seq1 = pF1KE6316.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KE6316/gi568815589r_101262431.tfa (gi568815589r:101262431_101471404), 208974 bp

>pF1KE6316 1254
>gi568815589r:101262431_101471404 (Chr9)

(complement)

1-466  (100001-100466)   99% ->
467-669  (103083-103285)   100% ->
670-1254  (108390-108974)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCAGTTGACAGCTACCCCTGTGAGTGCACTTGTTGATGAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCAGTTGACAGCTACCCCTGTGAGTGCACTTGTTGATGAGCCAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCATATCCAAGCTACAGGCCTGATTCCCTTTCAGATGGTGAGTTTTCAGG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCATATCCGAGCTACAGGCCTGATTCCCTTTCAGATGGTGAGTTTTCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATCACTGGAAGATGAAAACGGAGACATGTTTTATTCTCAAGCCCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATCACTGGAAGATGAAAACGGAGACATGTTTTATTCTCAAGCCCACTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGGCCAATGAATTCGGTGAGGTGGACCTGAATCATGCTTCTTCACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGGCCAATGAATTCGGTGAGGTGGACCTGAATCATGCTTCTTCACTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGGGATTATATGGGAGTCCACCCCATGGGTCTCTTCTGGTCTCTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGGGATTATATGGGAGTCCACCCCATGGGTCTCTTCTGGTCTCTGAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAAAAGCTATTAACAAGACTGTTGAAAAGAGATGTGATGAATAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAAAAGCTATTAACAAGACTGTTGAAAAGAGATGTGATGAATAGGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCAGGTCCAAGTAAAACTTTATGACTTAGAGTTAATAGTGAACAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCAGGTCCAAGTAAAACTTTATGACTTAGAGTTAATAGTGAACAATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTTGCCAGTGCTCCAAAGGCCAGCCTGACTTTGGAGAGGTGGTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTTGCCAGTGCTCCAAAGGCCAGCCTGACTTTGGAGAGGTGGTATGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACCTGGTGTCACACGAATTAAGGTTCGAGAAGGCCGCCTTCGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACCTGGTGTCACACGAATTAAGGTTCGAGAAGGCCGCCTTCGAGGAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTTTCTCCCTCCAG         GAGAGGGTCTCTTCCCAGGGGTAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTTTCTCCCTCCAGGTG...CAGGAGAGGGTCTCTTCCCAGGGGTAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGATTTGTTTGGTGGTTTGGGTGGGCTGCTTGAATTTCGGGCCAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103108 TGATTTGTTTGGTGGTTTGGGTGGGCTGCTTGAATTTCGGGCCAGCCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TAGCCAGTCGTGGCTTCGCCTCCTTGGCCTTGGCTTACCATAACTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103158 TAGCCAGTCGTGGCTTCGCCTCCTTGGCCTTGGCTTACCATAACTATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GACCTGCCCCGCAAACCAGAAGTAACAGATTTGGAATATTTTGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103208 GACCTGCCCCGCAAACCAGAAGTAACAGATTTGGAATATTTTGAGGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGCCAACTTTCTCCTGAGACATCCAAAG         GTCTTTGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103258 TGCCAACTTTCTCCTGAGACATCCAAAGGTA...CAGGTCTTTGGCTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCGTTGGGGTAGTCTCTGTATGTCAAGGAGTACAGATTGGACTATCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108403 GCGTTGGGGTAGTCTCTGTATGTCAAGGAGTACAGATTGGACTATCTATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCTATTTACCTAAAGCAAGTCACAGCCACGGTACTTATTAATGGGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108453 GCTATTTACCTAAAGCAAGTCACAGCCACGGTACTTATTAATGGGACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTTTCCTTTTGGCATTCCACAGGTATATCATGGTCAGATCCATCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108503 CTTTCCTTTTGGCATTCCACAGGTATATCATGGTCAGATCCATCAGCCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TTCCCCATTCTGCACAATTAATATCCACCAATGCCTTGGGGTTACTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108553 TTCCCCATTCTGCACAATTAATATCCACCAATGCCTTGGGGTTACTAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTCTATCGCACTTTTGAGACAACTCAAGTTGGGGCCAGTCAATATTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108603 CTCTATCGCACTTTTGAGACAACTCAAGTTGGGGCCAGTCAATATTTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TCCTATTGAAGAGGCCCAGGGGCAATTCCTCTTCATTGTAGGAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108653 TCCTATTGAAGAGGCCCAGGGGCAATTCCTCTTCATTGTAGGAGAAGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATAAGACTATCAACAGCAAAGCACACGCTGAACAAGCCATAGGACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108703 ATAAGACTATCAACAGCAAAGCACACGCTGAACAAGCCATAGGACAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGAGACATGGGAAGAACAACTGGACCCTGCTATCTTACCCTGGGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108753 AAGAGACATGGGAAGAACAACTGGACCCTGCTATCTTACCCTGGGGCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CCACCTGATAGAACCTCCCTATTCTCCTCTGTGCTGTGCCTCAACGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108803 CCACCTGATAGAACCTCCCTATTCTCCTCTGTGCTGTGCCTCAACGACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACGATTTGAGGTTACACTGGGGAGGAGAGGTGATCCCACACGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108853 ACGATTTGAGGTTACACTGGGGAGGAGAGGTGATCCCACACGCAGCTGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CAGGAACATGCTTGGAAGGAGATCCAGAGATTTCTCAGGAAGCACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108903 CAGGAACATGCTTGGAAGGAGATCCAGAGATTTCTCAGGAAGCACCTCAT

   1250     .    :    .    :
   1233 TCCAGATGTGACCAGTCAACTC
        ||||||||||||||||||||||
 108953 TCCAGATGTGACCAGTCAACTC