seq1 = pF1KE6326.tfa, 1290 bp
seq2 = pF1KE6326/gi568815596r_210088964.tfa (gi568815596r:210088964_210325263), 236300 bp

>pF1KE6326 1290
>gi568815596r:210088964_210325263 (Chr2)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-233  (104462-104617)   100% ->
234-371  (107162-107299)   100% ->
372-536  (108753-108917)   100% ->
537-603  (115002-115068)   100% ->
604-768  (119468-119632)   100% ->
769-870  (120582-120683)   100% ->
871-984  (121820-121933)   100% ->
985-1112  (129926-130053)   100% ->
1113-1199  (132374-132460)   100% ->
1200-1290  (136210-136300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCACGCCTTCTCCGAGGGTCCCTACGCGTCCTGGGCGGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCACGCCTTCTCCGAGGGTCCCTACGCGTCCTGGGCGGCCACCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGCCGCGCCAGCTGCCCGCCGCGCG         ATGTTCTCATTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 TGCGCCGCGCCAGCTGCCCGCCGCGCGGTG...AAGATGTTCTCATTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGGGGAAGAACGTCTAGAAACTCCTTCTGCTAAAAAATTAACAGATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104476 GAGGGGAAGAACGTCTAGAAACTCCTTCTGCTAAAAAATTAACAGATATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAATTCGAAGAATCTTTTCTCCAGAGCATGACATTTTCCGGAAAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104526 GGAATTCGAAGAATCTTTTCTCCAGAGCATGACATTTTCCGGAAAAGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGGAAGTTTTTCCAAGAAGAAGTGATTCCTCATCACTCAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104576 AAGGAAGTTTTTCCAAGAAGAAGTGATTCCTCATCACTCAGAGTA...CA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    234  ATGGGAGAAAGCTGGAGAAGTAAGTAGGGAGGTTTGGGAAAAAGCTGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107161 GATGGGAGAAAGCTGGAGAAGTAAGTAGGGAGGTTTGGGAAAAAGCTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAACAAGGACTGCTTGGTGTCAATATTGCAGAGCATCTTGGTGGAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107211 AAACAAGGACTGCTTGGTGTCAATATTGCAGAGCATCTTGGTGGAATTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGGGATCTGTACTCCGCAGCTATTGTCTGGGAGGAGCA         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107261 AGGGGATCTGTACTCCGCAGCTATTGTCTGGGAGGAGCAGTA...AAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTATTCAAATTGTTCAGGCCCAGGTTTTAGTATTCATTCAGGTATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108755 CTTATTCAAATTGTTCAGGCCCAGGTTTTAGTATTCATTCAGGTATTGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATGTCCTATATTACAAACCATGGCTCAGAAGAACAGATTAAGCACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108805 ATGTCCTATATTACAAACCATGGCTCAGAAGAACAGATTAAGCACTTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCCCCAGATGACTGCAGGCAAATGTATTGGTGCAATAGCAATGACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108855 TCCCCAGATGACTGCAGGCAAATGTATTGGTGCAATAGCAATGACAGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGAGCTGGAAG         TGACTTACAGGGAATAAAAACAAATGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108905 CTGGAGCTGGAAGGTA...CAGTGACTTACAGGGAATAAAAACAAATGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAAAGGATGGAAGTGACTGGATTCTCAATGGAAGCAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115030 AAAAAGGATGGAAGTGACTGGATTCTCAATGGAAGCAAGGTG...CAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTCATCAGTAATGGGTCATTAAGTGATGTTGTGATTGTAGTTGCGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119470 GTTCATCAGTAATGGGTCATTAAGTGATGTTGTGATTGTAGTTGCGGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAAATCATGAAGCTCCCTCCCCTGCCCATGGTATTAGCCTTTTTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119520 CAAATCATGAAGCTCCCTCCCCTGCCCATGGTATTAGCCTTTTTCTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAAATGGAATGAAAGGATTTATCAAGGGACGAAAGCTACATAAAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119570 GAAAATGGAATGAAAGGATTTATCAAGGGACGAAAGCTACATAAAATGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATTAAAAGCCCAG         GATACCGCAGAACTATTCTTTGAAGATA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 119620 ATTAAAAGCCCAGGTG...TAGGATACCGCAGAACTATTCTTTGAAGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TACGGTTGCCAGCTAGTGCCCTACTTGGAGAAGAGAATAAAGGCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120610 TACGGTTGCCAGCTAGTGCCCTACTTGGAGAAGAGAATAAAGGCTTCTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TACATCATGAAAGAGCTTCCACAG         GAAAGGCTGTTAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 120660 TACATCATGAAAGAGCTTCCACAGGTC...TAGGAAAGGCTGTTAATTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGATGTGGCAATTTCAGCTAGTGAATTCATGTTTGAAGAAACCAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121837 TGATGTGGCAATTTCAGCTAGTGAATTCATGTTTGAAGAAACCAGGAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGTTAAACAAAGAAAAGCTTTTGGCAAAACAGTTGCTCACCTACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 121887 ATGTTAAACAAAGAAAAGCTTTTGGCAAAACAGTTGCTCACCTACAGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    985       ACAGTGCAACATAAATTAGCAGAATTAAAAACACATATATGTGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121937 ...AAGACAGTGCAACATAAATTAGCAGAATTAAAAACACATATATGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AACCCGAGCATTTGTGGACAACTGTCTCCAGCTGCATGAAGCGAAACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129970 AACCCGAGCATTTGTGGACAACTGTCTCCAGCTGCATGAAGCGAAACGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGGACTCCGCCACTGCTTGCATGGCGAAATATTG         GGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 130020 TGGACTCCGCCACTGCTTGCATGGCGAAATATTGGTA...TAGGGCATCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGTTACAAAATAGTGTAGCTTACGACTGTGTACAGCTCCATGGAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132381 GAGTTACAAAATAGTGTAGCTTACGACTGTGTACAGCTCCATGGAGGTTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGGATACATGTGGGAGTACCCAATTGCAAA         AGCTTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 132431 GGGATACATGTGGGAGTACCCAATTGCAAAGTA...CAGAGCTTATGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATGCCAGAGTTCAGCCAATCTATGGTGGTACAAATGAAATAATGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136221 ATGCCAGAGTTCAGCCAATCTATGGTGGTACAAATGAAATAATGAAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :
   1261 CTGATTGCAAGAGAGATTGTCTTTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 136271 CTGATTGCAAGAGAGATTGTCTTTGACAAG