seq1 = pF1KE6339.tfa, 1287 bp
seq2 = pF1KE6339/gi568815583r_45385166.tfa (gi568815583r:45385166_45622354), 237189 bp

>pF1KE6339 1287
>gi568815583r:45385166_45622354 (Chr15)

(complement)

1-391  (100001-100391)   100% ->
392-538  (111071-111217)   100% ->
539-692  (131474-131627)   100% ->
693-894  (133313-133514)   100% ->
895-1000  (134723-134828)   100% ->
1001-1135  (135610-135744)   100% ->
1136-1287  (137038-137189)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGCTCTGGCGCGTGGAAGCGCCTCAAATCTATGCTAAGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGCTCTGGCGCGTGGAAGCGCCTCAAATCTATGCTAAGGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATGCGCCGCTGTTTTTAAATGACACCAGCGCCTTTGACTTCTCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATGCGCCGCTGTTTTTAAATGACACCAGCGCCTTTGACTTCTCGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCGGGGGACGAGGGGCTTTCTCGGTTCAACAAACTTCGAGTTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCGGGGGACGAGGGGCTTTCTCGGTTCAACAAACTTCGAGTTGTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGATGACGGTTCCGAAGCCCCGGAAAGGCCTGTTAACGGGGCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGATGACGGTTCCGAAGCCCCGGAAAGGCCTGTTAACGGGGCGCACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACCCTCCAGGCCGACGATGATTCCTTACTGGACCAAGACTTACCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACCCTCCAGGCCGACGATGATTCCTTACTGGACCAAGACTTACCTTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAACAGTCAGCTGAGTTTGAAGGTGGACTCCTGTGACAACTGCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAACAGTCAGCTGAGTTTGAAGGTGGACTCCTGTGACAACTGCAGCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGAGAGAGATACTGAAGCAGAGAAAGGTGAAAGCCAGGTTGACCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGAGAGAGATACTGAAGCAGAGAAAGGTGAAAGCCAGGTTGACCATTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCGTTCTGTACTTGCTTTTCATGATTGGAGAACTTGTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100351 TGCCGTTCTGTACTTGCTTTTCATGATTGGAGAACTTGTAGGTG...AAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGGATACATTGCAAATAGCCTAGCAATCATGACAGATGCACTTCATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111071 GTGGATACATTGCAAATAGCCTAGCAATCATGACAGATGCACTTCATATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTAACTGACCTAAGCGCCATCATACTCACCCTGCTTGCTTTGTGGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111121 TTAACTGACCTAAGCGCCATCATACTCACCCTGCTTGCTTTGTGGCTATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATCAAAATCACCAACCAAAAGATTCACCTTTGGATTTCATCGCTTAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111171 ATCAAAATCACCAACCAAAAGATTCACCTTTGGATTTCATCGCTTAGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    539       AGGTTTTGTCAGCTATGATTAGTGTGCTGTTGGTGTATATACTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111221 ...TAGAGGTTTTGTCAGCTATGATTAGTGTGCTGTTGGTGTATATACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATGGGATTCCTCTTATATGAAGCTGTGCAAAGAACTATCCATATGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131518 ATGGGATTCCTCTTATATGAAGCTGTGCAAAGAACTATCCATATGAACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGAAATAAATGGAGATATAATGCTCATCACCGCAGCTGTTGGAGTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131568 TGAAATAAATGGAGATATAATGCTCATCACCGCAGCTGTTGGAGTTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTAATGTAAT         AATGGGGTTTCTGTTGAACCAGTCTGGTCAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131618 TTAATGTAATGTA...CAGAATGGGGTTTCTGTTGAACCAGTCTGGTCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGTCACTCCCATTCCCACTCCCTGCCTTCAAATTCCCCTACCAGAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133344 CGTCACTCCCATTCCCACTCCCTGCCTTCAAATTCCCCTACCAGAGGTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGGGTGTGAACGTAACCATGGGCAGGATAGCCTGGCAGTGAGAGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133394 TGGGTGTGAACGTAACCATGGGCAGGATAGCCTGGCAGTGAGAGCTGCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTGTACATGCTTTGGGAGATTTGGTACAGAGTGTTGGTGTGCTAATAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133444 TTGTACATGCTTTGGGAGATTTGGTACAGAGTGTTGGTGTGCTAATAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GCATACATCATACGATTCAAG         CCAGAATACAAGATTGCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 133494 GCATACATCATACGATTCAAGGTA...TAGCCAGAATACAAGATTGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCCCATCTGTACATACGTATTTTCATTACTTGTGGCTTTTACAACATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134743 CCCCATCTGTACATACGTATTTTCATTACTTGTGGCTTTTACAACATTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GAATCATATGGGATACAGTAGTTATAATACTAGAAG         GTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 134793 GAATCATATGGGATACAGTAGTTATAATACTAGAAGGTA...TAGGTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCAAGCCATTTGAATGTAGACTATATCAAAGAAGCCTTGATGAAAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135615 CCAAGCCATTTGAATGTAGACTATATCAAAGAAGCCTTGATGAAAATAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGATGTATATTCAGTCGAAGATTTAAATATCTGGTCTCTCACTTCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135665 AGATGTATATTCAGTCGAAGATTTAAATATCTGGTCTCTCACTTCAGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AATCTACTGCCATAGTTCACATACAGCTAA         TTCCTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 135715 AATCTACTGCCATAGTTCACATACAGCTAAGTA...CAGTTCCTGGAAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCATCTAAATGGGAGGAAGTACAGTCCAAAGCAAACCATTTATTATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137049 TCATCTAAATGGGAGGAAGTACAGTCCAAAGCAAACCATTTATTATTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CACATTTGGCATGTATAGATGTACTATTCAGCTTCAGAGTTACAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137099 CACATTTGGCATGTATAGATGTACTATTCAGCTTCAGAGTTACAGGCAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AAGTGGACAGAACTTGTGCAAATTGTCAGAGTTCTAGTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137149 AAGTGGACAGAACTTGTGCAAATTGTCAGAGTTCTAGTCCC