Result of SIM4 for
pF1KE6744
seq1 = pF1KE6744.tfa, 2919 bp
seq2 = pF1KE6744/gi568815596r_40015256.tfa (gi568815596r:40015256_40530280), 515025 bp
>pF1KE6744 2919
>gi568815596r:40015256_40530280 (Chr2)
(complement)
1-1808 (100001-101808) 100% ->
1809-1915 (351788-351894) 100% ->
1916-1936 (355000-355020) 100% ->
1937-1969 (355439-355471) 71% ->
1970-2038 (359932-360000) 100% ->
2039-2169 (365297-365427) 100% ->
2170-2269 (369417-369516) 100% ->
2270-2545 (390605-390880) 100% ->
2546-2919 (414652-415025) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTACAACATGCGGCGATTAAGTCTTTCACCCACCTTTTCAATGGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTACAACATGCGGCGATTAAGTCTTTCACCCACCTTTTCAATGGGATT
50 . : . : . : . : . :
51 TCATCTGTTAGTTACTGTGAGTCTCTTATTTTCCCATGTGGACCATGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TCATCTGTTAGTTACTGTGAGTCTCTTATTTTCCCATGTGGACCATGTAA
100 . : . : . : . : . :
101 TTGCTGAGACAGAAATGGAAGGAGAAGGAAATGAAACTGGTGAATGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTGCTGAGACAGAAATGGAAGGAGAAGGAAATGAAACTGGTGAATGTACT
150 . : . : . : . : . :
151 GGATCATATTACTGTAAGAAAGGGGTGATTTTGCCCATTTGGGAACCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGATCATATTACTGTAAGAAAGGGGTGATTTTGCCCATTTGGGAACCCCA
200 . : . : . : . : . :
201 AGACCCTTCTTTTGGGGACAAAATTGCTAGAGCTACTGTGTATTTTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 AGACCCTTCTTTTGGGGACAAAATTGCTAGAGCTACTGTGTATTTTGTGG
250 . : . : . : . : . :
251 CCATGGTCTACATGTTTCTTGGAGTCTCTATCATAGCTGATCGGTTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CCATGGTCTACATGTTTCTTGGAGTCTCTATCATAGCTGATCGGTTCATG
300 . : . : . : . : . :
301 TCCTCTATAGAAGTCATCACATCTCAAGAAAAAGAAATAACCATAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TCCTCTATAGAAGTCATCACATCTCAAGAAAAAGAAATAACCATAAAGAA
350 . : . : . : . : . :
351 ACCCAATGGAGAGACCACCAAGACAACTGTGAGGATCTGGAATGAAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 ACCCAATGGAGAGACCACCAAGACAACTGTGAGGATCTGGAATGAAACAG
400 . : . : . : . : . :
401 TTTCTAACCTGACCTTGATGGCCCTGGGATCTTCTGCTCCTGAGATTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 TTTCTAACCTGACCTTGATGGCCCTGGGATCTTCTGCTCCTGAGATTCTC
450 . : . : . : . : . :
451 CTTTCAGTAATTGAAGTGTGTGGCCATAACTTCACTGCAGGAGACCTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 CTTTCAGTAATTGAAGTGTGTGGCCATAACTTCACTGCAGGAGACCTCGG
500 . : . : . : . : . :
501 TCCTAGCACCATCGTGGGAAGTGCTGCATTCAATATGTTCATCATTATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 TCCTAGCACCATCGTGGGAAGTGCTGCATTCAATATGTTCATCATTATTG
550 . : . : . : . : . :
551 CACTCTGTGTTTATGTGGTGCCTGACGGAGAGACAAGGAAGATTAAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 CACTCTGTGTTTATGTGGTGCCTGACGGAGAGACAAGGAAGATTAAGCAT
600 . : . : . : . : . :
601 TTGCGTGTCTTCTTTGTGACAGCAGCCTGGAGCATCTTTGCCTACACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 TTGCGTGTCTTCTTTGTGACAGCAGCCTGGAGCATCTTTGCCTACACCTG
650 . : . : . : . : . :
