seq1 = pF1KE6722.tfa, 2295 bp
seq2 = pF1KE6722/gi568815584r_38933242.tfa (gi568815584r:38933242_39196118), 262877 bp

>pF1KE6722 2295
>gi568815584r:38933242_39196118 (Chr14)

(complement)

1-221  (100001-100221)   100% ->
222-279  (102875-102932)   100% ->
280-366  (103492-103578)   100% ->
367-603  (104406-104642)   100% ->
604-683  (109111-109190)   98% ->
684-828  (110213-110357)   100% ->
829-987  (120026-120184)   100% ->
988-1103  (121589-121704)   100% ->
1104-1227  (128823-128946)   100% ->
1228-1308  (131126-131206)   100% ->
1309-1398  (132706-132795)   100% ->
1399-1505  (134248-134354)   100% ->
1506-1659  (140823-140976)   100% ->
1660-1737  (147390-147467)   97% ->
1738-1899  (150795-150956)   99% ->
1900-1986  (153247-153333)   100% ->
1987-2142  (155232-155387)   100% ->
2143-2208  (157023-157088)   100% ->
2209-2295  (162791-162877)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAACCTATTTGGAATTCATTCAACAAAATGAAGAACGAGATGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAACCTATTTGGAATTCATTCAACAAAATGAAGAACGAGATGGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGATTTAGTTGGAATGTTTGGCCATCAAGTCGACTGGAAGCTACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGATTTAGTTGGAATGTTTGGCCATCAAGTCGACTGGAAGCTACAAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTTGTTCCTGTGGCAGCCCTGTTTACACCACTGAAAGAGAGACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTTGTTCCTGTGGCAGCCCTGTTTACACCACTGAAAGAGAGACCTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTACCACCTATTCAATATGAACCTGTTCTGTGTAGTAGGACCACTTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTACCACCTATTCAATATGAACCTGTTCTGTGTAGTAGGACCACTTGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAGTTTTGAATCCTTTATG         TCAAGTGGATTATCGAGCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100201 TGCAGTTTTGAATCCTTTATGGTA...CAGTCAAGTGGATTATCGAGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACTTTGGGCTTGCAACTTTTGTTACCAAAGGAATCAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102895 AACTTTGGGCTTGCAACTTTTGTTACCAAAGGAATCAGGTA...TAGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCACCTAGTTATGCTGGTATATCTGAACTGAATCAGCCTGCTGAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103495 CCACCTAGTTATGCTGGTATATCTGAACTGAATCAGCCTGCTGAACTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACCTCAGTTTTCTAGCATTGAATATGTAGTTCTG         CGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103545 ACCTCAGTTTTCTAGCATTGAATATGTAGTTCTGGTA...AAGCGTGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCAGATGCCTTTGATATTCCTCTATGTGGTTGATACTTGCATGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104413 CTCAGATGCCTTTGATATTCCTCTATGTGGTTGATACTTGCATGGAAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGATTTACAAGCCCTGAAAGAATCCATGCAGATGTCATTAAGTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104463 GAAGATTTACAAGCCCTGAAAGAATCCATGCAGATGTCATTAAGTCTTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACCACCTACAGCTTTGGTTGGACTTATTACTTTTGGGAGAATGGTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104513 ACCACCTACAGCTTTGGTTGGACTTATTACTTTTGGGAGAATGGTTCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTCATGAACTTGGATGTGAAGGCATTTCAAAAAGCTATGTCTTCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104563 TTCATGAACTTGGATGTGAAGGCATTTCAAAAAGCTATGTCTTCAGAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACAAAAGATTTGTCTGCCAAACAACTGCAG         GAAATGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104613 ACAAAAGATTTGTCTGCCAAACAACTGCAGGTA...CAGGAAATGCTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTCTCTAAAGTACCAGTTACTCAAGCAACACGTGGTCCTCAGGTACAGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 109122 GCTCTCTAAAGTACCACTTACTCAAGCAACACGTGGTCCTCAGGTACAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCCACCTCCTTCCAACAG         ATTCTTACAACCAGTACAGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109172 AGCCACCTCCTTCCAACAGGTA...TAGATTCTTACAACCAGTACAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATAGACATGAATCTCACAGATCTTCTGGGAGAACTCCAGCGAGACCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110235 ATAGACATGAATCTCACAGATCTTCTGGGAGAACTCCAGCGAGACCCTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCCTGTACCACAGGGAAAGAGACCTTTGCGTTCCTCTGGGGTGGCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110285 GCCTGTACCACAGGGAAAGAGACCTTTGCGTTCCTCTGGGGTGGCACTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCATAGCTGTAGGACTGCTGGAG         TGTACTTTTCCCAACACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110335 CCATAGCTGTAGGACTGCTGGAGGTA...TAGTGTACTTTTCCCAACACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGTGCTCGTATCATGATGTTCATTGGTGGTCCTGCTACTCAGGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120044 GGTGCTCGTATCATGATGTTCATTGGTGGTCCTGCTACTCAGGGGCCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AATGGTGGTTGGAGATGAGTTGAAGACACCTATAAGATCGTGGCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120094 AATGGTGGTTGGAGATGAGTTGAAGACACCTATAAGATCGTGGCATGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGACAAAGACAATGCCAAATATGTTAAAAAGGGAACTAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 120144 TTGACAAAGACAATGCCAAATATGTTAAAAAGGGAACTAAGGTA...TAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CATTTTGAAGCATTGGCTAATCGAGCTGCTACAACTGGCCATGTTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121589 CATTTTGAAGCATTGGCTAATCGAGCTGCTACAACTGGCCATGTTATTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TATCTATGCGTGTGCATTAGATCAGACAGGTCTCCTGGAGATGAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121639 