGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108389 GAGAGGTG...CAGCTGTCAGGCTGCAATGCCGCCATCCTCAAGCGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACCATGAGGCCATCCAGCCGTGTGGCCCTGATGGTGCTCTGTGAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108522 ACCATGAGGCCATCCAGCCGTGTGGCCCTGATGGTGCTCTGTGAGACCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCGCGCCCGCATGGTCAAACACCACTGCTGCCCGGGCTGCGGCTACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108572 CCGCGCCCGCATGGTCAAACACCACTGCTGCCCGGGCTGCGGCTACTTCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCACGGCG         GGCACCTTCCTGGAGTGCCACCCTGACTTCCGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108622 GCACGGCGGTG...CAGGGCACCTTCCTGGAGTGCCACCCTGACTTCCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTGGCCCACCGCTTCCACAAGGCCTGTGTGTCTCAGCTGAATGGGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108749 GTGGCCCACCGCTTCCACAAGGCCTGTGTGTCTCAGCTGAATGGGATGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CTTCTGTCCCCACTGTGGGGAGGATGCTTCTGAAGCTCAAGAGGTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108799 CTTCTGTCCCCACTGTGGGGAGGATGCTTCTGAAGCTCAAGAGGTGACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCCCCCGGGGTGACGGGGTGACCCCACCGGCCGGCACTGCAGCTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108849 TCCCCCGGGGTGACGGGGTGACCCCACCGGCCGGCACTGCAGCTCCTGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CCCCCACCCCTGTCCCAGGATGTCCCCGGGAGAGCAGACACTTCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108899 CCCCCACCCCTGTCCCAGGATGTCCCCGGGAGAGCAGACACTTCTCAGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CAG         TGCCCGGATGCGAGGGCATGGGGAACCCCGGCGCCCGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108949 CAGGTA...CAGTGCCCGGATGCGAGGGCATGGGGAACCCCGGCGCCCGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CCTGCGATCCCCTGGCTGACACCATTGACAGCTCAGGGCCCTCCCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109069 CCTGCGATCCCCTGGCTGACACCATTGACAGCTCAGGGCCCTCCCTGACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTGCCCAATGGGGGCTGCCTTTCAGCCGTGGGGCTGCCACTGGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109119 CTGCCCAATGGGGGCTGCCTTTCAGCCGTGGGGCTGCCACTGGGGCCAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CCGGGAGGCCCTGGAAAAGGCCCTGGTCATCCAGGAGTCAGAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109169 CCGGGAGGCCCTGGAAAAGGCCCTGGTCATCCAGGAGTCAGAGAGGTG..

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929     GCGGAAGAAGCTCCGTTTCCACCCTCGGCAGTTGTACCTGTCCGTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109219 .CAGGCGGAAGAAGCTCCGTTTCCACCCTCGGCAGTTGTACCTGTCCGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AAGCAGGGCGAGCTGCAGAAGGTGATCCTGATGCTGT         TGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109379 AAGCAGGGCGAGCTGCAGAAGGTGATCCTGATGCTGTGTG...CAGTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAACCTGGACCCCAACTTCCAGAGCGACCAGCAGAGCAAGCGCACGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109895 CAACCTGGACCCCAACTTCCAGAGCGACCAGCAGAGCAAGCGCACGCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGCATGCAGCCGCCCAGAAGGGCTCCGTGGAGATCTGCCATGTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109945 TGCATGCAGCCGCCCAGAAGGGCTCCGTGGAGATCTGCCATGTGCTGCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CAG         GCTGGAGCCAACATAAATGCAGTGGACAAACAGCAGCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109995 CAGGTC...CAGGCTGGAGCCAACATAAATGCAGTGGACAAACAGCAGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GACGCCACTGATGGAGGCCGTGGTGAACAACCACCTGGAGGTAGCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110133 GACGCCACTGATGGAGGCCGTGGTGAACAACCACCTGGAGGTAGCCCGTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ACATGGTGCAGCGTGGTGGCTGTGTCTATAGCAAG         GAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110183 ACATGGTGCAGCGTGGTGGCTGTGTCTATAGCAAGGTG...CAGGAGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GACGGTTCCACCTGCCTCCACCACGCAGCCAAAATCGGGAACTTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110316 GACGGTTCCACCTGCCTCCACCACGCAGCCAAAATCGGGAACTTGGAGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GGTCAGCCTGCTGCTGAGCACAGGACAGGTGGACGTCAACGCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110366 GGTCAGCCTGCTGCTGAGCACAGGACAGGTGGACGTCAACGCCCAGGTC.

