seq1 = pF1KE6404.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KE6404/gi568815579r_9754189.tfa (gi568815579r:9754189_9960797), 206609 bp

>pF1KE6404 1362
>gi568815579r:9754189_9960797 (Chr19)

(complement)

1-63  (24432-24494)   100% ->
64-213  (100004-100153)   100% ->
214-360  (102937-103083)   100% ->
361-580  (103316-103535)   100% ->
581-687  (103885-103991)   100% ->
688-1362  (105935-106609)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCCGCTCACGGTCCCGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGTGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  24432 ATGTGGCCGCTCACGGTCCCGCCGCCGCTGCTGCTGCTGCTGTGCTCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCCGGACAG         ACTCTCTTCCAGAACCCAGAAGAGGGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
  24482 CCTGGCCGGACAGGTA...CAGACTCTCTTCCAGAACCCAGAAGAGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCAGCTGTACACCTCAGCCCAGGCCCCTGACGGGAAATGCATCTGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100032 GGCAGCTGTACACCTCAGCCCAGGCCCCTGACGGGAAATGCATCTGCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCGTGATCCCAGCGCAGAGTACCTGCTCTCGAGATGGCAGGAGTCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100082 GCCGTGATCCCAGCGCAGAGTACCTGCTCTCGAGATGGCAGGAGTCGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCGGCAACTGATGGAGAAG         GTCCAGAACGTCTCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100132 GCTGCGGCAACTGATGGAGAAGGTG...TAGGTCCAGAACGTCTCCCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCATGGAGGTCCTTGAGTTGCGGACGTATCGCGACCTCCAGTATGTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102956 CCATGGAGGTCCTTGAGTTGCGGACGTATCGCGACCTCCAGTATGTACGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCATGGAGACCCTCATGCGGAGCCTGGATGCGCGGCTCCGGGCAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103006 GGCATGGAGACCCTCATGCGGAGCCTGGATGCGCGGCTCCGGGCAGCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGGTCCCTCTCGGCCAAGAGCTTCCAG         GAGCTGAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103056 TGGGTCCCTCTCGGCCAAGAGCTTCCAGGTG...CAGGAGCTGAAGGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGATGACGGAACTGTTGCCCCTGAGCTCGGTCCTGGAGCAGTACAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103329 GGATGACGGAACTGTTGCCCCTGAGCTCGGTCCTGGAGCAGTACAAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACACGCGGACCATTGTACGCTTGCGGGAGGAGGTGAGGAATCTCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 GACACGCGGACCATTGTACGCTTGCGGGAGGAGGTGAGGAATCTCTCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTCTGGCGGCCATTCAGGAGGAGATGGGTGCCTACGGGTATGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 CAGTCTGGCGGCCATTCAGGAGGAGATGGGTGCCTACGGGTATGAGGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCAGCAACGGGTGATGGCCCTGGAGGCCCGGCTCCACGCCTGCGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103479 TGCAGCAACGGGTGATGGCCCTGGAGGCCCGGCTCCACGCCTGCGCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAGCTGG         GCTGTGGGAAGCTGACCGGGGTCAGTAACCCCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103529 AAGCTGGGTA...CAGGCTGTGGGAAGCTGACCGGGGTCAGTAACCCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCGTTCGGGCCATGGGGTCCCGCTTCGGCTCCTGGATGACTGACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103919 CACCGTTCGGGCCATGGGGTCCCGCTTCGGCTCCTGGATGACTGACACGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGCCCCCAGTGCGGATAGCCGG         GTCTGGTACATGGATGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103969 TGGCCCCCAGTGCGGATAGCCGGGTG...TAGGTCTGGTACATGGATGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATTACAAAGGCCGCCGGGTCCTGGAGTTCCGTACCCTGGGAGACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105953 TATTACAAAGGCCGCCGGGTCCTGGAGTTCCGTACCCTGGGAGACTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAAGGCCAGAACTTTATCCAGCACCTGCTGCCCCAGCCGTGGGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106003 CAAAGGCCAGAACTTTATCCAGCACCTGCTGCCCCAGCCGTGGGCGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CGGGCCACGTGGTGTACAACGGCTCCCTGTTCTATAACAAGTACCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106053 CGGGCCACGTGGTGTACAACGGCTCCCTGTTCTATAACAAGTACCAGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACGTGGTGGTCAAATACCACTTCCGCTCGCGCTCTGTGCTGGTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106103 AACGTGGTGGTCAAATACCACTTCCGCTCGCGCTCTGTGCTGGTGCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAGCCTCCCGGGCGCCGGTTACAACAACACCTTCCCCTACTCCTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106153 GAGCCTCCCGGGCGCCGGTTACAACAACACCTTCCCCTACTCCTGGGGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCTTCTCCGACATGGACTTCATGGTGGACGAGAGCGGGCTCTGGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106203 GCTTCTCCGACATGGACTTCATGGTGGACGAGAGCGGGCTCTGGGCTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TACACCACCAACCAGAACGCGGGCAACATCGTGGTCAGCCGGCTGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106253 TACACCACCAACCAGAACGCGGGCAACATCGTGGTCAGCCGGCTGGACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCACACCCTCGAGGTCATGCGGTCCTGGGACACCGGCTACCCCAAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106303 GCACACCCTCGAGGTCATGCGGTCCTGGGACACCGGCTACCCCAAGCGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCGCTGGCGAGGCCTTCATGATCTGCGGTGTGCTCTACGTGACCAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106353 GCGCTGGCGAGGCCTTCATGATCTGCGGTGTGCTCTACGTGACCAACTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CACCTGGCTGGGGCCAAGGTCTACTTCGCCTATTTTACCAACACGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106403 CACCTGGCTGGGGCCAAGGTCTACTTCGCCTATTTTACCAACACGTCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTACGAGTACACGGACGTGCCCTTCCACAACCAGTATTCCCACATCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106453 TTACGAGTACACGGACGTGCCCTTCCACAACCAGTATTCCCACATCTCGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TGCTGGATTACAACCCCCGGGAGCGCGCCCTCTATACCTGGAACAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106503 TGCTGGATTACAACCCCCGGGAGCGCGCCCTCTATACCTGGAACAACGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CACCAGGTGCTCTACAATGTCACCCTGTTTCACGTCATCAGCACCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106553 CACCAGGTGCTCTACAATGTCACCCTGTTTCACGTCATCAGCACCTCTGG

   1400     .
   1356 GGACCCC
        |||||||
 106603 GGACCCC