seq1 = pF1KE6350.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KE6350/gi568815591r_49837531.tfa (gi568815591r:49837531_50193194), 355664 bp

>pF1KE6350 1053
>gi568815591r:49837531_50193194 (Chr7)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-208  (103486-103566)   100% ->
209-334  (111296-111421)   100% ->
335-487  (135054-135206)   100% ->
488-706  (161885-162103)   100% ->
707-783  (174879-174955)   100% ->
784-961  (209676-209853)   100% ->
962-1053  (255573-255664)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAG         TTGGACACTTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 CCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGGTG...TAGTTGGACACTTGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGATTACCAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103500 CGATTACCAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCAACAAGTTTTCCAG         TGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103550 ATCAACAAGTTTTCCAGGTA...CAGTGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111320 AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGATAGACCCATCATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111370 CTGATAGACCCATCATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AG         TAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111420 AGGTA...TAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135093 TTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135143 CTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATATGCTATATATG         CTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 135193 ATATGCTATATATGGTA...CAGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTTCACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161912 AGTTCACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACTGCTTCTTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161962 TCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACTGCTTCTTGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162012 TTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 162062 AAAGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGGTA...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    707  TTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGACCATAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174878 GTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGACCATAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAG         GCTAAAAATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 174928 CTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGTA...TAGGCTAAAAATCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209689 TAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209739 CAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209789 TAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTCCTGAGTGCTGTG         TGATCTGCAGCCCTGGATCATATAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 209839 GTCCTGAGTGCTGTGGTA...CAGTGATCTGCAGCCCTGGATCATATAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255599 CCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATGG

   1100     .    :    .
   1038 AGCAAAAACGTGCTTA
        ||||||||||||||||
 255649 AGCAAAAACGTGCTTA