seq1 = pF1KE6503.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KE6503/gi568815581r_39822553.tfa (gi568815581r:39822553_40024203), 201651 bp

>pF1KE6503 459
>gi568815581r:39822553_40024203 (Chr17)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-326  (100941-101092)   100% ->
327-459  (101519-101651)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGTGGGCACAGCGCACAGCGAGGTGAACCCCAACACGCGGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGTGGGCACAGCGCACAGCGAGGTGAACCCCAACACGCGGGTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACAGCCGTGGCATCTGGCTCTCCTACGTGCTGGCCATCGGTCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACAGCCGTGGCATCTGGCTCTCCTACGTGCTGGCCATCGGTCTCCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCGTGCTGCTGAGCATCCCGTTTGTGAGTGTCCCTGTCGTCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATCGTGCTGCTGAGCATCCCGTTTGTGAGTGTCCCTGTCGTCTGGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCACCAACCTCATTCACAACATG         GGCATGTATATCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 CTCACCAACCTCATTCACAACATGGTG...CAGGGCATGTATATCTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCACACGGTGAAGGGGACACCCTTTGAGACCCCGGACCAGGGCAAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100958 GCACACGGTGAAGGGGACACCCTTTGAGACCCCGGACCAGGGCAAGGCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCTGCTAACCCACTGGGAGCAGATGGATTATGGGGTCCAGTTCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101008 GGCTGCTAACCCACTGGGAGCAGATGGATTATGGGGTCCAGTTCACGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTCGGAAGTTCTTGACCATCACACCCATCGTGCT         GTACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101058 TCTCGGAAGTTCTTGACCATCACACCCATCGTGCTGTG...CAGGTACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCACCAGCTTCTACACTAAGTACGACCAGATCCATTTTGTGCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101525 CCTCACCAGCTTCTACACTAAGTACGACCAGATCCATTTTGTGCTCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCGTGTCCCTGATGAGCGTGCTTATCCCCAAGCTGCCCCAGCTCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101575 CCGTGTCCCTGATGAGCGTGCTTATCCCCAAGCTGCCCCAGCTCCACGGA

    450     .    :    .    :    .
    433 GTCCGGATTTTTGGAATCAATAAGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101625 GTCCGGATTTTTGGAATCAATAAGTAC