seq1 = pF1KE6496.tfa, 1596 bp
seq2 = pF1KE6496/gi568815588f_49510741.tfa (gi568815588f:49510741_49712336), 201596 bp

>pF1KE6496 1596
>gi568815588f:49510741_49712336 (Chr10)

1-1596  (100001-101596)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCCGCGGAACCTGCGGGCCAGGCCCGGGCGGCGGCCACCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATCCGCGGAACCTGCGGGCCAGGCCCGGGCGGCGGCCACCAAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGGAGGCTGTGGGCGCGGCGCTGCAGGAGCCCCGGCGGCAGAGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGGAGGCTGTGGGCGCGGCGCTGCAGGAGCCCCGGCGGCAGAGGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGCTTGTTATCGTGTGCGTGGCGCTGTTACTGGACAACATGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGCTTGTTATCGTGTGCGTGGCGCTGTTACTGGACAACATGCTGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGTCATCGTGCCCATAGTGCCCGACTACATCGCCCACATGCGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGTCATCGTGCCCATAGTGCCCGACTACATCGCCCACATGCGCGGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCGAGGGCCCCACCCGGACTCCCGAGGTGTGGGAGCCCACCCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCGAGGGCCCCACCCGGACTCCCGAGGTGTGGGAGCCCACCCTGCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCACTCCGGCCAATGCCAGCGCCTACACGGCCAACACCTCGGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCACTCCGGCCAATGCCAGCGCCTACACGGCCAACACCTCGGCGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGACAGCTGCGTGGCCAGCGGGCTCAGCCCTTCGGCCCCGCTACCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGACAGCTGCGTGGCCAGCGGGCTCAGCCCTTCGGCCCCGCTACCCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGAGCGAAGACGTGAAGATCGGGGTGCTGTTTGCTTCCAAGGCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAGAGCGAAGACGTGAAGATCGGGGTGCTGTTTGCTTCCAAGGCTATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCAGCTGCTAGTGAACCCCTTGAGCGGGCCCTTCATCGACCGCATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCAGCTGCTAGTGAACCCCTTGAGCGGGCCCTTCATCGACCGCATGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACGACGTGCCGCTGCTGATCGGCCTGGGCGTCATGTTCGCCTCTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACGACGTGCCGCTGCTGATCGGCCTGGGCGTCATGTTCGCCTCTACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGTTCGCCTTCGCCGAGGACTACGCCACGCTGTTCGCGGCGCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGTTCGCCTTCGCCGAGGACTACGCCACGCTGTTCGCGGCGCGCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCAGGGCCTGGGCTCAGCCTTCGCCGACACGTCTGGCATAGCCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCAGGGCCTGGGCTCAGCCTTCGCCGACACGTCTGGCATAGCCATGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCGATAAGTACCCGGAGGAGCCGGAGCGCAGTCGTGCACTGGGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCGATAAGTACCCGGAGGAGCCGGAGCGCAGTCGTGCACTGGGCGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGGCCTTCATTAGCTTCGGAAGCCTAGTGGCCCCGCCCTTCGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGGCCTTCATTAGCTTCGGAAGCCTAGTGGCCCCGCCCTTCGGGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCTATGAGTTCGCCGGCAAGCGCGTGCCCTTCTTGGTGCTAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCTATGAGTTCGCCGGCAAGCGCGTGCCCTTCTTGGTGCTAGCTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGTCGCTCTTTGACGCGCTGTTGCTGCTGGCAGTGGCCAAACCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGTCGCTCTTTGACGCGCTGTTGCTGCTGGCAGTGGCCAAACCCTTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCGGCTGCACGGGCTCGGGCCAACCTGCCAGTGGGCACTCCCATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCGGCTGCACGGGCTCGGGCCAACCTGCCAGTGGGCACTCCCATCCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCTCATGCTAGACCCCTACATTGCCGTGGTGGCCGGCGCGCTCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCTCATGCTAGACCCCTACATTGCCGTGGTGGCCGGCGCGCTCACCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGTAACATTCCCCTCGCCTTCCTCGAACCCACCATTGCCACGTGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGTAACATTCCCCTCGCCTTCCTCGAACCCACCATTGCCACGTGGATGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCATACGATGGCGGCTTCCGAGTGGGAGATGGGCATGGCCTGGCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCATACGATGGCGGCTTCCGAGTGGGAGATGGGCATGGCCTGGCTGCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTTCGTGCCTCATGTGCTGGGCGTCTACCTCACCGTGCGCCTGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTTCGTGCCTCATGTGCTGGGCGTCTACCTCACCGTGCGCCTGGCGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CGCTACCCACACCTGCAGTGGCTGTACGGCGCGCTTGGGCTGGCTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CGCTACCCACACCTGCAGTGGCTGTACGGCGCGCTTGGGCTGGCTGTGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGGCGCCAGCTCGTGCATCGTGCCCGCCTGCCGCTCCTTCGCGCCGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGGCGCCAGCTCGTGCATCGTGCCCGCCTGCCGCTCCTTCGCGCCGCTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGTCTCACTATGCGGCCTCTGTTTTGGCATAGCCCTAGTCGACACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGTCTCACTATGCGGCCTCTGTTTTGGCATAGCCCTAGTCGACACAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGCTGCCCACGCTCGCCTTCCTGGTGGACGTGCGCCATGTCTCAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTGCTGCCCACGCTCGCCTTCCTGGTGGACGTGCGCCATGTCTCAGTCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGGCAGCGTCTACGCCATCGCCGACATCTCCTATTCGGTGGCCTACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGGCAGCGTCTACGCCATCGCCGACATCTCCTATTCGGTGGCCTACGCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCGGGCCCATAGTGGCAGGCCACATTGTGCACTCGCTGGGCTTTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TCGGGCCCATAGTGGCAGGCCACATTGTGCACTCGCTGGGCTTTGAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCAGCCTTGGCATGGGACTGGCCAACCTGCTCTATGCTCCCGTCTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTCAGCCTTGGCATGGGACTGGCCAACCTGCTCTATGCTCCCGTCTTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCTGCTCCGCAACGTGGGCCTCCTGACGCGCTCCCGTTCCGAGCGCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTGCTCCGCAACGTGGGCCTCCTGACGCGCTCCCGTTCCGAGCGCGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGCTGCTTGATGAGCCACCGCAAGGTCTGTACGATGCGGTGCGCCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGCTGCTTGATGAGCCACCGCAAGGTCTGTACGATGCGGTGCGCCTGCGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GAGCGTCCTGTGTCTGGCCAGGACGGCGAGCCTCGCAGCCCGCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GAGCGTCCTGTGTCTGGCCAGGACGGCGAGCCTCGCAGCCCGCCTGGCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1551 TTTTGATGAGTGCGAGGACGACTACAACTACTACTACACCCGCAGC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TTTTGATGCGTGCGAGGACGACTACAACTACTACTACACCCGCAGC