seq1 = pF1KE6558.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KE6558/gi568815592r_33316653.tfa (gi568815592r:33316653_33517668), 201016 bp

>pF1KE6558 468
>gi568815592r:33316653_33517668 (Chr6)

(complement)

1-188  (100001-100188)   100% ->
189-248  (100359-100418)   100% ->
249-294  (100527-100572)   100% ->
295-344  (100700-100749)   100% ->
345-468  (100893-101016)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGCGCTGCTGCCTGTGGCCTCCCGCCTTTTGTTGCTACCCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGCGCTGCTGCCTGTGGCCTCCCGCCTTTTGTTGCTACCCCGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCTGACCATGGCCTCTGGAAGCCCTCCGACCCAGCCCTCGCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCTGACCATGGCCTCTGGAAGCCCTCCGACCCAGCCCTCGCCGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGATTCCGGCTCTGGCTACGTTCCGGGCTCGGTCTCTGCAGCCTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGATTCCGGCTCTGGCTACGTTCCGGGCTCGGTCTCTGCAGCCTTTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTTGCCCCAACGAGAAGGTCGCCAAGGAGATCGCCAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100151 ACTTGCCCCAACGAGAAGGTCGCCAAGGAGATCGCCAGGTA...CAGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGGTGGAGAAGCGCCTAGCAGCCTGCGTCAACCTCATCCCTCAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100362 CGTGGTGGAGAAGCGCCTAGCAGCCTGCGTCAACCTCATCCCTCAGATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATCCAT         CTATGAGTGGAAAGGGAAGATCGAGGAAGACAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100412 CATCCATGTG...CAGCTATGAGTGGAAAGGGAAGATCGAGGAAGACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGTGCTGATG         ATGATTAAAACCCAAAGTTCCTTGGTCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100561 GAGGTGCTGATGGTG...TAGATGATTAAAACCCAAAGTTCCTTGGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCTTTGACAGATTTTGTTCG         TTCTGTGCACCCTTACGAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100729 AGCTTTGACAGATTTTGTTCGGTG...TAGTTCTGTGCACCCTTACGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGCCGAGGTAATTGCATTGCCTGTGGAACAGGGGAACTTTCCGTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 TGGCCGAGGTAATTGCATTGCCTGTGGAACAGGGGAACTTTCCGTACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGTGGGTGCGCCAGGTCACAGAGTCAGTTTCTGACTCTATCACAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100963 CAGTGGGTGCGCCAGGTCACAGAGTCAGTTTCTGACTCTATCACAGTCCT

    500 
    465 GCCA
        ||||
 101013 GCCA