seq1 = pF1KE6389.tfa, 1155 bp
seq2 = pF1KE6389/gi568815590r_20049676.tfa (gi568815590r:20049676_20280964), 231289 bp

>pF1KE6389 1155
>gi568815590r:20049676_20280964 (Chr8)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-488  (101481-101844)   100% ->
489-547  (102472-102530)   100% ->
548-631  (106521-106604)   100% ->
632-724  (107837-107929)   100% ->
725-814  (109471-109560)   100% ->
815-858  (109819-109862)   100% ->
859-919  (115858-115918)   100% ->
920-1015  (116001-116096)   100% ->
1016-1094  (130221-130299)   100% ->
1095-1155  (131238-131295)   93%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCGGACCATTCTGGATGCTCCCCAGCGGTTGCTGAAGGAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCGGACCATTCTGGATGCTCCCCAGCGGTTGCTGAAGGAGGGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCGTCCCGGCAGCTGGTGCTGGTGGTGGTATTCGTCGCTTTGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCGTCCCGGCAGCTGGTGCTGGTGGTGGTATTCGTCGCTTTGCTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACATGCTGTTTACTGTGGTGG         TGCCAATTGTGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 ACAACATGCTGTTTACTGTGGTGGGTA...CAGTGCCAATTGTGCCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCCTATATGACATGGAGTTCAAAGAAGTCAACTCTTCTCTGCACCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 TTCCTATATGACATGGAGTTCAAAGAAGTCAACTCTTCTCTGCACCTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCATGCCGGAAGTTCCCCACATGCCCTCGCCTCTCCTGCCTTTTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 CCATGCCGGAAGTTCCCCACATGCCCTCGCCTCTCCTGCCTTTTCCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTTCTCCTTCTTCAACAACAACACCGTGGCTGTTGAAGAAAGCGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101598 TCTTCTCCTTCTTCAACAACAACACCGTGGCTGTTGAAGAAAGCGTACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGTGGAATAGCATGGATGAATGACACTGCCAGCACCATCCCACCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101648 AGTGGAATAGCATGGATGAATGACACTGCCAGCACCATCCCACCTCCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACTGAAGCCATCTCAGCTCATAAAAACAACTGCTTGCAAGGCACAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101698 CACTGAAGCCATCTCAGCTCATAAAAACAACTGCTTGCAAGGCACAGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTTGGAGGAAGAGATTACCCGGGTCGGGGTTCTGTTTGCTTCAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101748 TCTTGGAGGAAGAGATTACCCGGGTCGGGGTTCTGTTTGCTTCAAAGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGATGCAACTTCTGGTCAACCCATTCGTGGGCCCTCTCACCAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101798 GTGATGCAACTTCTGGTCAACCCATTCGTGGGCCCTCTCACCAACAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    489       GATTGGATATCATATCCCCATGTTTGCTGGCTTTGTTATCATGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101848 ...TAGGATTGGATATCATATCCCCATGTTTGCTGGCTTTGTTATCATGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTCTCTCCACAGTTA         TGTTTGCTTTTTCTGGGACCTATACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102516 TTCTCTCCACAGTTAGTA...CAGTGTTTGCTTTTTCTGGGACCTATACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTACTCTTTGTGGCCCGAACCCTTCAAGGCATTGGATCTTCATTTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106547 CTACTCTTTGTGGCCCGAACCCTTCAAGGCATTGGATCTTCATTTTCATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGTTGCAG         GTCTTGGAATGCTGGCCAGTGTCTACACTGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106597 TGTTGCAGGTA...CAGGTCTTGGAATGCTGGCCAGTGTCTACACTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCATGAGAGAGGACGAGCCATGGGAACTGCTCTGGGGGGCCTGGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107870 ACCATGAGAGAGGACGAGCCATGGGAACTGCTCTGGGGGGCCTGGCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGTTGCTGG         TGGGAGCTCCCTTTGGAAGTGTAATGTACGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 107920 GGGTTGCTGGGTA...CAGTGGGAGCTCCCTTTGGAAGTGTAATGTACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTTTGTTGGGAAGTCTGCACCCTTCCTCATCCTGGCCTTCCTGGCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109502 GTTTGTTGGGAAGTCTGCACCCTTCCTCATCCTGGCCTTCCTGGCACTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGATGGAG         CACTCCAGCTTTGCATCCTACAGCCTTCCAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109552 TGGATGGAGGTA...TAGCACTCCAGCTTTGCATCCTACAGCCTTCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTCTCTCCTGAG         AGTGCCAAGGGGACTCCCCTCTTTATGCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109851 GTCTCTCCTGAGGTA...CAGAGTGCCAAGGGGACTCCCCTCTTTATGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTCAAAGACCCTTACATCCTGGTGGCTGCAG         GGTCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 115887 TCTCAAAGACCCTTACATCCTGGTGGCTGCAGGTA...CAGGGTCCATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCTTTGCCAACATGGGGGTGGCCATCCTGGAGCCCACACTGCCCATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116010 GCTTTGCCAACATGGGGGTGGCCATCCTGGAGCCCACACTGCCCATCTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATGATGCAGACCATGTGCTCCCCCAAGTGGCAGCTGG         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 116060 ATGATGCAGACCATGTGCTCCCCCAAGTGGCAGCTGGGTA...CAGGTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGCTTTCTTGCCTGCCAGTGTGTCCTACCTCATTGGCACCAACCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130225 AGCTTTCTTGCCTGCCAGTGTGTCCTACCTCATTGGCACCAACCTCTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTGTGTTGGCCAACAAGATGGGTCG         GTGGCTGTGTTCCCTA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 130275 GTGTGTTGGCCAACAAGATGGGTCGGTA...CAGGTGGCTGTGTTCCCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1111 ATCGGGATGCTGGTAGTAGGTACCAGCTTGCTCTGTCTACCAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||--|-||
 131254 ATCGGGATGCTGGTAGTAGGTACCAGCTTGCTCTGTGTA  A GT