seq1 = pF1KE6518.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KE6518/gi568815595r_46758384.tfa (gi568815595r:46758384_46963390), 205007 bp

>pF1KE6518 585
>gi568815595r:46758384_46963390 (Chr3)

(complement)

1-129  (100001-100129)   99% ->
130-157  (102404-102431)   100% ->
158-307  (102566-102715)   100% ->
308-481  (103743-103916)   100% ->
482-559  (104930-105007)   100% ->
560-585  (105119-105144)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCGAAAAGCCAGAGCCCAAGAAGGATGATGCCAAGGCAGCCCC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCCAAAAAGCCAGAGCCCAAGAAGGATGATGCCAAGGCAGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGCAGCTCCAGCTCCCGCACCTCCCCCTGAGCCTGAGCGCCCTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGCAGCTCCAGCTCCCGCACCTCCCCCTGAGCCTGAGCGCCCTAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGTCGAGTTTGATGCTTCCAAGATCAAG         ATTGAGTTCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 AGGTCGAGTTTGATGCTTCCAAGATCAAGGTG...CAGATTGAGTTCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGAGCAGATTGAAG         AGTTCAAGGAAGCCTTCATGCTGTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102416 CCTGAGCAGATTGAAGGTG...CAGAGTTCAAGGAAGCCTTCATGCTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGACCGCACACCCAAGTGTGAGATGAAGATCACCTACGGGCAGTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 CGACCGCACACCCAAGTGTGAGATGAAGATCACCTACGGGCAGTGTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTCCTGCGGGCGCTGGGCCAGAACCCCACACAGGCAGAAGTGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102641 ATGTCCTGCGGGCGCTGGGCCAGAACCCCACACAGGCAGAAGTGCTCCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCCTGGGGAAGCCAAGACAGGAAG         AGCTCAATACCAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102691 GTCCTGGGGAAGCCAAGACAGGAAGGTA...CAGAGCTCAATACCAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATGGACTTTGAAACTTTCCTGCCTATGCTCCAGCACATTTCCAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103759 GATGGACTTTGAAACTTTCCTGCCTATGCTCCAGCACATTTCCAAGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGACACAGGCACCTATGAGGACTTCGTGGAGGGGCTGCGGGTCTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103809 AGGACACAGGCACCTATGAGGACTTCGTGGAGGGGCTGCGGGTCTTCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGAGGGCAATGGCACTGTCATGGGTGCTGAGCTTCGCCACGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103859 AAGGAGGGCAATGGCACTGTCATGGGTGCTGAGCTTCGCCACGTGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACGCTGG         GTGAGAGGCTGACAGAAGACGAAGTGGAGAAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103909 CACGCTGGGTG...CAGGTGAGAGGCTGACAGAAGACGAAGTGGAGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATGGCTGGGCAAGAGGACTCCAATGGCTGCATCAACTATGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104963 TGATGGCTGGGCAAGAGGACTCCAATGGCTGCATCAACTATGAAGGTG..

    600     .    :    .    :    .    :
    560     CATTTGTGAAGCACATCATGTCCAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||
 105013 .CAGCATTTGTGAAGCACATCATGTCCAGC