seq1 = pF1KE6403.tfa, 1533 bp
seq2 = pF1KE6403/gi568815584r_22673613.tfa (gi568815584r:22673613_22913398), 239786 bp

>pF1KE6403 1533
>gi568815584r:22673613_22913398 (Chr14)

(complement)

1-499  (100001-100499)   100% ->
500-625  (133348-133473)   100% ->
626-770  (134462-134606)   100% ->
771-894  (137081-137204)   100% ->
895-998  (137463-137566)   100% ->
999-1095  (137859-137955)   100% ->
1096-1245  (138896-139045)   100% ->
1246-1429  (139283-139466)   100% ->
1430-1533  (139683-139786)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTGACAGCACTGAGTATGAAGTGGCCTCCCAGCCTGAGGTGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTGACAGCACTGAGTATGAAGTGGCCTCCCAGCCTGAGGTGGAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCCCTTTGGGTGATGGGGCCAGCCCAGGGCCGGAGCAGGTGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCCCTTTGGGTGATGGGGCCAGCCCAGGGCCGGAGCAGGTGAAGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGGAGATCTCACTGCTTAACGGCGTGTGCCTGATTGTGGGGAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGGAGATCTCACTGCTTAACGGCGTGTGCCTGATTGTGGGGAACATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGGCTCGGGCATCTTTGTTTCCCCCAAGGGTGTGCTCATATACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCGGCTCGGGCATCTTTGTTTCCCCCAAGGGTGTGCTCATATACAGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCTTTGGTCTCTCTCTGGTCATCTGGGCTGTCGGGGGCCTCTTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCTTTGGTCTCTCTCTGGTCATCTGGGCTGTCGGGGGCCTCTTCTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTTGGGGCCCTTTGTTATGCGGAACTGGGCACCACCATTAAGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTTGGGGCCCTTTGTTATGCGGAACTGGGCACCACCATTAAGAAATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGCCAGCTATGCCTATATCCTGGAGGCCTTTGGAGGATTCCTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGCCAGCTATGCCTATATCCTGGAGGCCTTTGGAGGATTCCTTGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCAGACTCTGGACCTCCCTGCTCATCATTGAGCCCACCAGCCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCAGACTCTGGACCTCCCTGCTCATCATTGAGCCCACCAGCCAGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATTGCCATCACCTTTGCCAACTACATGGTACAGCCTCTCTTCCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATTGCCATCACCTTTGCCAACTACATGGTACAGCCTCTCTTCCCGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCTTCGCCCCTTATGCTGCCAGCCGCCTGCTGGCTGCTGCCTGCATTT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100451 TGCTTCGCCCCTTATGCTGCCAGCCGCCTGCTGGCTGCTGCCTGCATTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500         GTCTCTTAACCTTCATTAACTGTGCCTATGTCAAATGGGGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TA...CAGGTCTCTTAACCTTCATTAACTGTGCCTATGTCAAATGGGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCTGGTACAAGATATTTTCACCTATGCTAAAGTATTGGCACTGATCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133390 CCCTGGTACAAGATATTTTCACCTATGCTAAAGTATTGGCACTGATCGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTCATCGTTGCAGGCATTGTTAGACTTGGCCAGG         GAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 133440 GTCATCGTTGCAGGCATTGTTAGACTTGGCCAGGGTA...CAGGAGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TACTCATTTTGAGAATTCCTTTGAGGGTTCATCATTTGCAGTGGGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134469 TACTCATTTTGAGAATTCCTTTGAGGGTTCATCATTTGCAGTGGGTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTGCCCTGGCACTGTACTCAGCTCTGTTCTCCTACTCAGGCTGGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134519 TTGCCCTGGCACTGTACTCAGCTCTGTTCTCCTACTCAGGCTGGGACACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTCAACTATGTCACTGAAGAGATCAAGAATCCTGAGAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 134569 CTCAACTATGTCACTGAAGAGATCAAGAATCCTGAGAGGTA...TAGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCTGCCCCTCTCCATTGGCATCTCCATGCCCATTGTCACCATCATCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137084 CCTGCCCCTCTCCATTGGCATCTCCATGCCCATTGTCACCATCATCTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTTGACCAATGTGGCCTATTATACTGTGCTAGACATGAGAGACATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137134 TCTTGACCAATGTGGCCTATTATACTGTGCTAGACATGAGAGACATCTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCCAGTGATGCTGTTGCTGTG         ACTTTTGCAGATCAGATATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 137184 GCCAGTGATGCTGTTGCTGTGGTA...TAGACTTTTGCAGATCAGATATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGGAATATTTAACTGGATAATTCCACTGTCAGTTGCATTATCCTGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137483 TGGAATATTTAACTGGATAATTCCACTGTCAGTTGCATTATCCTGTTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GTGGCCTCAATGCCTCCATTGTGGCTGCTTCTAG         GCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 137533 GTGGCCTCAATGCCTCCATTGTGGCTGCTTCTAGGTA...TAGGCTTTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTTGTGGGCTCAAGAGAAGGCCATCTCCCTGATGCCATCTGCATGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137866 TTTGTGGGCTCAAGAGAAGGCCATCTCCCTGATGCCATCTGCATGATCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGTTGAGCGGTTCACACCAGTGCCTTCTCTGCTCTTCAAT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 137916 TGTTGAGCGGTTCACACCAGTGCCTTCTCTGCTCTTCAATGTA...CAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GTATCATGGCATTGATCTACTTGTGCGTGGAAGACATCTTCCAGCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138897 GTATCATGGCATTGATCTACTTGTGCGTGGAAGACATCTTCCAGCTCATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AACTACTACAGCTTCAGCTACTGGTTCTTTGTGGGGCTTTCTATTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138947 AACTACTACAGCTTCAGCTACTGGTTCTTTGTGGGGCTTTCTATTGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCAGCTTTATCTGCGCTGGAAGGAGCCTGATCGACCTCGTCCCCTCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 138997 TCAGCTTTATCTGCGCTGGAAGGAGCCTGATCGACCTCGTCCCCTCAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1246         CTCAGCGTTTTCTTCCCGATTGTCTTCTGCCTCTGCACCATC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139047 TA...TAGCTCAGCGTTTTCTTCCCGATTGTCTTCTGCCTCTGCACCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTCCTGGTGGCTGTTCCACTTTACAGTGATACTATCAACTCCCTCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139325 TTCCTGGTGGCTGTTCCACTTTACAGTGATACTATCAACTCCCTCATCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CATTGCCATTGCCCTCTCAGGCCTGCCCTTTTACTTCCTCATCATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139375 CATTGCCATTGCCCTCTCAGGCCTGCCCTTTTACTTCCTCATCATCAGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGCCAGAACATAAGCGACCGCTTTACCTCCGAAGGATCGTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 139425 TGCCAGAACATAAGCGACCGCTTTACCTCCGAAGGATCGTGGGTA...TA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1430  GGTCTGCCACAAGGTACCTCCAGGTCCTGTGTATGTCAGTTGCTGCAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139682 GGGTCTGCCACAAGGTACCTCCAGGTCCTGTGTATGTCAGTTGCTGCAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 AATGGATTTGGAAGATGGAGGAGAGATGCCCAAGCAACGGGATCCCAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 139732 AATGGATTTGGAAGATGGAGGAGAGATGCCCAAGCAACGGGATCCCAAAT

   1600     .
   1529 CTAAC
        |||||
 139782 CTAAC