651 GCTTTACATTATTTTGTCTGTCATATCTCCTGGTGTTGTGGAGGTCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 GCTTTACATTATTTTGTCTGTCATATCTCCTGGTGTTGTGGAGGTCTGGG
700 . : . : . : . : . :
701 AAGGTTTGCTTACTTTCTTCTTCTTTCCCATCTGTGTTGTGTTCGCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 AAGGTTTGCTTACTTTCTTCTTCTTTCCCATCTGTGTTGTGTTCGCTTGG
750 . : . : . : . : . :
751 GTAGCGGATAGGAGACTTCTGTTTTACAAGTATGTCTACAAGAGGTATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 GTAGCGGATAGGAGACTTCTGTTTTACAAGTATGTCTACAAGAGGTATCG
800 . : . : . : . : . :
801 AGCTGGCAAGCAGAGGGGGATGATTATTGAACATGAAGGAGACAGGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 AGCTGGCAAGCAGAGGGGGATGATTATTGAACATGAAGGAGACAGGCCAT
850 . : . : . : . : . :
851 CTTCTAAGACTGAAATTGAAATGGACGGGAAAGTGGTCAATTCTCATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 CTTCTAAGACTGAAATTGAAATGGACGGGAAAGTGGTCAATTCTCATGTT
900 . : . : . : . : . :
901 GAAAATTTCTTAGATGGTGCTCTGGTTCTGGAGGTGGATGAGAGGGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 GAAAATTTCTTAGATGGTGCTCTGGTTCTGGAGGTGGATGAGAGGGACCA
950 . : . : . : . : . :
951 AGATGATGAAGAAGCTAGGCGAGAAATGGCTAGGATTCTGAAGGAACTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 AGATGATGAAGAAGCTAGGCGAGAAATGGCTAGGATTCTGAAGGAACTTA
1000 . : . : . : . : . :
1001 AGCAGAAGCATCCAGATAAAGAAATAGAGCAATTAATAGAATTAGCTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 AGCAGAAGCATCCAGATAAAGAAATAGAGCAATTAATAGAATTAGCTAAC
1050 . : . : . : . : . :
1051 TACCAAGTCCTAAGTCAGCAGCAAAAAAGTAGAGCATTTTATCGCATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 TACCAAGTCCTAAGTCAGCAGCAAAAAAGTAGAGCATTTTATCGCATTCA
1100 . : . : . : . : . :
1101 AGCTACTCGCCTCATGACTGGAGCTGGCAACATTTTAAAGAGGCATGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 AGCTACTCGCCTCATGACTGGAGCTGGCAACATTTTAAAGAGGCATGCAG
1150 . : . : . : . : . :
1151 CTGACCAAGCAAGGAAGGCTGTCAGCATGCACGAGGTCAACACTGAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 CTGACCAAGCAAGGAAGGCTGTCAGCATGCACGAGGTCAACACTGAAGTG
1200 . : . : . : . : . :
1201 ACTGAAAATGACCCTGTTAGTAAGATCTTCTTTGAACAAGGGACATATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 ACTGAAAATGACCCTGTTAGTAAGATCTTCTTTGAACAAGGGACATATCA
1250 . : . : . : . : . :
1251 GTGTCTGGAGAACTGTGGTACTGTGGCCCTTACCATTATCCGCAGAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 GTGTCTGGAGAACTGTGGTACTGTGGCCCTTACCATTATCCGCAGAGGTG
1300 . : . : . : . : . :
1301 GTGATTTGACTAACACTGTGTTTGTTGACTTCAGAACAGAGGATGGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 GTGATTTGACTAACACTGTGTTTGTTGACTTCAGAACAGAGGATGGCACA
1350 . : . : . : . : . :
1351 GCAAATGCTGGGTCTGATTATGAATTTACTGAAGGAACTGTGGTGTTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 GCAAATGCTGGGTCTGATTATGAATTTACTGAAGGAACTGTGGTGTTTAA
1400 . : . : . : . : . :
1401 GCCTGGTGATACCCAGAAGGAAATCAGAGTGGGTATCATAGATGATGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 GCCTGGTGATACCCAGAAGGAAATCAGAGTGGGTATCATAGATGATGATA
