seq1 = pF1KE6292.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KE6292/gi568815593r_141202963.tfa (gi568815593r:141202963_141403865), 200903 bp

>pF1KE6292 903
>gi568815593r:141202963_141403865 (Chr5)

(complement)

1-903  (100001-100903)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTCCGGTCCTGGCATCCAAGCCGCCATCGACCTCACAGCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTCCGGTCCTGGCATCCAAGCCGCCATCGACCTCACAGCGGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCAGGGGGGACAGCGTGTGTACTGACTGGGCAGCCCTTCGACACAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCAGGGGGGACAGCGTGTGTACTGACTGGGCAGCCCTTCGACACAATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGAAGATGCAGACGTTCCCTGACCTGTACAAGGGCCTCACCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTGAAGATGCAGACGTTCCCTGACCTGTACAAGGGCCTCACCGACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCTGAAGACATACGCTCAAGTGGGTCTCCGGGGCTTCTACAAGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCTGAAGACATACGCTCAAGTGGGTCTCCGGGGCTTCTACAAGGGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCCCGGCACTTATGGCCTACGTCGCCGAAAACTCGGTCCTCTTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCCCGGCACTTATGGCCTACGTCGCCGAAAACTCGGTCCTCTTCATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTACGGGTTCTGCCAGCAGTTTGTCAGGAAAGTGGCTGGAATGGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTACGGGTTCTGCCAGCAGTTTGTCAGGAAAGTGGCTGGAATGGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGCAAAGCTGAGTGATCTCCAGACTGCAGCCGCGGGGTCCTTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGCAAAGCTGAGTGATCTCCAGACTGCAGCCGCGGGGTCCTTCGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCATTTGCTGCACTGGCTCTCTGCCCCACTGAGCTTGTGAAGTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCATTTGCTGCACTGGCTCTCTGCCCCACTGAGCTTGTGAAGTGCCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACAGACCATGTATGAAATGGAGATGTCAGGGAAGATAGCAAAAAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TACAGACCATGTATGAAATGGAGATGTCAGGGAAGATAGCAAAAAGCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AATACAATTTGGTCTGTCGTGAAGGGTATCCTTAAAAAGGATGGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AATACAATTTGGTCTGTCGTGAAGGGTATCCTTAAAAAGGATGGCCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCTTCTACCATGGACTCTCGAGTACTCTACTTCAAGAAGTACCGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCTTCTACCATGGACTCTCGAGTACTCTACTTCAAGAAGTACCGGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTTCTTTTTCTTTGGTGGCTATGAACTGAGCCGATCGTTTTTTGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTTCTTTTTCTTTGGTGGCTATGAACTGAGCCGATCGTTTTTTGCGTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGAGATCAAAAGATGAACTAGGCCCTGTCCATTTGATGTTAAGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGAGATCAAAAGATGAACTAGGCCCTGTCCATTTGATGTTAAGTGGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGTTGCTGGAATTTGCCTGTGGCTTGTCGTGTTCCCAGTGGATTGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGTTGCTGGAATTTGCCTGTGGCTTGTCGTGTTCCCAGTGGATTGTATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AATCCAGAATTCAAGTTCTTTCCATGTATGGGAAACAGGCAGGATTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AATCCAGAATTCAAGTTCTTTCCATGTATGGGAAACAGGCAGGATTTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTACCCTCTTAAGTGTTGTGAGAAATGAAGGAATAGTAGCCTTATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTACCCTCTTAAGTGTTGTGAGAAATGAAGGAATAGTAGCCTTATATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGACTGAAAGCTACTATGATTCGAGCAATCCCTGCCAATGGGGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGACTGAAAGCTACTATGATTCGAGCAATCCCTGCCAATGGGGCACTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTGTGGCCTACGAATACAGCAGGAAGATGATGATGAAACAGTTGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTGTGGCCTACGAATACAGCAGGAAGATGATGATGAAACAGTTGGAAGCA

    900 
    901 TAC
        |||
 100901 TAC