TATCTATGCGTGTGCATTAGATCAGACAGGTCTCCTGGAGATGAAATGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTCCCAACCTTACTGG         AGGATACATGGTAATGGGTGATTCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121689 GTCCCAACCTTACTGGGTA...CAGAGGATACATGGTAATGGGTGATTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTCAATACTTCCTTATTCAAACAAACTTTTCAAAGAGTCTTTACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128848 TTCAATACTTCCTTATTCAAACAAACTTTTCAAAGAGTCTTTACCAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CATGCATGGACAGTTTAAAATGGGCTTTGGTGGTACGCTAGAAATAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128898 CATGCATGGACAGTTTAAAATGGGCTTTGGTGGTACGCTAGAAATAAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228         ACCTCAAGGGAAATAAAGATTTCAGGAGCTATTGGACCCTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128948 TA...CAGACCTCAAGGGAAATAAAGATTTCAGGAGCTATTGGACCCTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGTCACTCAATTCTAAAGGACCCTGTGTGTCTGAAAAT         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 131168 GTGTCACTCAATTCTAAAGGACCCTGTGTGTCTGAAAATGTA...CAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GATAGGAACAGGTGGCACATGTCAGTGGAAGATATGTGGACTTAGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132708 GATAGGAACAGGTGGCACATGTCAGTGGAAGATATGTGGACTTAGTCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTACAACCTTAGCCATATATTTTGAGGTTGTCAATCAG         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 132758 CTACAACCTTAGCCATATATTTTGAGGTTGTCAATCAGGTA...CAGCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AATGCTCCAATTCCTCAAGGAGGGCGTGGTGCAATCCAGTTTGTGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134251 AATGCTCCAATTCCTCAAGGAGGGCGTGGTGCAATCCAGTTTGTGACTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GTATCAGCATTCAAGTGGGCAGAGACGCATCCGAGTGACCACCATTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134301 GTATCAGCATTCAAGTGGGCAGAGACGCATCCGAGTGACCACCATTGCTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GGAA         CTGGGCAGATGCTCAAACTCAAATCCAAAACATTGCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134351 GGAAGTA...CAGCTGGGCAGATGCTCAAACTCAAATCCAAAACATTGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GCATCTTTTGACCAGGAGGCAGCTGCCATTCTTATGGCCCGGCTAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140860 GCATCTTTTGACCAGGAGGCAGCTGCCATTCTTATGGCCCGGCTAGCAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 ATATAGAGCAGAAACAGAAGAAGGTCCAGATGTGCTTAGGTGGCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140910 ATATAGAGCAGAAACAGAAGAAGGTCCAGATGTGCTTAGGTGGCTGGACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GACAGCTCATTCGACTG         TGTCAGAAGTTTGGAGAATATCAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| |||||||||||||||
 140960 GACAGCTCATTCGACTGGTA...TAGTGTCAGAAATTTGGAGAATATCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AAAGATGACCCAAGTTCCTTCAGATTTTCAGAAACTTTCTCACTTTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 147414 AAAGATGACCCAAGTTCCTTCAGATTTTCAGAAACTTTCTCCCTTTATCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 ACAG         TTTATGTTTCATTTAAGAAGATCTTCTTTCCTGCAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147464 ACAGGTA...CAGTTTATGTTTCATTTAAGAAGATCTTCTTTCCTGCAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TTTTTAACAATAGTCCTGATGAGAGTTCATATTATCGTCACCATTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150832 TTTTTAACAATAGTCCTGATGAGAGTTCATATTATCGTCACCATTTTATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CGTCAAGATCTGACCCAGTCTCTAATTATGATTCAGCCTATCATGTATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 150882 CGTCAAGATCTGACCCAGTCTCTAATTATGATTCAGCCTATCCTGTATGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GTATTCTTTTAGTGGACCACCAGAG         CCGGTTCTTCTTGATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 150932 GTATTCTTTTAGTGGACCACCAGAGGTA...TAGCCGGTTCTTCTTGATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GCAGTAGCATTCTTGCAGATCGTATTCTTCTCATGGACACATTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153263 GCAGTAGCATTCTTGCAGATCGTATTCTTCTCATGGACACATTCTTCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 ATTTTGATTTATCATGGTGAG         ACCATAGCACAGTGGCGGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 153313 ATTTTGATTTATCATGGTGAGGTA...TAGACCATAGCACAGTGGCGGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GTCAGGATACCAGGATATGCCTGAGTATGAAAATTTCCGCCACCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155252 GTCAGGATACCAGGATATGCCTGAGTATGAAAATTTCCGCCACCTTCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 AAGCCCCAGTGGATGATGCACAGGAAATTCTTCACTCCAGATTTCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155302 AAGCCCCAGTGGATGATGCACAGGAAATTCTTCACTCCAGATTTCCAATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CCAAGATACATTGACACTGAACATGGAGGCAGCCAG         GCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 155352 CCAAGATACATTGACACTGAACATGGAGGCAGCCAGGTA...AAGGCCCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TTTCCTCCTTTCAAAAGTCAACCCTTCACAGACTCATAATAATATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157028 TTTCCTCCTTTCAAAAGTCAACCCTTCACAGACTCATAATAATATGTATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CCTGGGGGCAG         GAGTCTGGAGCACCTATTCTTACAGATGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 157078 CCTGGGGGCAGGTA...TAGGAGTCTGGAGCACCTATTCTTACAGATGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GTTAGTTTACAAGTGTTTATGGATCACTTGAAGAAACTTGCTGTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162821 GTTAGTTTACAAGTGTTTATGGATCACTTGAAGAAACTTGCTGTGTCCAG

   2450     .
   2289 TGCTGCT
        |||||||
 162871 TGCTGCT