seq1 = pF1KE6321.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KE6321/gi568815576r_36127407.tfa (gi568815576r:36127407_36331468), 204062 bp

>pF1KE6321 1011
>gi568815576r:36127407_36331468 (Chr22)

(complement)

4-137  (99997-100129)   98% ->
138-1011  (103189-104062)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      4 AACCCAGAGAGCAGTATCTTTATTGAGGATTACCTTAAGTATTTCCAGGA
        ||| -|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 AACT AGAGAGCAGTATCTTTATTGAGGATTACCTTAAGTATTTCCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 CCAAGTGAGCAGAGAGAATCTGCTACAACTGCTGACTGATGATGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 CCAAGTGAGCAGAGAGAATCTGCTACAACTGCTGACTGATGATGAAGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 GGAATGGATTCGTGGCTGCTGCTGAACTGCCCAG         GGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100096 GGAATGGATTCGTGGCTGCTGCTGAACTGCCCAGGTA...CAGGGATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145 GCAGATGAGCTCCGTAAAGCTCTGAACAAGCTTGCAAGTCACATGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103196 GCAGATGAGCTCCGTAAAGCTCTGAACAAGCTTGCAAGTCACATGGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 GAAGGACAAAAACCGCCACGATAAAGACCAGCAGCACAGGCAGTGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103246 GAAGGACAAAAACCGCCACGATAAAGACCAGCAGCACAGGCAGTGGTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 TGAAAGAGTTTCCTCGGTTGAAAAGGGAGCTTGAGGATCACATAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103296 TGAAAGAGTTTCCTCGGTTGAAAAGGGAGCTTGAGGATCACATAAGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 CTCCGTGCCCTTGCAGAGGAGGTTGAGCAGGTCCACAGAGGCACCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103346 CTCCGTGCCCTTGCAGAGGAGGTTGAGCAGGTCCACAGAGGCACCACCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 TGCCAATGTGGTGTCCAACTCTGTTGGCACTACCTCTGGCATCCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103396 TGCCAATGTGGTGTCCAACTCTGTTGGCACTACCTCTGGCATCCTGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395 TCCTCGGCCTGGGTCTGGCACCCTTCACAGAAGGAATCAGTTTTGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103446 TCCTCGGCCTGGGTCTGGCACCCTTCACAGAAGGAATCAGTTTTGTGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    445 TTGGACACTGGCATGGGTCTGGGAGCAGCAGCTGCTGTGGCTGGGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103496 TTGGACACTGGCATGGGTCTGGGAGCAGCAGCTGCTGTGGCTGGGATTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    495 CTGCAGTGTGGTAGAACTAGTAAACAAATTGCGGGCACGAGCCCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103546 CTGCAGTGTGGTAGAACTAGTAAACAAATTGCGGGCACGAGCCCAAGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    545 GCAACTTGGACCAAAGCGGCACCAATGTAGCAAAGGTGATGAAGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103596 GCAACTTGGACCAAAGCGGCACCAATGTAGCAAAGGTGATGAAGGAGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595 GTGGGTGGGAACACACCCAATGTTCTTACCTTAGTTGACAATTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103646 GTGGGTGGGAACACACCCAATGTTCTTACCTTAGTTGACAATTGGTACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    645 AGTCACACAAGGGATTGGGAGGAACATCCGTGCCATCAGACGAGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103696 AGTCACACAAGGGATTGGGAGGAACATCCGTGCCATCAGACGAGCCAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695 CCAACCCTCAGTTAGGAGCGTATGCCCCACCCCCGCATGTCATTGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103746 CCAACCCTCAGTTAGGAGCGTATGCCCCACCCCCGCATGTCATTGGGCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745 ATCTCAGCTGAAGGCGGTGAACAGGTTGAGAGGGTTGTTGAAGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103796 ATCTCAGCTGAAGGCGGTGAACAGGTTGAGAGGGTTGTTGAAGGCCCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795 CCAGGCAATGAGCAGAGGAACCATGATCGTGGGTGCAGCCACTGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103846 CCAGGCAATGAGCAGAGGAACCATGATCGTGGGTGCAGCCACTGGAGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    845 TCTTGCTTCTGCTGGATGTGGTCAGCCTTGCATATGAGTCAAAGCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103896 TCTTGCTTCTGCTGGATGTGGTCAGCCTTGCATATGAGTCAAAGCACTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895 CTTGAGGGGGCAAAGTCAGAGTCAGCTGAGGAGCTGAAGAAGCGGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103946 CTTGAGGGGGCAAAGTCAGAGTCAGCTGAGGAGCTGAAGAAGCGGGCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    945 GGAGCTGGAGGGGAAGCTCAACTTTCTCACCAAGATCCATGAGATGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103996 GGAGCTGGAGGGGAAGCTCAACTTTCTCACCAAGATCCATGAGATGCTGC

   1000     .    :    .
    995 AGCCAGGCCAAGACCAA
        |||||||||||||||||
 104046 AGCCAGGCCAAGACCAA