seq1 = pF1KE6659.tfa, 870 bp
seq2 = pF1KE6659/gi568815590f_18122048.tfa (gi568815590f:18122048_18322917), 200870 bp

>pF1KE6659 870
>gi568815590f:18122048_18322917 (Chr8)

1-870  (100001-100870)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACATTGAAGCATATCTTGAAAGAATTGGCTATAAGAAGTCTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACATTGAAGCATATCTTGAAAGAATTGGCTATAAGAAGTCTAGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAATTGGACTTGGAAACATTAACTGACATTCTTCAACACCAGATCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAATTGGACTTGGAAACATTAACTGACATTCTTCAACACCAGATCCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTTCCCTTTGAGAACCTTAACATCCATTGTGGGGATGCCATGGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTTCCCTTTGAGAACCTTAACATCCATTGTGGGGATGCCATGGACTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTAGAGGCCATTTTTGATCAAGTTGTGAGAAGAAATCGGGGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTTAGAGGCCATTTTTGATCAAGTTGTGAGAAGAAATCGGGGTGGATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGTCTCCAGGTCAATCATCTTCTGTACTGGGCTCTGACCACTATTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGTCTCCAGGTCAATCATCTTCTGTACTGGGCTCTGACCACTATTGGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGAGACCACGATGTTGGGAGGGTATGTTTACAGCACTCCAGCCAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGAGACCACGATGTTGGGAGGGTATGTTTACAGCACTCCAGCCAAAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACAGCACTGGCATGATTCACCTTCTCCTGCAGGTGACCATTGATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TACAGCACTGGCATGATTCACCTTCTCCTGCAGGTGACCATTGATGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAACTACATTGTCGATGCTGGGTTTGGACGCTCATACCAGATGTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAACTACATTGTCGATGCTGGGTTTGGACGCTCATACCAGATGTGGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCTGGAGTTAATTTCTGGGAAGGATCAGCCTCAGGTGCCTTGTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCTGGAGTTAATTTCTGGGAAGGATCAGCCTCAGGTGCCTTGTGTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTTTGACGGAAGAGAATGGATTCTGGTATCTAGACCAAATCAGAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTTTGACGGAAGAGAATGGATTCTGGTATCTAGACCAAATCAGAAGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACAGTACATTCCAAATGAAGAATTTCTTCATTCTGATCTCCTAGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACAGTACATTCCAAATGAAGAATTTCTTCATTCTGATCTCCTAGAAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAATACCGAAAAATCTACTCCTTTACTCTTAAGCCTCGAACAATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAATACCGAAAAATCTACTCCTTTACTCTTAAGCCTCGAACAATTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATTTTGAGTCTATGAATACATACCTGCAGACATCTCCATCATCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATTTTGAGTCTATGAATACATACCTGCAGACATCTCCATCATCTGTGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TACTAGTAAATCATTTTGTTCCTTGCAGACCCCAGATGGGGTTCACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TACTAGTAAATCATTTTGTTCCTTGCAGACCCCAGATGGGGTTCACTGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGTGGGCTTCACCCTCACCCATAGGAGATTCAATTATAAGGACAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGTGGGCTTCACCCTCACCCATAGGAGATTCAATTATAAGGACAATACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATCTAATAGAGTTCAAGACTCTGAGTGAGGAAGAAATAGAAAAAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATCTAATAGAGTTCAAGACTCTGAGTGAGGAAGAAATAGAAAAAGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAAAATATATTTAATATTTCCTTGCAGAGAAAGCTTGTGCCCAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAAAATATATTTAATATTTCCTTGCAGAGAAAGCTTGTGCCCAAACATG

    850     .    :    .    :
    851 GTGATAGATTTTTTACTATT
        ||||||||||||||||||||
 100851 GTGATAGATTTTTTACTATT