seq1 = pF1KE6266.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KE6266/gi568815579r_50806937.tfa (gi568815579r:50806937_51010738), 203802 bp

>pF1KE6266 762
>gi568815579r:50806937_51010738 (Chr19)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-224  (101325-101487)   99% ->
225-475  (101910-102160)   99% ->
476-612  (102244-102380)   100% ->
613-762  (103653-103802)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACAGCAGGAAATCCCTGGGGCTGGTTCCTGGGGTACCTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACAGCAGGAAATCCCTGGGGCTGGTTCCTGGGGTACCTCATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGTGTCGCAG         GATCTCTCGTCTCTGGTAGCTGCAGCCAAA
        |||||||||||>>>...>>>|||| |||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGTGTCGCAGGTA...CAGGATCGCTCGTCTCTGGTAGCTGCAGCCAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATAAACGGCGAGGACTGCAGCCCGCACTCGCAGCCCTGGCAGGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101355 TCATAAACGGCGAGGACTGCAGCCCGCACTCGCAGCCCTGGCAGGCGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGTCATGGAAAACGAATTGTTCTGCTCGGGCGTCCTGGTGCATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101405 CTGGTCATGGAAAACGAATTGTTCTGCTCGGGCGTCCTGGTGCATCCGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGGGTGCTGTCAGCCGCACACTGTTTCCAGAA         CTCCTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101455 GTGGGTGCTGTCAGCCGCACACTGTTTCCAGAAGTG...CAGCTCCTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCATCGGGCTGGGCCTACACAGTCTTGAGGCCGACCAAGAGCCAGGGAGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101918 CCATCGGGCTGGGCCTGCACAGTCTTGAGGCCGACCAAGAGCCAGGGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGATGGTGGAGGCCAGCCTCTCCGTACGGCACCCAGAGTACAACAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101968 CAGATGGTGGAGGCCAGCCTCTCCGTACGGCACCCAGAGTACAACAGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGCTCGCTAACGACCTCATGCTCATCAAGTTGGACGAATCCGTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102018 CTTGCTCGCTAACGACCTCATGCTCATCAAGTTGGACGAATCCGTGTCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTCTGACACCATCCGGAGCATCAGCATTGCTTCGCAGTGCCCTACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102068 AGTCTGACACCATCCGGAGCATCAGCATTGCTTCGCAGTGCCCTACCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGAACTCTTGCCTCGTTTCTGGCTGGGGTCTGCTGGCGAACG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102118 GGGAACTCTTGCCTCGTTTCTGGCTGGGGTCTGCTGGCGAACGGTG...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   GCAGAATGCCTACCGTGCTGCAGTGCGTGAACGTGTCGGTGGTGTCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102242 AGGCAGAATGCCTACCGTGCTGCAGTGCGTGAACGTGTCGGTGGTGTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGGTCTGCAGTAAGCTCTATGACCCGCTGTACCACCCCAGCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102292 AGGAGGTCTGCAGTAAGCTCTATGACCCGCTGTACCACCCCAGCATGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCGCCGGCGGAGGGCAAGACCAGAAGGACTCCTGCAAC         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102342 TGCGCCGGCGGAGGGCAAGACCAGAAGGACTCCTGCAACGTG...CAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGACTCTGGGGGGCCCCTGATCTGCAACGGGTACTTGCAGGGCCTTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103655 TGACTCTGGGGGGCCCCTGATCTGCAACGGGTACTTGCAGGGCCTTGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTTTCGGAAAAGCCCCGTGTGGCCAAGTTGGCGTGCCAGGTGTCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103705 CTTTCGGAAAAGCCCCGTGTGGCCAAGTTGGCGTGCCAGGTGTCTACACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    715 AACCTCTGCAAATTCACTGAGTGGATAGAGAAAACCGTCCAGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103755 AACCTCTGCAAATTCACTGAGTGGATAGAGAAAACCGTCCAGGCCAGT