1450 . : . : . : . : . :
1451 TCTTTGAGGAGGATGAAAATTTCCTTGTGCATCTCAGCAATGTCAAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 TCTTTGAGGAGGATGAAAATTTCCTTGTGCATCTCAGCAATGTCAAAGTA
1500 . : . : . : . : . :
1501 TCTTCTGAAGCTTCAGAAGATGGCATACTGGAAGCCAATCATGTTTCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 TCTTCTGAAGCTTCAGAAGATGGCATACTGGAAGCCAATCATGTTTCTAC
1550 . : . : . : . : . :
1551 ACTTGCTTGCCTCGGATCTCCCTCCACTGCCACTGTAACTATTTTTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 ACTTGCTTGCCTCGGATCTCCCTCCACTGCCACTGTAACTATTTTTGATG
1600 . : . : . : . : . :
1601 ATGACCACGCAGGCATTTTTACTTTTGAGGAACCTGTGACTCATGTGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 ATGACCACGCAGGCATTTTTACTTTTGAGGAACCTGTGACTCATGTGAGT
1650 . : . : . : . : . :
1651 GAGAGCATTGGCATCATGGAGGTGAAAGTATTGAGAACATCTGGAGCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 GAGAGCATTGGCATCATGGAGGTGAAAGTATTGAGAACATCTGGAGCTCG
1700 . : . : . : . : . :
1701 AGGAAATGTTATCGTTCCATATAAAACCATCGAAGGGACTGCCAGAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101701 AGGAAATGTTATCGTTCCATATAAAACCATCGAAGGGACTGCCAGAGGTG
1750 . : . : . : . : . :
1751 GAGGGGAGGATTTTGAGGACACTTGTGGAGAGCTCGAATTCCAGAATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 GAGGGGAGGATTTTGAGGACACTTGTGGAGAGCTCGAATTCCAGAATGAT
1800 . : . : . : . : . :
1801 GAAATTGT CAAAACAATATCAGTCAAGGTAATTGATGATGA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
101801 GAAATTGTGTA...CAGCAAAACAATATCAGTCAAGGTAATTGATGATGA
1850 . : . : . : . : . :
1842 GGAGTATGAGAAAAACAAGACCTTCTTCCTTGAGATTGGAGAGCCCCGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
351821 GGAGTATGAGAAAAACAAGACCTTCTTCCTTGAGATTGGAGAGCCCCGCC
1900 . : . : . : . : . :
1892 TGGTGGAGATGAGTGAGAAGAAAG CCCTGTTATTGAATGAG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
351871 TGGTGGAGATGAGTGAGAAGAAAGGTG...CAGCCCTGTTATTGAATGAG
1950 . : . : . : . : . :
1933 CTTG GTGGCTTCACAATAACAGG A AAATACCTGTTTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||-|- ||| -|-| >>
355017 CTTGGTA...TAGGTGGCTTCACAATAACAGGTATGAATTT T TCAAGT
2000 . : . : . : . : . :
1970 GCCAACCTGTCTTCAGGAAGGTTCATGCTAGAGAACATCCGAT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
355474 C...TAGGCCAACCTGTCTTCAGGAAGGTTCATGCTAGAGAACATCCGAT
2050 . : . : . : . : . :
2013 TCTCTCTACTGTAATCACCATTGCAG ACGAATATGATGACA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
359975 TCTCTCTACTGTAATCACCATTGCAGGTA...CAGACGAATATGATGACA
2100 . : . : . : . : . :
2054 AGCAGCCACTGACCAGCAAAGAGGAAGAGGAGAGGCGCATTGCAGAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
365312 AGCAGCCACTGACCAGCAAAGAGGAAGAGGAGAGGCGCATTGCAGAAATG
2150 . : . : . : . : . :
2104 GGGCGCCCCATCCTGGGAGAGCACACCAAGTTGGAAGTGATCATTGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
365362 GGGCGCCCCATCCTGGGAGAGCACACCAAGTTGGAAGTGATCATTGAAGA
2200 . : . : . : . : . :
2154 ATCCTATGAATTCAAG AGTACTGTGGACAAACTCATTAAGA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
