seq1 = pF1KE6479.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KE6479/gi568815580f_74399974.tfa (gi568815580f:74399974_74620065), 220092 bp

>pF1KE6479 1425
>gi568815580f:74399974_74620065 (Chr18)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-204  (101356-101499)   100% ->
205-367  (105876-106038)   100% ->
368-456  (108867-108955)   100% ->
457-657  (110840-111040)   100% ->
658-742  (112475-112559)   100% ->
743-903  (113586-113746)   100% ->
904-1068  (116255-116419)   100% ->
1069-1210  (118526-118667)   100% ->
1211-1358  (118976-119123)   100% ->
1359-1425  (120026-120092)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCCTCACTACCCTGTTTAAGTACATAGATGAAAATCAGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCCTCACTACCCTGTTTAAGTACATAGATGAAAATCAGGATCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACATTAAG         AAACTCGCAAAATGGGTGGCTATCCAGAGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACATTAAGGTA...CAGAAACTCGCAAAATGGGTGGCTATCCAGAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTCTGCGTGGCCGGAGAAGAGAGGCGAAATCAGGAGGATGATGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101387 TGTCTGCGTGGCCGGAGAAGAGAGGCGAAATCAGGAGGATGATGGAAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGCTGCAGATGTTAAGCAGTTGGGGGGCTCTGTGGAACTGGTGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101437 GCTGCTGCAGATGTTAAGCAGTTGGGGGGCTCTGTGGAACTGGTGGATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGAAAACAAAAG         CTCCCTGATGGCTCGGAGATCCCGCTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101487 CGGAAAACAAAAGGTA...CAGCTCCCTGATGGCTCGGAGATCCCGCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCCTATTCTGCTCGGCAGGCTGGGCTCCGACCCACAGAAGAAGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105904 CTCCTATTCTGCTCGGCAGGCTGGGCTCCGACCCACAGAAGAAGACCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCATTTACGGGCACCTGGATGTGCAGCCTGCAGCCCTGGAGGACGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105954 TGCATTTACGGGCACCTGGATGTGCAGCCTGCAGCCCTGGAGGACGGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACAGCGAGCCCTTCACCCTGGTGGAGCGAGACG         GCAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106004 GGACAGCGAGCCCTTCACCCTGGTGGAGCGAGACGGTG...TAGGCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGTATGGGAGAGGTTCGACTGATGATAAGGGCCCGGTGGCCGGCTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108873 TGTATGGGAGAGGTTCGACTGATGATAAGGGCCCGGTGGCCGGCTGGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACGCCCTGGAAGCGTATCAGAAAACAGGCCAG         GAGATTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108923 AACGCCCTGGAAGCGTATCAGAAAACAGGCCAGGTA...CAGGAGATTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTCAACGTCCGATTCTGCCTCGAAGGCATGGAGGAGTCAGGCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110848 TGTCAACGTCCGATTCTGCCTCGAAGGCATGGAGGAGTCAGGCTCTGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCTAGACGAGCTGATTTTTGCCCGGAAAGACACATTCTTTAAGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110898 GCCTAGACGAGCTGATTTTTGCCCGGAAAGACACATTCTTTAAGGATGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACTATGTCTGCATTTCTGACAATTACTGGCTGGGAAAGAAGAAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110948 GACTATGTCTGCATTTCTGACAATTACTGGCTGGGAAAGAAGAAGCCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATCACCTACGGCCTCAGGGGCATTTGCTACTTTTTCATCGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110998 CATCACCTACGGCCTCAGGGGCATTTGCTACTTTTTCATCGAGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    658   GTGGAGTGCAGCAACAAAGACCTCCATTCTGGGGTGTACGGGGGCTCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112473 AGGTGGAGTGCAGCAACAAAGACCTCCATTCTGGGGTGTACGGGGGCTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGCATGAGGCCATGACTGATCTCATTTTGCTGATGG         GCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 112523 GTGCATGAGGCCATGACTGATCTCATTTTGCTGATGGGTA...CAGGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTTGGTGGACAAGAGGGGGAACATCCTGATCCCCGGCATTAACGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113590 TTTGGTGGACAAGAGGGGGAACATCCTGATCCCCGGCATTAACGAGGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGCCGCCGTCACGGAAGAGGAGCACAAGCTGTACGACGACATCGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113640 TGGCCGCCGTCACGGAAGAGGAGCACAAGCTGTACGACGACATCGACTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACATAGAGGAGTTTGCCAAGGATGTGGGGGCGCAGATCCTCCTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113690 GACATAGAGGAGTTTGCCAAGGATGTGGGGGCGCAGATCCTCCTGCACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCACAAG         AAAGACATCCTCATGCACCGATGGCGGTACCCGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113740 CCACAAGGTC...CAGAAAGACATCCTCATGCACCGATGGCGGTACCCGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTCTGTCCCTCCATGGCATCGAAGGCGCCTTCTCTGGGTCTGGGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116289 CTCTGTCCCTCCATGGCATCGAAGGCGCCTTCTCTGGGTCTGGGGCCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCGTGATTCCCAGGAAGGTGGTTGGCAAGTTCTCCATCAGGCTCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116339 ACCGTGATTCCCAGGAAGGTGGTTGGCAAGTTCTCCATCAGGCTCGTGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAACATGACTCCTGAAGTCGTCGGCGAGCAG         GTCACAAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 116389 GAACATGACTCCTGAAGTCGTCGGCGAGCAGGCA...TAGGTCACAAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACCTAACTAAGAAGTTTGCTGAACTACGCAGCCCCAATGAGTTCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118536 ACCTAACTAAGAAGTTTGCTGAACTACGCAGCCCCAATGAGTTCAAGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TACATGGGCCACGGTGGGAAGCCCTGGGTCTCCGACTTCAGTCACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118586 TACATGGGCCACGGTGGGAAGCCCTGGGTCTCCGACTTCAGTCACCCTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TTACCTGGCTGGGAGAAGAGCCATGAAGACAG         TTTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118636 TTACCTGGCTGGGAGAAGAGCCATGAAGACAGGTT...CAGTTTTTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TTGAGCCAGACTTGACCAGGGAAGGCGGCAGTATTCCCGTGACCTTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118985 TTGAGCCAGACTTGACCAGGGAAGGCGGCAGTATTCCCGTGACCTTGACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TTTCAGGAGGCCACGGGCAAGAACGTCATGCTGCTGCCTGTGGGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119035 TTTCAGGAGGCCACGGGCAAGAACGTCATGCTGCTGCCTGTGGGGTCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGATGACGGAGCCCACTCCCAGAATGAAAAGCTCAACAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 119085 GGATGACGGAGCCCACTCCCAGAATGAAAAGCTCAACAGGTG...CAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATAACTACATAGAGGGAACCAAGATGCTGGCCGCGTACCTGTATGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120028 ATAACTACATAGAGGGAACCAAGATGCTGGCCGCGTACCTGTATGAGGTC

   1500     .    :    .
   1411 TCCCAGCTGAAGGAC
        |||||||||||||||
 120078 TCCCAGCTGAAGGAC