seq1 = pF1KE6566.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KE6566/gi568815592r_38577298.tfa (gi568815592r:38577298_38803054), 225757 bp

>pF1KE6566 552
>gi568815592r:38577298_38803054 (Chr6)

(complement)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-167  (116081-116163)   100% ->
168-308  (118541-118681)   100% ->
309-376  (120180-120247)   100% ->
377-466  (120954-121043)   100% ->
467-552  (125672-125757)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAACCGCAGCCCCCGTCCGGCGGCCTCACGGACGAGGCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAACCGCAGCCCCCGTCCGGCGGCCTCACGGACGAGGCCGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTTGCTGCTCCGACGCGGACCCCAGTACCAAG         GATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 CAGTTGCTGCTCCGACGCGGACCCCAGTACCAAGGTG...TAGGATTTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TATTGCAGCAGACCATGCTACGAGTGAAGGATCCTAAGAAGTCACTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116088 TATTGCAGCAGACCATGCTACGAGTGAAGGATCCTAAGAAGTCACTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTTATACTAGAGTTCTTGGAATGAC         GCTAATCCAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 116138 TTTTATACTAGAGTTCTTGGAATGACGTA...CAGGCTAATCCAAAAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGATTTTCCCATTATGAAGTTTTCACTCTACTTCTTGGCTTATGAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118556 TGATTTTCCCATTATGAAGTTTTCACTCTACTTCTTGGCTTATGAGGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAATGACATCCCTAAAGAAAAAGATGAAAAAATAGCCTGGGCGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118606 AAAATGACATCCCTAAAGAAAAAGATGAAAAAATAGCCTGGGCGCTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAAAAGCTACACTTGAGCTGACACA         CAATTGGGGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 118656 AGAAAAGCTACACTTGAGCTGACACAGTG...TAGCAATTGGGGCACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGATGATGAGACCCAGAGTTACCACAATGGCAATTCAGACCCTCGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120195 AGATGATGAGACCCAGAGTTACCACAATGGCAATTCAGACCCTCGAGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCG         GTCATATTGGAATTGCTGTTCCTGATGTATACAGTGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120245 TCGGTA...AAGGTCATATTGGAATTGCTGTTCCTGATGTATACAGTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGTAAAAGGTTTGAAGAACTGGGAGTCAAATTTGTGAAGAAACCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120992 TGTAAAAGGTTTGAAGAACTGGGAGTCAAATTTGTGAAGAAACCTGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TG         GTAAAATGAAAGGCCTGGCATTTATTCAAGATCCTGATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121042 TGGTG...CAGGTAAAATGAAAGGCCTGGCATTTATTCAAGATCCTGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    506 GCTACTGGATTGAAATTTTGAATCCTAACAAAATGGCAACCTTAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125711 GCTACTGGATTGAAATTTTGAATCCTAACAAAATGGCAACCTTAATG