seq1 = pF1KE6541.tfa, 273 bp
seq2 = pF1KE6541/gi568815594r_143897539.tfa (gi568815594r:143897539_144240635), 343097 bp

>pF1KE6541 273
>gi568815594r:143897539_144240635 (Chr4)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-136  (239353-239451)   100% ->
137-175  (241187-241225)   100% ->
176-273  (243002-243097)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTATGGAAAAATAATCTTTGTATTACTATTGTCAG         AAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGTATGGAAAAATAATCTTTGTATTACTATTGTCAGGTA...CAGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGTGAGCATATCAGCATTAAGTACCACTGAGGTGGCAATGCACACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239357 TGTGAGCATATCAGCATTAAGTACCACTGAGGTGGCAATGCACACTTCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTCTTCTTCAGTCACAAAGAGTTACATCTCATCACAGACAAATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 239407 CCTCTTCTTCAGTCACAAAGAGTTACATCTCATCACAGACAAATGGTT..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     GAGAAACGGGACAACTTGTCCATCGTTTCACTGTACCAG       
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 239457 .TAGGAGAAACGGGACAACTTGTCCATCGTTTCACTGTACCAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    176   CTCCTGTAGTGATAATACTCATTATTTTGTGTGTGATGGCTGGTATTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243000 AGCTCCTGTAGTGATAATACTCATTATTTTGTGTGTGATGGCTGGTATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTGGAACGATCCTCTTAATTTCTTACAGTATTCGCCGACTGATAAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--
 243050 TTGGAACGATCCTCTTAATTTCTTACAGTATTCGCCGACTGATAAAGG