seq1 = pF1KE6341.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KE6341/gi568815579f_33589262.tfa (gi568815579f:33589262_33873060), 283799 bp

>pF1KE6341 1272
>gi568815579f:33589262_33873060 (Chr19)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-168  (182152-182189)   100% ->
169-1272  (182696-183799)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTGCGACCTGGAACAATGCGGCTGGCCTGCATGTTCTCTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTGCGACCTGGAACAATGCGGCTGGCCTGCATGTTCTCTTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGTTCGGAGCTGCAGGCCTCCTCCTCTTCATCAGCCTGCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGTTCGGAGCTGCAGGCCTCCTCCTCTTCATCAGCCTGCAGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTACGGAGCTCGCCCCCCAGCAGGTGCCAG         GAATAAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 CTACGGAGCTCGCCCCCCAGCAGGTGCCAGGTG...CAGGAATAAAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACATCAGGCCAAGGCAGCCCCACCAC         GACCTCCCACCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 182163 AACATCAGGCCAAGGCAGCCCCACCACGTA...CAGGACCTCCCACCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGGCTCCCAGGATGGTGACTTGAAGGAACCCACAGAGAGGGTCACTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182710 CGGCTCCCAGGATGGTGACTTGAAGGAACCCACAGAGAGGGTCACTCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTATCCAGTGGGGCCCCGAGGGGCCGCAACCTGCCAGCGCCTGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182760 ACTTATCCAGTGGGGCCCCGAGGGGCCGCAACCTGCCAGCGCCTGACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTCAACCCCCGCTGCAGAGGGGAACCCGTCTGCGGCTCCGCCAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182810 CCTCAACCCCCGCTGCAGAGGGGAACCCGTCTGCGGCTCCGCCAGCGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGCCGTCTGCTCATCAAGAAAATGCCAGCTGCGGCGACCATCCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182860 TCGCCGTCTGCTCATCAAGAAAATGCCAGCTGCGGCGACCATCCCGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAGCTCGGACGCGCCCTTCATCCGGCCGGGACCCGGGACGCTGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182910 ACAGCTCGGACGCGCCCTTCATCCGGCCGGGACCCGGGACGCTGGATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGCTGGGTCAGCCTGCACCGGAGCCAGCAGGAGCGCAAGCGGGTGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182960 CGCTGGGTCAGCCTGCACCGGAGCCAGCAGGAGCGCAAGCGGGTGATGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGGCCTGCGCCAAGTACCGGGCGAGCAGCAGCCGCCGGGCCGTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183010 GGAGGCCTGCGCCAAGTACCGGGCGAGCAGCAGCCGCCGGGCCGTCACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCGCCACGTGTCCCGTATCTTCGTGGAGGACCGCCACCGCGTGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183060 CCCGCCACGTGTCCCGTATCTTCGTGGAGGACCGCCACCGCGTGCTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGCGAGGTGCCCAAGGCCGGCTGCTCCAATTGGAAGCGGGTGCTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183110 TGCGAGGTGCCCAAGGCCGGCTGCTCCAATTGGAAGCGGGTGCTCATGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCTGGCCGGCCTGGCCTCGTCCACTGCCGACATCCAGCACAACACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183160 GCTGGCCGGCCTGGCCTCGTCCACTGCCGACATCCAGCACAACACCGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACTATGGCAGCGCTCTCAAGCGCCTGGACACCTTCGACCGCCAGGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183210 ACTATGGCAGCGCTCTCAAGCGCCTGGACACCTTCGACCGCCAGGGTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TTGCACCGTCTCAGCACCTACACCAAGATGCTCTTTGTCCGCGAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183260 TTGCACCGTCTCAGCACCTACACCAAGATGCTCTTTGTCCGCGAGCCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CGAGAGGCTGGTGTCCGCCTTCCGCGACAAGTTTGAGCACCCCAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183310 CGAGAGGCTGGTGTCCGCCTTCCGCGACAAGTTTGAGCACCCCAACAGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACTATCACCCGGTCTTCGGCAAGGCCATCCTGGCCCGGTACCGCGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183360 ACTATCACCCGGTCTTCGGCAAGGCCATCCTGGCCCGGTACCGCGCCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCCTCTCGGGAGGCCCTGCGGACCGGCTCTGGGGTGCGTTTTCCCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183410 GCCTCTCGGGAGGCCCTGCGGACCGGCTCTGGGGTGCGTTTTCCCGAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CGTCCAGTACCTGCTGGACGTGCACCGGCCCGTGGGGATGGACATTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183460 CGTCCAGTACCTGCTGGACGTGCACCGGCCCGTGGGGATGGACATTCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GGGACCATGTCAGCCGGCTCTGCAGCCCCTGCCTCATCGACTACGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183510 GGGACCATGTCAGCCGGCTCTGCAGCCCCTGCCTCATCGACTACGATTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTAGGCAAGTTCGAGAGCATGGAGGACGATGCCAACTTCTTCCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183560 GTAGGCAAGTTCGAGAGCATGGAGGACGATGCCAACTTCTTCCTGAGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CATCCGCGCGCCGCGGAACCTGACCTTCCCCCGGTTCAAGGACCGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183610 CATCCGCGCGCCGCGGAACCTGACCTTCCCCCGGTTCAAGGACCGGCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CGCAGGAGGCGCGGACCACAGCGAGGATCGCCCACCAGTACTTCGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183660 CGCAGGAGGCGCGGACCACAGCGAGGATCGCCCACCAGTACTTCGCCCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTCTCGGCCCTGCAAAGGCAGCGCACCTACGACTTCTACTACATGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183710 CTCTCGGCCCTGCAAAGGCAGCGCACCTACGACTTCTACTACATGGATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CCTGATGTTCAACTATTCCAAGCCCTTTGCAGATCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183760 CCTGATGTTCAACTATTCCAAGCCCTTTGCAGATCTGTAC