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2344      GACAGTGGGGGGTGGACGCCCATCATCTGGGCTGCAGAGCACAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110416 ..CAGGACAGTGGGGGGTGGACGCCCATCATCTGGGCTGCAGAGCACAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 CACATCGAGGTGATCCGCATGCTACTGACGCGGGGCGCCGACGTCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112021 CACATCGAGGTGATCCGCATGCTACTGACGCGGGGCGCCGACGTCACCCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CACTGACAAC         GAGGAGAACATCTGCCTGCACTGGGCCTCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112071 CACTGACAACGTG...CAGGAGGAGAACATCTGCCTGCACTGGGCCTCCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 TCACGGGCAGCGCCGCCATCGCCGAAGTCCTTCTGAATGCGCGCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112224 TCACGGGCAGCGCCGCCATCGCCGAAGTCCTTCTGAATGCGCGCTGTGAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CTCCATGCTGTCAACTACCATGGGGACACCCCCCTGCACATCGCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112274 CTCCATGCTGTCAACTACCATGGGGACACCCCCCTGCACATCGCAGCTCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GGAGAGCTACCATGACTGCGTGCT         GTTATTCCTGTCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112324 GGAGAGCTACCATGACTGCGTGCTGTG...CAGGTTATTCCTGTCACGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 GGGCCAACCCTGAGCTGCGGAACAAAGAGGGGGACACAGCATGGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112450 GGGCCAACCCTGAGCTGCGGAACAAAGAGGGGGACACAGCATGGGACCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 ACTCCCGAGCGCTCCGACGTGTGGTTTGCGCTTCAACTCAACCGCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112500 ACTCCCGAGCGCTCCGACGTGTGGTTTGCGCTTCAACTCAACCGCAAGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CCGACTTGGGGTGGGAAATCGGGCCATCCGCACAGAGAAGATCATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112550 CCGACTTGGGGTGGGAAATCGGGCCATCCGCACAGAGAAGATCATCTGCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 G         GGACGTGGCTCGGGGCTATGAGAACGTGCCCATTCCCTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112600 GGTG...CAGGGACGTGGCTCGGGGCTATGAGAACGTGCCCATTCCCTGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 GTCAACGGTGTGGATGGGGAGCCCTGCCCTGAGGATTACAAGTACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113082 GTCAACGGTGTGGATGGGGAGCCCTGCCCTGAGGATTACAAGTACATCTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 AGAGAACTGCGAGACGTCCACCATGAACATCGATCGCAACATCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113132 AGAGAACTGCGAGACGTCCACCATGAACATCGATCGCAACATCACCCACC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 TGCAG         CACTGCACGTGTGTGGACGACTGCTCTAGCTCCAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113182 TGCAGGTG...CAGCACTGCACGTGTGTGGACGACTGCTCTAGCTCCAAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 TGCCTGTGCGGCCAGCTCAGCATCCGGTGCTGGTATGACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113589 TGCCTGTGCGGCCAGCTCAGCATCCGGTGCTGGTATGACAAGGTG...TA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2995  GATGGGCGATTGCTCCAGGAATTTAACAAGATTGAGCCTCCGCTGATTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113982 GGATGGGCGATTGCTCCAGGAATTTAACAAGATTGAGCCTCCGCTGATTT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 TCGAGTGTAACCAGGCGTGCTCATGCTGGAGAAACTGCAAGAACCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114032 TCGAGTGTAACCAGGCGTGCTCATGCTGGAGAAACTGCAAGAACCGGGTC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GTACAGAGTGGCATCAA         GGTGCGGCTACAGCTCTACCGAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114082 GTACAGAGTGGCATCAAGTG...CAGGGTGCGGCTACAGCTCTACCGAAC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 AGCCAAGATGGGCTGGGGGGTCCGCGCCCTGCAGACCATCCCACAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114231 AGCCAAGATGGGCTGGGGGGTCCGCGCCCTGCAGACCATCCCACAGGGGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 CCTTCATCTGCGA         GTATGTCGGGGAGCTGATCTCTGATGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114281 CCTTCATCTGCGAGTA...CAGGTATGTCGGGGAGCTGATCTCTGATGCT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3226 GAGGCTGATGTGAGAGAGGATGATTCTTACCTCTTCGACTTAGACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115928 GAGGCTGATGTGAGAGAGGATGATTCTTACCTCTTCGACTTAGACAACAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3276 G         GATGGAGAGGTGTACTGCATAGATGCCCGTTACTATGGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115978 GGTG...CAGGATGGAGAGGTGTACTGCATAGATGCCCGTTACTATGGCA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3317 ACATCAGCCGCTTCATCAACCACCTGTGTGACCCCAACATCATTCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116184 ACATCAGCCGCTTCATCAACCACCTGTGTGACCCCAACATCATTCCCGTC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3367 CGGGTCTTCATGCTACACCAAGACCTGCGATTTCCACGCATCGCCTTCTT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116234 CGGGTCTTCATGCTGCACCAAGACCTGCGATTTCCACGCATCGCCTTCTT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3417 CAGTTCCCGAGACATCCGGACTGGGGAGGAGCTAGG         GTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116284 CAGTTCCCGAGACATCCGGACTGGGGAGGAGCTAGGGTG...CAGGTTTG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3458 ACTATGGCGACCGCTTCTGGGACATCAAAAGCAAATATTTCACCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116733 ACTATGGCGACCGCTTCTGGGACATCAAAAGCAAATATTTCACCTGCCAA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3508 TGTGGCTCTGAGAAGTGCAAGCACTCAGCCGAAGCCATTGCCCTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116783 TGTGGCTCTGAGAAGTGCAAGCACTCAGCCGAAGCCATTGCCCTGGAGCA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3558 GAGCCGTCTGGCCCGCCTGGACCCACACCCTGAGCTGCTGCCCGAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116833 GAGCCGTCTGGCCCGCCTGGACCCACACCCTGAGCTGCTGCCCGAGCTCG

   3850     .    :    .    :
   3608 GCTCCCTGCCCCCTGTCAACACA
        |||||||||||||||||||||||
 116883 GCTCCCTGCCCCCTGTCAACACA