seq1 = pF1KE6755.tfa, 1659 bp
seq2 = pF1KE6755/gi568815592r_136901561.tfa (gi568815592r:136901561_137117106), 215546 bp

>pF1KE6755 1659
>gi568815592r:136901561_137117106 (Chr6)

(complement)

1-88  (72379-72466)   100% ->
89-224  (100004-100139)   100% ->
225-403  (105655-105833)   100% ->
404-579  (107615-107790)   100% ->
580-724  (108364-108508)   100% ->
725-864  (112347-112486)   99% ->
865-1659  (114752-115546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGGCTCCCGGCCGCCCGGCCCTGCGGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  72379 ATGCGGGCTCCCGGCCGCCCGGCCCTGCGGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGTTGCTCCTGGCGGCGCCTTGGGGACGGGCAG         TTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
  72429 GCTGCTGTTGCTCCTGGCGGCGCCTTGGGGACGGGCAGGTA...CAGTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTGTGTCTCTGGTGGTTTGCCTAAACCTGCAAACATCACCTTCTTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 CCTGTGTCTCTGGTGGTTTGCCTAAACCTGCAAACATCACCTTCTTATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAACATGAAGAATGTCCTACAATGGACTCCACCAGAGGGTCTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 ATCAACATGAAGAATGTCCTACAATGGACTCCACCAGAGGGTCTTCAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTTAAAGTTACTTACACTGTGCAGTATTTCAT         ATATGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100107 AGTTAAAGTTACTTACACTGTGCAGTATTTCATGTA...CAGATATGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGAAATGGCTGAATAAATCAGAATGCAGAAATATCAATAGAACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105663 AAAAGAAATGGCTGAATAAATCAGAATGCAGAAATATCAATAGAACCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTGATCTTTCTGCTGAAACTTCTGACTACGAACACCAGTATTATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105713 TGTGATCTTTCTGCTGAAACTTCTGACTACGAACACCAGTATTATGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTTAAGGCCATTTGGGGAACAAAGTGTTCCAAATGGGCTGAAAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105763 AGTTAAGGCCATTTGGGGAACAAAGTGTTCCAAATGGGCTGAAAGTGGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGTTCTATCCTTTTTTAGAAA         CACAAATTGGCCCACCAGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105813 GGTTCTATCCTTTTTTAGAAAGTA...AAGCACAAATTGGCCCACCAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGCACTGACTACAGATGAGAAGTCCATTTCTGTTGTCCTGACAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107635 GTGGCACTGACTACAGATGAGAAGTCCATTTCTGTTGTCCTGACAGCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGAAGTGGAAGAGAAATCCAGAAGACCTTCCTGTTTCCATGCAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107685 AGAGAAGTGGAAGAGAAATCCAGAAGACCTTCCTGTTTCCATGCAACAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TATACTCCAATCTGAAGTATAACGTGTCTGTGTTGAATACTAAATCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107735 TATACTCCAATCTGAAGTATAACGTGTCTGTGTTGAATACTAAATCAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGAACG         TGGTCCCAGTGTGTGACCAACCACACGCTGGTGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107785 AGAACGGTA...TAGTGGTCCCAGTGTGTGACCAACCACACGCTGGTGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCTGGCTGGAGCCGAACACTCTTTACTGCGTACACGTGGAGTCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108399 CACCTGGCTGGAGCCGAACACTCTTTACTGCGTACACGTGGAGTCCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCCAGGGCCCCCTCGCCGTGCTCAGCCTTCTGAGAAGCAGTGTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108449 TCCCAGGGCCCCCTCGCCGTGCTCAGCCTTCTGAGAAGCAGTGTGCCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACTTTGAAAG         ATCAATCATCAGAGTTCAAGGCTAAAATCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 108499 ACTTTGAAAGGTA...CAGATCAATCATCAGAGTTCAAGGCTAAAATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTCTGGTATGTTTTGCCCATATCTATTACCGTGTTTCTTTTTTCTGTGA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 