365412 ATCCTATGAATTCAAGGTA...TAGAGTACTGTGGACAAACTCATTAAGA
2250 . : . : . : . : . :
2195 AGACAAACCTGGCCCTTGTGGTTGGGACTAACAGCTGGAGAGAACAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
369442 AGACAAACCTGGCCCTTGTGGTTGGGACTAACAGCTGGAGAGAACAGTTC
2300 . : . : . : . : . :
2245 ATTGAAGCTATCACTGTCAGTGCTG GGGAAGATGATGACGA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
369492 ATTGAAGCTATCACTGTCAGTGCTGGTG...TAGGGGAAGATGATGACGA
2350 . : . : . : . : . :
2286 CGATGAATGTGGGGAAGAGAAGCTGCCCTCCTGTTTCGATTACGTGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390621 CGATGAATGTGGGGAAGAGAAGCTGCCCTCCTGTTTCGATTACGTGATGC
2400 . : . : . : . : . :
2336 ACTTTCTGACTGTGTTCTGGAAGGTCCTGTTTGCCTTCGTCCCCCCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390671 ACTTTCTGACTGTGTTCTGGAAGGTCCTGTTTGCCTTCGTCCCCCCTACT
2450 . : . : . : . : . :
2386 GAATACTGGAATGGCTGGGCGTGTTTCATTGTCTCCATCCTCATGATTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390721 GAATACTGGAATGGCTGGGCGTGTTTCATTGTCTCCATCCTCATGATTGG
2500 . : . : . : . : . :
2436 CCTACTGACAGCTTTCATTGGAGACCTGGCTTCCCACTTTGGCTGCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390771 CCTACTGACAGCTTTCATTGGAGACCTGGCTTCCCACTTTGGCTGCACCA
2550 . : . : . : . : . :
2486 TTGGCCTGAAAGATTCTGTGACTGCAGTCGTGTTCGTCGCACTTGGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390821 TTGGCCTGAAAGATTCTGTGACTGCAGTCGTGTTCGTCGCACTTGGAACA
2600 . : . : . : . : . :
2536 TCAGTGCCAG ACACATTTGCCAGCAAAGTGGCAGCCACCCA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
390871 TCAGTGCCAGGTA...CAGACACATTTGCCAGCAAAGTGGCAGCCACCCA
2650 . : . : . : . : . :
2577 GGACCAGTATGCAGACGCCTCCATAGGTAACGTCACGGGCAGCAACGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414683 GGACCAGTATGCAGACGCCTCCATAGGTAACGTCACGGGCAGCAACGCGG
2700 . : . : . : . : . :
2627 TGAATGTCTTCCTGGGAATCGGTGTGGCCTGGTCCATCGCTGCCATCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414733 TGAATGTCTTCCTGGGAATCGGTGTGGCCTGGTCCATCGCTGCCATCTAC
2750 . : . : . : . : . :
2677 CACGCAGCCAATGGGGAACAGTTCAAAGTGTCCCCTGGCACACTAGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414783 CACGCAGCCAATGGGGAACAGTTCAAAGTGTCCCCTGGCACACTAGCTTT
2800 . : . : . : . : . :
2727 CTCTGTCACTCTCTTCACCATTTTTGCTTTCATCAATGTGGGGGTGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414833 CTCTGTCACTCTCTTCACCATTTTTGCTTTCATCAATGTGGGGGTGCTGC
2850 . : . : . : . : . :
2777 TGTATCGGCGGAGGCCAGAAATCGGAGGTGAGCTGGGTGGGCCCCGGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414883 TGTATCGGCGGAGGCCAGAAATCGGAGGTGAGCTGGGTGGGCCCCGGACT
2900 . : . : . : . : . :
2827 GCCAAGCTCCTCACATCCTGCCTCTTTGTGCTCCTATGGCTCTTGTACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414933 GCCAAGCTCCTCACATCCTGCCTCTTTGTGCTCCTATGGCTCTTGTACAT
2950 . : . : . : . :
2877 TTTCTTCTCCTCCCTGGAGGCCTACTGCCACATAAAAGGCTTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
414983 TTTCTTCTCCTCCCTGGAGGCCTACTGCCACATAAAAGGCTTC