seq1 = pF1KE6397.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KE6397/gi568815591f_75782074.tfa (gi568815591f:75782074_75988346), 206273 bp

>pF1KE6397 669
>gi568815591f:75782074_75988346 (Chr7)

1-163  (100001-100163)   100% ->
164-314  (101625-101775)   99% ->
315-669  (105919-106273)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGAGTCACCACCGTCCGTTCTCGGATGAGGCGGGCCCTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGAGTCACCACCGTCCGTTCTCGGATGAGGCGGGCCCTGGTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCATGGTTGTGCCCTCAGTCCTGGTTCCGTGGCTCCTGCTGGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCATGGTTGTGCCCTCAGTCCTGGTTCCGTGGCTCCTGCTGGGTGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTGGCTCATTCCCCAGACCTCTTTCCTCAGTAATGTCTGCGGGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTGGCTCATTCCCCAGACCTCTTTCCTCAGTAATGTCTGCGGGCTGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGGGCTGGCCT         ATGGCCTCACCTACTGCTATTCCATCGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCGGGCTGGCCTGTA...CAGATGGCCTCACCTACTGCTATTCCATCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTCTCAGAGCGAGTGGCGCTGAAGCTCGATCAGACCTTCCCCTTCAGCC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 101653 CCTCTCAGAGCGAGTGGCACTGAAGCTCGATCAGACCTTCCCCTTCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGATGAGGAGGATATCCGTGTTCAAGTACGTCTCAGGGTCTTCAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101703 TGATGAGGAGGATATCCGTGTTCAAGTACGTCTCAGGGTCTTCAGCCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGAGGGCAGCCCAGAGCCGGAA         ACTGAACCCGGTGCCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101753 AGGAGGGCAGCCCAGAGCCGGAAGTA...CAGACTGAACCCGGTGCCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTCCTACCCCACACAGAGCTGCCACCCTCACCTGTCCCCAAGCCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105937 CTCCTACCCCACACAGAGCTGCCACCCTCACCTGTCCCCAAGCCACCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTCCCAGACGCAGCACGCCAGTGGTCAGAAGCTGGCCTCCTGGCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105987 TGTCCCAGACGCAGCACGCCAGTGGTCAGAAGCTGGCCTCCTGGCCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGCACCCCCGGGCACATGCCCACCTTGCCTCCGTACCAGCCTGCCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106037 TGCACCCCCGGGCACATGCCCACCTTGCCTCCGTACCAGCCTGCCTCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGTGCTATGTGCAGAACCACTTTGGTCCAAACCCCACCTCCTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106087 CCTGTGCTATGTGCAGAACCACTTTGGTCCAAACCCCACCTCCTCCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCTACCCAGCTTCTGCGGGCACCTCCCTGGGCATCCAGCCCCCCACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106137 TCTACCCAGCTTCTGCGGGCACCTCCCTGGGCATCCAGCCCCCCACGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGAACAGCCCTGGCACGGTGTATTCTGGGGCCTTGGGCACACCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106187 GTGAACAGCCCTGGCACGGTGTATTCTGGGGCCTTGGGCACACCAGGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .
    633 TGCAGGCTCCAAGGAGTCCTCCAGGGTCCCCATGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106237 TGCAGGCTCCAAGGAGTCCTCCAGGGTCCCCATGCCC