112378 CTTCTGGTATGTTTTGCCCGTATCTATTACCGTGTTTCTTTTTTCTGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGGCTATTCCATCTACCGATATATCCACGTTGGCAAAGAGAAACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112428 TGGGCTATTCCATCTACCGATATATCCACGTTGGCAAAGAGAAACACCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCAAATTTG         ATTTTGATTTATGGAAATGAATTTGACAAAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112478 GCAAATTTGGTG...TAGATTTTGATTTATGGAAATGAATTTGACAAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ATTCTTTGTGCCTGCTGAAAAAATCGTGATTAACTTTATCACCCTCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114784 ATTCTTTGTGCCTGCTGAAAAAATCGTGATTAACTTTATCACCCTCAATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTCGGATGATTCTAAAATTTCTCATCAGGATATGAGTTTACTGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114834 TCTCGGATGATTCTAAAATTTCTCATCAGGATATGAGTTTACTGGGAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGCAGTGATGTATCCAGCCTTAATGATCCTCAGCCCAGCGGGAACCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114884 AGCAGTGATGTATCCAGCCTTAATGATCCTCAGCCCAGCGGGAACCTGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCCCCCTCAGGAGGAAGAGGAGGTGAAACATTTAGGGTATGCTTCGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114934 GCCCCCTCAGGAGGAAGAGGAGGTGAAACATTTAGGGTATGCTTCGCATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGATGGAAATTTTTTGTGACTCTGAAGAAAACACGGAAGGTACTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114984 TGATGGAAATTTTTTGTGACTCTGAAGAAAACACGGAAGGTACTTCTCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ACCCAGCAAGAGTCCCTCAGCAGAACAATACCCCCGGATAAAACAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115034 ACCCAGCAAGAGTCCCTCAGCAGAACAATACCCCCGGATAAAACAGTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGAATATGAATATGATGTCAGAACCACTGACATTTGTGCGGGGCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115084 TGAATATGAATATGATGTCAGAACCACTGACATTTGTGCGGGGCCTGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGCAGGAGCTCAGTTTGCAGGAGGAGGTGTCCACACAAGGAACATTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115134 AGCAGGAGCTCAGTTTGCAGGAGGAGGTGTCCACACAAGGAACATTATTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGTCGCAGGCAGCGTTGGCAGTCTTGGGCCCGCAAACGTTACAGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115184 GAGTCGCAGGCAGCGTTGGCAGTCTTGGGCCCGCAAACGTTACAGTACTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 ATACACCCCTCAGCTCCAAGACTTAGACCCCCTGGCGCAGGAGCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115234 ATACACCCCTCAGCTCCAAGACTTAGACCCCCTGGCGCAGGAGCACACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ACTCGGAGGAGGGGCCGGAGGAAGAGCCATCGACGACCCTGGTCGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115284 ACTCGGAGGAGGGGCCGGAGGAAGAGCCATCGACGACCCTGGTCGACTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GATCCCCAAACTGGCAGGCTGTGTATTCCTTCGCTGTCCAGCTTCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115334 GATCCCCAAACTGGCAGGCTGTGTATTCCTTCGCTGTCCAGCTTCGACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GGATTCAGAGGGCTGCGAGCCTTCTGAGGGGGATGGGCTCGGAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115384 GGATTCAGAGGGCTGCGAGCCTTCTGAGGGGGATGGGCTCGGAGAGGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GTCTTCTATCTAGACTCTATGAGGAGCCGGCTCCAGACAGGCCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115434 GTCTTCTATCTAGACTCTATGAGGAGCCGGCTCCAGACAGGCCACCAGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GAAAATGAAACCTATCTCATGCAATTCATGGAGGAATGGGGGTTATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115484 GAAAATGAAACCTATCTCATGCAATTCATGGAGGAATGGGGGTTATATGT

   1700     .    :
   1647 GCAGATGGAAAAC
        |||||||||||||
 115534 GCAGATGGAAAAC