seq1 = pF1KE6787.tfa, 2073 bp
seq2 = pF1KE6787/gi568815588f_17853277.tfa (gi568815588f:17853277_18142830), 289554 bp

>pF1KE6787 2073
>gi568815588f:17853277_18142830 (Chr10)

1-261  (100001-100261)   99% ->
262-543  (108305-108586)   100% ->
544-751  (112207-112414)   100% ->
752-924  (124626-124798)   100% ->
925-1096  (128036-128207)   100% ->
1097-1269  (134203-134375)   100% ->
1270-1422  (137875-138027)   100% ->
1423-1533  (139905-140015)   100% ->
1534-1600  (142380-142446)   100% ->
1601-1759  (147391-147549)   100% ->
1760-1947  (149895-150082)   100% ->
1948-2073  (189429-189554)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGAGACAGACAAACCCTCAGCCCAGGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100051 ACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGAGACAGACAAACCCTCAGCCCAGGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTGTTGGAGAAAACTGGGTGCCCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTGTTGGAGAAAACTGGGTGCCCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTGCAATCTG         TGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTGCAATCTGGTT...CAGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGAGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108335 GCTGGAGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTCATCAGGAAGAGATCTGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108385 TTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTCATCAGGAAGAGATCTGTTCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108435 CAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGAGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108485 CTGAGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCAGTACTTTGACACTTCTCAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108535 AGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCAGTACTTTGACACTTCTCAAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AG         TGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108585 AGGTA...CAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGAGCAGTGAAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112246 GTGAGCAGTGAAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTGGGACAAGGAAACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112296 GATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTGGGACAAGGAAACTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112346 CTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AATACCCTCCGCCTATCAG         AACTAGACCAACTCCTCAACAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 112396 AATACCCTCCGCCTATCAGGTA...TAGAACTAGACCAACTCCTCAACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCCATCAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124648 TCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCCATCAATTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124698 AAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCTTCATCCATGGAAAAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124748 TCTTCATCCATGGAAAAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 G         ACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCTAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124798 GGTA...CAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128076 AGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGGATCATCCAGCAGCTCCTCAGCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128126 GGGATCATCCAGCAGCTCCTCAGCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 ACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGA         AATACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128176 ACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAGTA...TAGAATACGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ACAGCACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134212 ACAGCACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGAGAACTACAGGCTTATCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134262 GCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGAGAACTACAGGCTTATCTTACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134312 GCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACCTTATCCCTCAG         GTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 134362 ACCTTATCCCTCAGGTA...AAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCATATTTGGAAACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137902 CCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCATATTTGGAAACTGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137952 GGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TTCTTCTTGTATCACCAAATGACAAG         CAGGGCCTGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 138002 TTCTTCTTGTATCACCAAATGACAAGGTA...CAGCAGGGCCTGTCATTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACTCTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139920 GTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACTCTGAATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 AAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 139970 AAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534      AAAAGCCCAGAAGATTCACAGGCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140020 ..TAGAAAAGCCCAGAAGATTCACAGGCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 ATGACAGCCTCCAACAGAAAAT         GTAAAGCCATTAGCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 142425 ATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTG...TAGGTAAAGCCATTAGCTTGTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGCAATCATGATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147410 AGCAATCATGATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCGAGTCAGGAGTGACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147460 TAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCGAGTCAGGAGTGACCACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 147510 ACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGTA...CAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 AGACTTTGCCGTGCTCTTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149896 AGACTTTGCCGTGCTCTTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATTATACATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149946 TGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATTATACATTGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149996 CTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 TGCTGGGATGTTCTTATATTTATCCTTGGTTGAAATG         CTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 150046 TGCTGGGATGTTCTTATATTTATCCTTGGTTGAAATGGTA...TAGCTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189433 CTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189483 CAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTAT

   2150     .    :    .    :
   2052 ATATGAGCAAAATATTAAAATA
        ||||||||||||||||||||||
 189533 ATATGAGCAAAATATTAAAATA